MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 6642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	ATTT	2	8	19	26	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016513	TAT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016513	AAT	2	6	57	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016513	AGG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016513	CAG	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016513	ATT	2	6	325	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016513	CTT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016513	TC	3	6	341	346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016513	TTTTAT	2	12	588	599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016513	TTAATC	2	12	1089	1100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016513	AAT	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016513	TTA	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016513	TA	3	6	1159	1164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016513	AAAT	2	8	1166	1173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016513	TA	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016513	A	6	6	1253	1258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016513	TCA	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016513	TTG	2	6	1432	1437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016513	TAT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016513	GCGGTA	2	12	1517	1528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016513	A	6	6	2433	2438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016513	ATC	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016513	AAT	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016513	TCA	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016513	TAA	2	6	2887	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016513	TTCT	2	8	3013	3020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016513	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016513	TTG	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016513	CGG	2	6	3074	3079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016513	TTC	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016513	TG	3	6	3089	3094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016513	CACAA	2	10	3205	3214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016513	CCG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016513	T	7	7	3250	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016513	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016513	TGG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016513	ATT	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016513	TGG	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016513	GCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016513	ATT	2	6	3627	3632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016513	AT	3	6	3637	3642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016513	GTG	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016513	GCT	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016513	AAC	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016513	TAA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016513	T	6	6	3793	3798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016513	TTTG	2	8	3804	3811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016513	CAAA	2	8	3835	3842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016513	T	6	6	3858	3863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016513	CTA	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016513	CAA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016513	A	6	6	3900	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016513	AAT	2	6	7424	7429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016513	AAC	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016513	TCTT	2	8	8597	8604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016513	CCTTA	2	10	8605	8614	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016513	ATT	2	6	8640	8645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016513	TAA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016513	TG	3	6	8875	8880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016513	ATTG	2	8	8885	8892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016513	GAAAAA	2	12	8898	8909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016513	AAAT	2	8	8930	8937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016513	TTA	2	6	11920	11925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016513	ATT	2	6	11957	11962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016513	CTA	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016513	A	6	6	12012	12017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016513	AAT	2	6	12063	12068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016513	T	6	6	12081	12086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016513	CA	3	6	12201	12206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016513	TTC	2	6	12242	12247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016513	TC	3	6	12266	12271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016513	CTT	2	6	12628	12633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016513	TGA	2	6	14293	14298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016513	A	6	6	14301	14306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016513	ATAAA	2	10	14318	14327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016513	AAAC	2	8	14926	14933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016513	ATTT	2	8	16152	16159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016513	ATA	2	6	16639	16644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016513	A	6	6	16655	16660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016513	A	7	7	16666	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016513	TAA	2	6	16689	16694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016513	TCT	2	6	16705	16710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016513	AAAAT	2	10	18065	18074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016513	CAG	2	6	18300	18305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016513	TA	3	6	18334	18339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016513	GTA	2	6	18344	18349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016513	GTA	2	6	20187	20192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016513	A	6	6	20197	20202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016513	TTA	2	6	20243	20248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016513	CTT	2	6	20279	20284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016513	ATAAA	2	10	20308	20317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016513	T	6	6	20950	20955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016513	TTC	2	6	21696	21701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016513	CCG	2	6	21742	21747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016513	TTG	2	6	21754	21759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016513	A	6	6	24369	24374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016513	GAAA	2	8	24408	24415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016513	CGC	2	6	24432	24437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016513	TAT	2	6	24458	24463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016513	T	6	6	25893	25898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016513	CTAA	2	8	25917	25924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016513	A	6	6	25923	25928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016513	A	7	7	25949	25955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016513	AAATA	3	15	25975	25989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016513	AGTT	2	8	26036	26043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016513	GTT	2	6	26070	26075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016513	TAA	2	6	26085	26090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016513	ACG	2	6	26105	26110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016513	CAA	2	6	26121	26126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016513	TTA	2	6	26186	26191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016513	T	6	6	28762	28767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016513	T	6	6	29500	29505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016513	A	6	6	29506	29511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016513	A	6	6	29524	29529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016513	AGT	2	6	29537	29542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016513	CA	3	6	29556	29561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016513	CAT	2	6	29591	29596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016513	CAT	2	6	29600	29605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016513	AAT	2	6	29613	29618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016513	CAA	2	6	29792	29797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016513	TAA	2	6	31806	31811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016513	A	6	6	31810	31815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016513	T	6	6	31835	31840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016513	TGA	2	6	31846	31851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016513	TTC	2	6	33372	33377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016513	GAT	2	6	33573	33578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016513	CAA	2	6	33597	33602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016513	ATT	2	6	33798	33803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016513	TA	3	6	33846	33851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016513	TAG	2	6	33932	33937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016513	A	6	6	33950	33955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016513	TA	3	6	33960	33965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016513	ATT	2	6	33986	33991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016513	ACC	2	6	34041	34046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016513	CCG	2	6	34072	34077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016513	T	7	7	34116	34122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016513	TTC	2	6	34140	34145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016513	ATTA	2	8	34146	34153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016513	TAC	2	6	34208	34213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016513	CAA	2	6	34274	34279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016513	ATA	2	6	34280	34285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016513	T	6	6	34287	34292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016513	TAAT	2	8	34297	34304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016513	ATA	2	6	34309	34314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016513	A	7	7	34338	34344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016513	AAT	2	6	34352	34357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016513	AATT	2	8	34381	34388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016513	ATT	2	6	34473	34478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016513	TGT	2	6	36195	36200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016513	ATTC	2	8	36201	36208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016513	GGA	2	6	36247	36252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_016513	TAAA	2	8	36343	36350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016513	A	6	6	46822	46827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_016513	TTTTAT	2	12	110464	110475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_016513	AGG	2	6	117939	117944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_016513	AAC	2	6	134250	134255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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