MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA01

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019428	AAG	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019428	TAA	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019428	CA	3	6	184	189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019428	A	6	6	236	241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019428	TTTAC	2	10	4836	4845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019428	AAG	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019428	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019428	TA	3	6	5296	5301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019428	ATT	2	6	5318	5323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019428	GAT	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019428	GAT	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019428	CTTG	2	8	5522	5529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019428	T	6	6	5577	5582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019428	TA	3	6	5643	5648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019428	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019428	GTT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019428	T	6	6	7341	7346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019428	GGT	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019428	ATC	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019428	GTA	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019428	TAAA	2	8	7690	7697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019428	ATC	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019428	A	6	6	7742	7747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019428	GAT	2	6	7777	7782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019428	CAA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019428	A	7	7	7896	7902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019428	CAA	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019428	GAA	2	6	7988	7993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019428	CCT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019428	CAA	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019428	TAA	2	6	8466	8471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019428	TAT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019428	ACT	2	6	9473	9478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019428	CAAA	2	8	9486	9493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019428	ATC	2	6	9567	9572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019428	GAA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019428	ATAA	2	8	10104	10111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019428	T	6	6	10153	10158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019428	TA	3	6	10161	10166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019428	A	6	6	10196	10201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019428	CTAT	2	8	11893	11900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019428	TTTTC	2	10	11985	11994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019428	TAG	2	6	12008	12013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019428	CCA	2	6	12022	12027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019428	CAG	2	6	12213	12218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019428	GAG	2	6	12243	12248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019428	CAA	2	6	12810	12815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019428	TGC	2	6	12823	12828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019428	TAT	2	6	13177	13182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019428	ATA	2	6	13186	13191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019428	TAT	2	6	13235	13240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019428	TTA	2	6	13248	13253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019428	AT	3	6	13271	13276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019428	TAA	2	6	13313	13318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019428	TTC	2	6	13356	13361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019428	TTA	2	6	14388	14393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019428	TAA	2	6	14434	14439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019428	TA	3	6	14473	14478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019428	TCC	2	6	14490	14495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019428	GAA	2	6	14559	14564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019428	ACA	2	6	14697	14702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019428	ATC	2	6	14798	14803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019428	AAG	2	6	14813	14818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019428	CT	3	6	14834	14839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019428	CAG	2	6	14846	14851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019428	TTTG	2	8	14934	14941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019428	AGG	2	6	14987	14992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019428	AGC	2	6	15047	15052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019428	TTC	2	6	15081	15086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019428	TC	3	6	15085	15090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019428	GAT	2	6	15211	15216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019428	AAAAT	2	10	15224	15233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019428	GA	4	8	15243	15250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019428	GGAA	2	8	15275	15282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019428	GA	3	6	15321	15326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019428	CTA	2	6	15338	15343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019428	CTT	2	6	15371	15376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019428	CAG	2	6	15389	15394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019428	ACT	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019428	ATA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019428	CATC	2	8	15467	15474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019428	AGA	2	6	15994	15999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019428	ATT	2	6	18668	18673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019428	AG	3	6	18728	18733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019428	ATT	2	6	18738	18743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019428	AT	3	6	18776	18781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019428	CTG	2	6	18844	18849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019428	ATTTAT	2	12	22377	22388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019428	GCA	2	6	22407	22412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019428	TAC	2	6	22481	22486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019428	TTAT	2	8	22617	22624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019428	TAC	2	6	22626	22631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019428	AAC	2	6	22656	22661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019428	CTT	2	6	22684	22689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019428	CAAT	2	8	22707	22714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019428	A	7	7	22731	22737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019428	TAA	2	6	23102	23107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019428	GGT	2	6	24853	24858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019428	AGA	2	6	24870	24875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019428	GTT	2	6	24879	24884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019428	A	7	7	24894	24900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019428	GAT	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019428	AATGA	2	10	24934	24943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019428	AT	3	6	25090	25095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019428	A	6	6	25157	25162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019428	CAAG	2	8	25210	25217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019428	ATC	2	6	25250	25255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019428	TTA	2	6	25284	25289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019428	T	7	7	25295	25301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019428	AT	3	6	27028	27033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019428	AAAC	2	8	28477	28484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019428	C	6	6	28553	28558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_019428	ATT	2	6	28588	28593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019428	CTAAA	2	10	28608	28617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019428	CAAA	2	8	28669	28676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019428	ATG	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019428	ACA	2	6	31055	31060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019428	TATT	2	8	31089	31096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019428	T	6	6	31386	31391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019428	A	6	6	31428	31433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019428	ACT	2	6	31460	31465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019428	TAA	2	6	31762	31767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019428	A	6	6	31766	31771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019428	CCA	2	6	31772	31777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019428	TTG	2	6	31826	31831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019428	A	6	6	31852	31857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019428	AAG	2	6	31875	31880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019428	TCC	2	6	32268	32273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019428	A	7	7	32281	32287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019428	TTG	2	6	32316	32321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019428	AATT	2	8	32745	32752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019428	AATA	2	8	32761	32768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019428	A	6	6	33013	33018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019428	CAAAG	2	10	33045	33054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019428	ATTTA	2	10	33802	33811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019428	TAA	2	6	33835	33840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019428	A	8	8	33839	33846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019428	CTTG	2	8	34228	34235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019428	T	6	6	34283	34288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019428	TA	3	6	34349	34354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019428	CAT	2	6	35124	35129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019428	TTG	2	6	37663	37668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019428	CAAA	2	8	37721	37728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019428	A	8	8	38070	38077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019428	A	6	6	38583	38588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019428	TAA	2	6	38624	38629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019428	TTAT	2	8	38659	38666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019428	CAA	2	6	39260	39265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019428	ATTA	2	8	39407	39414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019428	A	6	6	39984	39989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019428	A	7	7	40032	40038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_019428	AAC	3	9	43473	43481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_019428	GTT	2	6	46093	46098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_019428	AGG	2	6	46239	46244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_019428	A	6	6	73156	73161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019428	TCTT	2	8	73191	73198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_019428	TAA	2	6	73247	73252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_019428	A	6	6	79631	79636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.