MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Advenella kashmirensis WT001 plasmid pWTk445

Total Repeats: 278

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017965	TTG	2	6	48	53	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017965	TAC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017965	ATC	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017965	CAA	2	6	217	222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017965	TTGA	2	8	313	320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017965	AGA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017965	ACTT	2	8	397	404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017965	ATT	2	6	449	454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017965	CAGA	2	8	456	463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017965	TA	4	8	466	473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017965	ATT	2	6	480	485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017965	AT	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017965	ATA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017965	TAT	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017965	TAA	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017965	CAA	2	6	914	919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017965	A	7	7	951	957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017965	CTA	3	9	1021	1029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017965	GCG	2	6	1187	1192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017965	AT	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017965	CCA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017965	TGA	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017965	GGT	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017965	TTG	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017965	ACC	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017965	TCGAT	2	10	1396	1405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017965	CCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017965	CCT	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017965	A	6	6	1522	1527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017965	T	6	6	1544	1549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017965	TCA	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017965	AAT	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017965	ATT	2	6	1599	1604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017965	TTA	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017965	AAC	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017965	ATTT	2	8	1690	1697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017965	T	7	7	1704	1710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017965	CTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017965	TTA	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017965	TCTA	2	8	1777	1784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017965	ATT	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017965	TGC	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017965	GTTA	2	8	1854	1861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017965	TAGA	2	8	1951	1958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017965	AGC	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017965	ATA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017965	CAT	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017965	TCCG	2	8	2465	2472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017965	TAG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017965	TAA	2	6	8499	8504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017965	TTGT	2	8	9131	9138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017965	TGG	2	6	9174	9179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017965	ATCT	2	8	9232	9239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017965	CT	3	6	9256	9261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017965	ACT	2	6	9963	9968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017965	CGTC	2	8	10044	10051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017965	CAA	2	6	10099	10104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017965	T	10	10	11448	11457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017965	TGAAA	2	10	11469	11478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017965	GCTTT	2	10	11497	11506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017965	CATC	2	8	11558	11565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017965	TTAC	2	8	11698	11705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017965	TCAA	2	8	11741	11748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017965	GCAAGG	2	12	11757	11768	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017965	A	6	6	14494	14499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017965	GT	3	6	14529	14534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017965	T	6	6	14695	14700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017965	CATC	2	8	14701	14708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017965	AATG	2	8	19742	19749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017965	AATA	2	8	20285	20292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017965	T	6	6	23471	23476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017965	T	8	8	24359	24366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017965	ATT	2	6	24383	24388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017965	A	8	8	24396	24403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017965	TG	3	6	24424	24429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017965	GAT	2	6	26106	26111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017965	TCGCT	2	10	26136	26145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017965	CAA	2	6	26160	26165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017965	TGG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017965	CTT	2	6	26927	26932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017965	GAA	2	6	27045	27050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017965	TCT	2	6	27294	27299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017965	ACCC	2	8	27321	27328	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017965	CGGT	2	8	27339	27346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017965	CAT	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017965	AGT	2	6	27505	27510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017965	ATC	2	6	27554	27559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017965	CCT	2	6	27606	27611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017965	GCA	2	6	27682	27687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017965	TCA	2	6	27724	27729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017965	TTC	2	6	27758	27763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017965	ACAA	2	8	27917	27924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017965	TGT	2	6	28032	28037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017965	CCT	2	6	28038	28043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017965	ACG	2	6	28170	28175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017965	CCCG	2	8	28285	28292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017965	ACC	2	6	28358	28363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017965	TTG	2	6	28435	28440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017965	GTT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017965	T	6	6	28483	28488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017965	GAT	2	6	28489	28494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017965	AAAG	3	12	28756	28767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017965	AAC	2	6	28813	28818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017965	GTC	2	6	29042	29047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017965	AGC	2	6	29090	29095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017965	CCT	2	6	29646	29651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017965	A	8	8	30011	30018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017965	CTG	2	6	30062	30067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017965	TGT	2	6	30075	30080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017965	CT	3	6	30083	30088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017965	CCT	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017965	TG	3	6	30118	30123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017965	CGT	2	6	30125	30130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017965	ATG	2	6	30184	30189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017965	TA	3	6	30295	30300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017965	AAT	2	6	31509	31514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017965	GCCA	2	8	31518	31525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017965	A	7	7	32891	32897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017965	ACTT	2	8	33480	33487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017965	CGC	2	6	33587	33592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017965	ATT	2	6	33637	33642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017965	GCC	2	6	33651	33656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017965	TAGTT	2	10	33807	33816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017965	CAA	2	6	33880	33885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017965	TAC	2	6	33888	33893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017965	ATG	2	6	34233	34238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017965	CATT	2	8	34255	34262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017965	AAAT	2	8	34331	34338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017965	GT	3	6	34359	34364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017965	ATT	2	6	34631	34636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017965	CTT	2	6	34659	34664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017965	TAA	2	6	34698	34703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017965	AAAT	2	8	34774	34781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017965	CGC	2	6	34806	34811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017965	TCCC	2	8	34870	34877	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017965	CTG	2	6	34907	34912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017965	TTA	2	6	35038	35043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017965	TTG	2	6	35072	35077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017965	T	8	8	35083	35090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017965	AT	3	6	35094	35099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017965	TA	3	6	35106	35111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017965	AG	3	6	35595	35600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017965	ACA	2	6	35740	35745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017965	GGC	2	6	35748	35753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017965	GCT	2	6	35754	35759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017965	GCC	2	6	35774	35779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017965	AT	3	6	36218	36223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017965	AAT	2	6	36302	36307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017965	GCCA	2	8	36375	36382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.