MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 1449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018643	TAAAA	2	10	1014543	1014552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018643	A	8	8	1014549	1014556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018643	ATTT	3	12	1014590	1014601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018643	TAA	2	6	1014658	1014663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018643	A	6	6	1014677	1014682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018643	AT	3	6	1014750	1014755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018643	A	7	7	1014782	1014788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018643	AATA	2	8	1017438	1017445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018643	T	8	8	1017457	1017464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018643	AAGT	2	8	1017465	1017472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018643	ACTA	2	8	1017636	1017643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_018643	AAATA	2	10	1017644	1017653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018643	ATT	2	6	1017664	1017669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018643	AT	3	6	1017679	1017684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018643	TTA	2	6	1021520	1021525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018643	AAT	2	6	1021544	1021549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018643	A	6	6	1021559	1021564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018643	TTA	2	6	1022249	1022254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018643	A	12	12	1022272	1022283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018643	TAAA	2	8	1022292	1022299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018643	TTTA	2	8	1022339	1022346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018643	ATA	2	6	1022351	1022356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018643	A	7	7	1022366	1022372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018643	GAAA	2	8	1022411	1022418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018643	A	11	11	1022416	1022426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018643	ATA	2	6	1023588	1023593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018643	T	7	7	1023616	1023622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018643	T	6	6	1023629	1023634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018643	T	8	8	1023643	1023650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018643	AT	3	6	1030713	1030718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018643	AGTA	3	12	1033696	1033707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018643	AT	3	6	1033721	1033726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018643	TA	5	10	1033729	1033738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018643	A	12	12	1038827	1038838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018643	T	8	8	1038842	1038849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018643	T	6	6	1038887	1038892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018643	AT	3	6	1038893	1038898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018643	GAATT	2	10	1038900	1038909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018643	AAAT	2	8	1038964	1038971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018643	T	10	10	1038977	1038986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018643	A	8	8	1038993	1039000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018643	ATT	2	6	1039051	1039056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018643	T	6	6	1042941	1042946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018643	TAAT	2	8	1042958	1042965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018643	A	7	7	1042975	1042981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018643	AT	3	6	1043001	1043006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018643	TTC	2	6	1043023	1043028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_018643	T	12	12	1043037	1043048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018643	AAT	2	6	1043084	1043089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018643	AAT	2	6	1047152	1047157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018643	T	11	11	1047162	1047172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018643	T	6	6	1047175	1047180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018643	AAT	2	6	1047182	1047187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018643	TATT	2	8	1047210	1047217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018643	TAA	2	6	1047240	1047245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018643	T	8	8	1047273	1047280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018643	AAATC	2	10	1047282	1047291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_018643	TTA	2	6	1047506	1047511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018643	T	7	7	1047535	1047541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018643	GTG	2	6	1047623	1047628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018643	GAA	2	6	1047648	1047653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_018643	CTC	2	6	1047791	1047796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_018643	TTC	2	6	1047801	1047806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018643	ACG	2	6	1047840	1047845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_018643	TGA	2	6	1047920	1047925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018643	ACC	2	6	1048035	1048040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_018643	ACGA	2	8	1048117	1048124	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_018643	CCA	2	6	1048198	1048203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_018643	CCT	2	6	1048312	1048317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_018643	GCC	2	6	1048528	1048533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_018643	CTA	2	6	1048692	1048697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_018643	CAT	2	6	1048750	1048755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1076	NC_018643	ATG	2	6	1048816	1048821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018643	GAA	2	6	1049011	1049016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_018643	CTT	2	6	1049025	1049030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_018643	GCT	2	6	1049242	1049247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_018643	TGG	2	6	1049321	1049326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018643	GTCT	2	8	1049369	1049376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_018643	GAA	2	6	1049380	1049385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018643	TTA	2	6	1049407	1049412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018643	TATT	2	8	1049468	1049475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018643	TTGG	2	8	1049524	1049531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018643	TCC	2	6	1049587	1049592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_018643	GCTT	2	8	1049714	1049721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_018643	GGT	2	6	1049900	1049905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018643	T	7	7	1050018	1050024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018643	TCGC	2	8	1050051	1050058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_018643	ACT	2	6	1050060	1050065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018643	GTG	2	6	1050168	1050173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018643	TACA	2	8	1050208	1050215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_018643	A	7	7	1050311	1050317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018643	TTTG	2	8	1050337	1050344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018643	AAC	2	6	1050359	1050364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018643	GATATT	2	12	1050385	1050396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_018643	T	6	6	1050402	1050407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018643	TGG	2	6	1050435	1050440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018643	CCT	2	6	1050465	1050470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_018643	C	6	6	1050506	1050511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1103	NC_018643	TGG	2	6	1050521	1050526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018643	AAG	2	6	1050623	1050628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018643	ATT	2	6	1050660	1050665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018643	AAAT	2	8	1050674	1050681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018643	AGG	2	6	1050701	1050706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018643	GT	3	6	1050832	1050837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018643	TGT	2	6	1050977	1050982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018643	GT	3	6	1051000	1051005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018643	TCC	2	6	1051051	1051056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_018643	ATG	2	6	1051095	1051100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018643	CACGA	2	10	1051150	1051159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_018643	GAC	2	6	1051163	1051168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_018643	GCA	2	6	1051175	1051180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_018643	CCGAA	2	10	1051197	1051206	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_018643	CGA	2	6	1051228	1051233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_018643	ACT	2	6	1051290	1051295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_018643	GT	3	6	1051354	1051359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018643	AAAT	2	8	1051384	1051391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018643	AC	3	6	1051404	1051409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_018643	TTCT	2	8	1051514	1051521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_018643	CAC	2	6	1051624	1051629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_018643	ACC	2	6	1051641	1051646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_018643	GCT	2	6	1051705	1051710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_018643	CTT	2	6	1051730	1051735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_018643	CGA	2	6	1051761	1051766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_018643	CTT	2	6	1051789	1051794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_018643	TCC	2	6	1051824	1051829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_018643	CTG	2	6	1051848	1051853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_018643	ATC	2	6	1051898	1051903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_018643	CAA	2	6	1051951	1051956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1134	NC_018643	GCC	2	6	1052131	1052136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1406	NC_018643	TC	4	8	1284607	1284614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1407	NC_018643	GTTA	2	8	1284618	1284625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_018643	A	6	6	1284711	1284716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_018643	AT	3	6	1287900	1287905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_018643	TTA	2	6	1290969	1290974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_018643	A	6	6	1290994	1290999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_018643	A	6	6	1294866	1294871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_018643	A	6	6	1296439	1296444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_018643	A	8	8	1296458	1296465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_018643	ATTT	2	8	1298252	1298259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_018643	AT	3	6	1300466	1300471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_018643	A	6	6	1302950	1302955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_018643	A	7	7	1303009	1303015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_018643	TAAAA	2	10	1303068	1303077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_018643	T	6	6	1306238	1306243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_018643	TTTA	2	8	1308973	1308980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_018643	AAT	2	6	1309013	1309018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_018643	TA	4	8	1309033	1309040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_018643	TTTTAA	2	12	1310752	1310763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_018643	CATA	2	8	1311145	1311152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1426	NC_018643	TAT	2	6	1311165	1311170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_018643	TTA	2	6	1311201	1311206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_018643	AG	3	6	1311228	1311233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_018643	TAAAA	2	10	1311255	1311264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_018643	ATA	2	6	1311265	1311270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_018643	TA	3	6	1315395	1315400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_018643	T	7	7	1325546	1325552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_018643	AAT	2	6	1325553	1325558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_018643	CAAC	2	8	1325564	1325571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1435	NC_018643	TCAA	2	8	1325606	1325613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1436	NC_018643	TCT	2	6	1325646	1325651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_018643	TAAC	2	8	1328293	1328300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1438	NC_018643	TTAA	2	8	1333098	1333105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_018643	G	8	8	1334314	1334321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_018643	C	6	6	1334328	1334333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1441	NC_018643	T	6	6	1334334	1334339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_018643	ATT	2	6	1334345	1334350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_018643	ATT	2	6	1334362	1334367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_018643	GACA	2	8	1337856	1337863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_018643	ATTT	2	8	1337873	1337880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_018643	TTAT	2	8	1341319	1341326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_018643	TAT	2	6	1341343	1341348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_018643	GCA	2	6	1341354	1341359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_018643	CTG	2	6	1341447	1341452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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