MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p2

Total Repeats: 2661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016618	GGA	2	6	864677	864682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016618	GAAC	2	8	866573	866580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_016618	CGG	2	6	869975	869980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_016618	C	6	6	870013	870018	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2505	NC_016618	AGG	2	6	870076	870081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016618	TCCT	2	8	872316	872323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_016618	GC	3	6	873072	873077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_016618	TC	3	6	873117	873122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_016618	CCGG	2	8	873558	873565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_016618	CGCC	2	8	873566	873573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2511	NC_016618	GGGC	2	8	874262	874269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2512	NC_016618	ATC	2	6	874281	874286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_016618	CCGG	2	8	876327	876334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_016618	GAC	2	6	876341	876346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_016618	GGC	3	9	879038	879046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_016618	CGA	2	6	880672	880677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_016618	CTG	2	6	880730	880735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_016618	TCG	2	6	880737	880742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_016618	AGA	2	6	880755	880760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016618	TGC	2	6	880776	880781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_016618	GCC	2	6	880782	880787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_016618	CAT	2	6	880822	880827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_016618	GCT	2	6	880867	880872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_016618	CCG	2	6	880911	880916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_016618	GCC	3	9	880925	880933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_016618	GC	3	6	880967	880972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_016618	GGC	2	6	881013	881018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_016618	GCT	2	6	881028	881033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_016618	CG	3	6	881083	881088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_016618	GACG	2	8	881182	881189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_016618	CGC	2	6	881190	881195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_016618	GCG	2	6	881201	881206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_016618	GCT	2	6	881220	881225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_016618	GAT	2	6	881287	881292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016618	CG	3	6	881302	881307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_016618	GCC	2	6	881332	881337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_016618	CGG	2	6	881340	881345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_016618	CGG	2	6	881348	881353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_016618	GCCG	2	8	881373	881380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_016618	GCC	2	6	881425	881430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_016618	GGA	2	6	881466	881471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016618	CTT	2	6	881475	881480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_016618	GCC	2	6	881507	881512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_016618	CTG	3	9	881527	881535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_016618	GCC	2	6	881545	881550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_016618	CG	3	6	881605	881610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_016618	GCG	2	6	881615	881620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_016618	GCCC	2	8	881691	881698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2549	NC_016618	CGC	2	6	881735	881740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_016618	GC	3	6	881773	881778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_016618	TCC	2	6	881780	881785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_016618	CGA	2	6	881799	881804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_016618	CCG	2	6	881817	881822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_016618	TGC	2	6	881831	881836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_016618	CGC	2	6	881856	881861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_016618	CGG	2	6	881912	881917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_016618	GCG	3	9	881962	881970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_016618	GCC	2	6	881983	881988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_016618	CGGCG	2	10	881990	881999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2560	NC_016618	CG	3	6	882087	882092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_016618	AGG	2	6	882140	882145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_016618	TGC	2	6	882191	882196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_016618	GCT	2	6	882204	882209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_016618	CG	3	6	882218	882223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_016618	CG	3	6	882258	882263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_016618	GTCG	2	8	882276	882283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2567	NC_016618	CGG	2	6	882297	882302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_016618	GCC	2	6	882390	882395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_016618	GCC	2	6	882401	882406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_016618	GCC	2	6	882409	882414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_016618	GCG	2	6	882430	882435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_016618	GCG	3	9	882461	882469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_016618	TGG	2	6	882470	882475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_016618	CGA	2	6	882486	882491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2576	NC_016618	CGG	2	6	882509	882514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_016618	CCG	2	6	882551	882556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_016618	GGC	3	9	882561	882569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_016618	GGGT	2	8	882653	882660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_016618	GCGCG	2	10	882672	882681	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2581	NC_016618	G	6	6	882693	882698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2584	NC_016618	CCG	2	6	882864	882869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2592	NC_016618	GGT	2	6	883047	883052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_016618	CGG	2	6	883103	883108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_016618	CGG	2	6	883529	883534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_016618	CCG	2	6	883560	883565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2597	NC_016618	CGG	2	6	883653	883658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2599	NC_016618	CAA	2	6	886681	886686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_016618	GTC	2	6	886723	886728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_016618	CCG	2	6	886753	886758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_016618	GCC	2	6	886777	886782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2603	NC_016618	CGG	2	6	886786	886791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_016618	GGA	2	6	886802	886807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_016618	GGCC	2	8	886901	886908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_016618	GCC	2	6	886987	886992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_016618	GCCC	2	8	886995	887002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2608	NC_016618	GCT	2	6	887034	887039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2610	NC_016618	GC	3	6	887081	887086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_016618	GTC	2	6	887131	887136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_016618	CGGA	2	8	887146	887153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_016618	GCC	2	6	887192	887197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_016618	GCC	2	6	887200	887205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2617	NC_016618	CCG	2	6	887280	887285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_016618	GCCGC	2	10	887310	887319	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2619	NC_016618	TCA	2	6	887322	887327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_016618	GGCG	2	8	887892	887899	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_016618	ATC	2	6	887900	887905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2635	NC_016618	CGG	2	6	890734	890739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_016618	TGC	2	6	890743	890748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_016618	GCC	2	6	890769	890774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2638	NC_016618	TAA	2	6	890825	890830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_016618	GCA	2	6	890833	890838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2640	NC_016618	GCA	2	6	890887	890892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_016618	CTT	2	6	892299	892304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2642	NC_016618	ATA	2	6	892387	892392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_016618	GAT	2	6	892402	892407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_016618	GGA	2	6	892440	892445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_016618	TAA	2	6	897096	897101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_016618	AGG	2	6	897119	897124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_016618	GGC	2	6	901162	901167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2650	NC_016618	GCGG	2	8	905823	905830	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2651	NC_016618	ATC	2	6	905838	905843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2654	NC_016618	TCC	2	6	905962	905967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2655	NC_016618	GCG	2	6	906515	906520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2659	NC_016618	TGT	2	6	909807	909812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_016618	CAG	3	9	909821	909829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2661	NC_016618	CT	3	6	912357	912362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.