MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes finegoldii DSM 17242 chromosome

Total Repeats: 11119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018011	CGC	2	6	3661098	3661103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_018011	GGC	3	9	3661125	3661133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_018011	CGA	2	6	3661170	3661175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_018011	CTTA	2	8	3663058	3663065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11005	NC_018011	TA	3	6	3663064	3663069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_018011	T	6	6	3665093	3665098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_018011	T	6	6	3665115	3665120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_018011	TCG	2	6	3665181	3665186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_018011	T	7	7	3665219	3665225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_018011	A	6	6	3665231	3665236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_018011	GAG	2	6	3665237	3665242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_018011	T	7	7	3671596	3671602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_018011	AGAGGA	2	12	3671615	3671626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_018011	CA	3	6	3671636	3671641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_018011	TTC	2	6	3673892	3673897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_018011	ATT	2	6	3673913	3673918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_018011	ATTT	2	8	3673943	3673950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_018011	CCGA	2	8	3673991	3673998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11019	NC_018011	A	7	7	3674014	3674020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_018011	A	7	7	3674045	3674051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_018011	ACGA	2	8	3674207	3674214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11022	NC_018011	T	7	7	3674242	3674248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_018011	AACA	2	8	3674255	3674262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_018011	CAA	2	6	3676571	3676576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_018011	A	6	6	3677816	3677821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_018011	TTA	2	6	3679285	3679290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_018011	ACA	3	9	3680549	3680557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_018011	TGC	2	6	3680566	3680571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_018011	TTGTC	2	10	3680579	3680588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11030	NC_018011	A	6	6	3682099	3682104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_018011	AAT	2	6	3682179	3682184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_018011	GCC	2	6	3682189	3682194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_018011	CGG	2	6	3683005	3683010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_018011	GACGG	2	10	3683012	3683021	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11035	NC_018011	GCC	2	6	3683096	3683101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_018011	AG	3	6	3683137	3683142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_018011	CT	3	6	3683160	3683165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_018011	GCA	2	6	3684526	3684531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_018011	A	6	6	3684544	3684549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_018011	T	6	6	3685565	3685570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_018011	GTT	2	6	3686052	3686057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_018011	CTT	2	6	3689879	3689884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_018011	AGGG	2	8	3691257	3691264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_018011	A	6	6	3691275	3691280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_018011	GC	3	6	3691291	3691296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_018011	AC	3	6	3694876	3694881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_018011	AT	3	6	3695884	3695889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_018011	A	6	6	3695894	3695899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_018011	TTC	2	6	3696688	3696693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_018011	ATA	2	6	3696707	3696712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_018011	ATT	2	6	3696860	3696865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_018011	AT	3	6	3696907	3696912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_018011	AC	3	6	3696934	3696939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_018011	TACA	2	8	3696967	3696974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_018011	ATTT	2	8	3697078	3697085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_018011	T	6	6	3697137	3697142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_018011	CT	4	8	3697149	3697156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_018011	T	7	7	3697156	3697162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_018011	TAT	2	6	3697179	3697184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11061	NC_018011	AAG	2	6	3697319	3697324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_018011	TCAA	2	8	3697422	3697429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_018011	ATA	2	6	3697434	3697439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_018011	AT	3	6	3700121	3700126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_018011	A	7	7	3700127	3700133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_018011	CAA	2	6	3700156	3700161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_018011	CA	3	6	3700227	3700232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_018011	TATT	2	8	3700274	3700281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_018011	GCC	2	6	3700294	3700299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11071	NC_018011	CGG	2	6	3700427	3700432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_018011	AGA	2	6	3710040	3710045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11084	NC_018011	ATA	2	6	3712341	3712346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_018011	CGC	2	6	3712355	3712360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_018011	CGC	2	6	3713399	3713404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_018011	TGACA	2	10	3713479	3713488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11088	NC_018011	A	6	6	3713492	3713497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_018011	GTCCG	2	10	3713506	3713515	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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11093	NC_018011	CG	3	6	3716577	3716582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_018011	TCCCG	2	10	3718358	3718367	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11095	NC_018011	ACA	2	6	3718399	3718404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_018011	CGG	2	6	3719870	3719875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_018011	A	8	8	3719926	3719933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_018011	A	6	6	3720964	3720969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_018011	CTT	2	6	3722433	3722438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_018011	AAC	2	6	3722458	3722463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_018011	TAA	2	6	3722474	3722479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_018011	TTC	2	6	3722510	3722515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_018011	CGG	2	6	3722553	3722558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_018011	TAT	2	6	3722591	3722596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_018011	CCG	2	6	3725400	3725405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11106	NC_018011	AAC	2	6	3730692	3730697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_018011	T	6	6	3730756	3730761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_018011	CA	3	6	3731124	3731129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_018011	AGCGG	2	10	3731130	3731139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11110	NC_018011	CCGCT	2	10	3731167	3731176	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11111	NC_018011	CG	3	6	3731227	3731232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11112	NC_018011	TCG	3	9	3731248	3731256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_018011	CTA	2	6	3732196	3732201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_018011	ATT	2	6	3734065	3734070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_018011	A	6	6	3734104	3734109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_018011	TAT	2	6	3734139	3734144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_018011	GTT	2	6	3734182	3734187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_018011	TA	4	8	3734192	3734199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_018011	A	7	7	3734199	3734205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.