MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 1460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	AGT	2	6	4400	4405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018644	ATA	2	6	4409	4414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018644	AT	3	6	4442	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018644	ACA	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018644	TAAAAA	2	12	12047	12058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018644	ATAA	2	8	12092	12099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018644	CCTCT	2	10	13174	13183	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018644	TAT	2	6	13211	13216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018644	TTTA	2	8	15064	15071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018644	AT	3	6	18561	18566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018644	TATT	2	8	18569	18576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018644	AG	3	6	20849	20854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018644	GAT	2	6	31553	31558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018644	ATT	2	6	35560	35565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018644	TA	4	8	35573	35580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018644	TTAC	2	8	35588	35595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018644	AT	3	6	38136	38141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018644	T	6	6	38196	38201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018644	AAT	2	6	38202	38207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018644	AAT	2	6	39588	39593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018644	TAC	2	6	39598	39603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018644	AT	3	6	39612	39617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018644	ATT	2	6	39620	39625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018644	AAGA	2	8	40580	40587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018644	A	8	8	40597	40604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018644	A	6	6	40633	40638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018644	AG	3	6	40667	40672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018644	ATTA	2	8	44816	44823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018644	T	7	7	50113	50119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018644	A	6	6	50377	50382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018644	A	6	6	51568	51573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018644	TCC	2	6	52757	52762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018644	TCT	2	6	56136	56141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018644	GAT	2	6	56183	56188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018644	GATT	2	8	56433	56440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018644	A	8	8	56444	56451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018644	AGTT	2	8	59716	59723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018644	T	7	7	63144	63150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018644	TAAT	2	8	67509	67516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018644	TTA	2	6	67963	67968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018644	AGG	2	6	67998	68003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018644	TAA	2	6	68031	68036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018644	CTCTT	2	10	68052	68061	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018644	A	6	6	68074	68079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018644	TAT	2	6	68149	68154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018644	T	8	8	69085	69092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018644	T	6	6	69099	69104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018644	TAC	2	6	71197	71202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018644	A	8	8	71209	71216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018644	T	8	8	71219	71226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018644	AAT	2	6	71229	71234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018644	AT	5	10	73274	73283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018644	AAAG	2	8	73675	73682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018644	TAT	2	6	78385	78390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018644	TCC	2	6	79424	79429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018644	TTATAA	2	12	79430	79441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018644	AAT	2	6	80022	80027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018644	ATT	2	6	80083	80088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018644	T	7	7	80087	80093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018644	AAT	2	6	84470	84475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018644	ATT	2	6	84495	84500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018644	T	6	6	85361	85366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018644	ATTA	2	8	85397	85404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018644	A	6	6	85408	85413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018644	T	6	6	85441	85446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018644	TTAA	2	8	87184	87191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018644	A	9	9	91552	91560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018644	T	6	6	91583	91588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018644	TATT	2	8	93581	93588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018644	TA	3	6	93627	93632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018644	ATA	2	6	93666	93671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018644	AAT	2	6	93704	93709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018644	ATT	2	6	93712	93717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018644	TAT	2	6	93720	93725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018644	AACA	2	8	94330	94337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018644	ATT	2	6	97896	97901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018644	A	6	6	99918	99923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018644	TC	3	6	99929	99934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018644	A	7	7	102237	102243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018644	AT	3	6	103465	103470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018644	A	7	7	103481	103487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018644	A	7	7	103540	103546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018644	AGA	2	6	103592	103597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018644	AGA	2	6	103602	103607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018644	AGT	2	6	103608	103613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018644	ATT	2	6	103618	103623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018644	AAT	2	6	104116	104121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018644	T	6	6	105141	105146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018644	ATAA	2	8	106138	106145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018644	TCTT	2	8	106146	106153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018644	TA	3	6	106169	106174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018644	AAT	2	6	106178	106183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018644	T	6	6	106925	106930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018644	A	8	8	106931	106938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018644	CTTA	2	8	106987	106994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018644	TCC	2	6	106998	107003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018644	TA	3	6	107047	107052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018644	TTA	2	6	107070	107075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018644	TTAT	2	8	112754	112761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018644	AAATTG	2	12	112762	112773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018644	ACC	2	6	113896	113901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018644	TAAT	2	8	113964	113971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018644	A	7	7	113974	113980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018644	A	7	7	113982	113988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018644	TATT	2	8	114457	114464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018644	TA	3	6	114486	114491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018644	TA	3	6	114503	114508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018644	A	9	9	116988	116996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018644	T	8	8	117011	117018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018644	AT	3	6	118082	118087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018644	T	9	9	118120	118128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018644	AGG	2	6	118131	118136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018644	AAT	2	6	128228	128233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018644	GTG	2	6	128242	128247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018644	CAT	2	6	130565	130570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018644	TA	3	6	131432	131437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018644	CTA	2	6	131438	131443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018644	CTA	2	6	131456	131461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018644	AGT	2	6	132846	132851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018644	TAA	2	6	134537	134542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018644	A	8	8	134579	134586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018644	AAG	2	6	134594	134599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018644	GA	4	8	134601	134608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018644	A	8	8	134630	134637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018644	AAT	2	6	134650	134655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018644	C	6	6	135798	135803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_018644	AAC	2	6	135842	135847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018644	TAT	2	6	136577	136582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018644	TTCC	2	8	136585	136592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018644	A	6	6	139227	139232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018644	A	7	7	139766	139772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018644	A	6	6	139778	139783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018644	TAAA	2	8	140320	140327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018644	ATT	2	6	140338	140343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018644	TTATA	2	10	143509	143518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018644	TTA	2	6	147079	147084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018644	AAC	2	6	147100	147105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018644	TATC	2	8	147113	147120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018644	TAT	2	6	147143	147148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018644	T	6	6	147156	147161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018644	AT	3	6	147177	147182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018644	AAG	2	6	147199	147204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018644	ATA	2	6	147222	147227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018644	AGG	2	6	147233	147238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018644	TTA	2	6	147261	147266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018644	TCC	2	6	147348	147353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_018644	CTT	2	6	147372	147377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018644	ACC	2	6	150354	150359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_018644	T	6	6	150383	150388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018644	A	8	8	155938	155945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018644	GCC	2	6	155957	155962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_018644	CTC	2	6	157567	157572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_018644	TAA	2	6	157583	157588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018644	CTT	2	6	157597	157602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018644	A	7	7	157630	157636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018644	TTA	2	6	157647	157652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018644	A	6	6	157662	157667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018644	TTA	2	6	157719	157724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018644	TAA	2	6	157725	157730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018644	TTAAA	2	10	159622	159631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018644	TTA	2	6	162293	162298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018644	TA	3	6	162297	162302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018644	AAT	2	6	162307	162312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018644	TACT	2	8	164248	164255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_018644	A	7	7	165960	165966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_018644	TAA	2	6	167052	167057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_018644	TA	4	8	169175	169182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_018644	T	6	6	181103	181108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_018644	TA	3	6	185025	185030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018644	TAAA	2	8	185035	185042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018644	T	7	7	188863	188869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018644	AAT	2	6	188901	188906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018644	AATTAA	2	12	188979	188990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018644	TTA	2	6	188991	188996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_018644	CTTAT	2	10	225939	225948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_018644	A	6	6	246398	246403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018644	TAT	2	6	246405	246410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018644	AAT	2	6	246434	246439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018644	A	6	6	246452	246457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018644	ATT	2	6	246482	246487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_018644	A	10	10	257137	257146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_018644	CTT	2	6	260332	260337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_018644	T	7	7	260371	260377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018644	T	9	9	260427	260435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018644	GGT	2	6	260513	260518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_018644	AG	4	8	262894	262901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018644	AGG	2	6	262962	262967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018644	ATTT	2	8	264062	264069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018644	TTAA	2	8	264073	264080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018644	TAT	2	6	264103	264108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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