MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 7519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016077	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016077	TCC	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016077	ATG	2	6	152	157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016077	GGT	2	6	163	168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016077	TAA	2	6	1572	1577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016077	GGC	2	6	1779	1784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016077	AGG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016077	GTCA	2	8	8476	8483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016077	TGGA	2	8	11087	11094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016077	TACC	2	8	11132	11139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016077	TA	4	8	11142	11149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016077	G	6	6	11150	11155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016077	TCT	2	6	11191	11196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016077	A	7	7	11723	11729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016077	GAA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016077	GTC	2	6	12677	12682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016077	T	7	7	12696	12702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016077	GC	3	6	12739	12744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016077	AATT	2	8	12750	12757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016077	CTTT	2	8	12833	12840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016077	TTAC	2	8	12841	12848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016077	CAT	2	6	12933	12938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016077	AC	3	6	13135	13140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016077	CCT	2	6	13177	13182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016077	ATC	2	6	13216	13221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016077	CCT	2	6	13940	13945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016077	AAG	2	6	15060	15065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016077	CAA	2	6	15085	15090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016077	A	7	7	15125	15131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016077	GAA	2	6	15153	15158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016077	TGATA	2	10	15399	15408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016077	GAAC	2	8	15441	15448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016077	ATTG	2	8	15463	15470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016077	A	7	7	15531	15537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016077	TTC	2	6	15568	15573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016077	ATTTT	2	10	15580	15589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016077	GGC	2	6	15622	15627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016077	ACA	2	6	15726	15731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016077	TCC	2	6	15759	15764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016077	CTC	2	6	15765	15770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016077	GGA	2	6	15776	15781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016077	GGA	2	6	15783	15788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016077	TGG	2	6	15848	15853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016077	GAT	2	6	15873	15878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016077	GCA	2	6	15946	15951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016077	CGC	2	6	15993	15998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016077	GTGA	2	8	15999	16006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016077	TGT	2	6	16032	16037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016077	CAG	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016077	ATT	2	6	16156	16161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016077	GGA	2	6	16305	16310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016077	AGG	2	6	16429	16434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016077	GAA	2	6	16569	16574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016077	TCCC	2	8	16617	16624	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_016077	GGT	2	6	16643	16648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016077	GTC	2	6	16657	16662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016077	TCGTG	2	10	16666	16675	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016077	CCTAT	2	10	16710	16719	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016077	GGA	2	6	16771	16776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016077	TCA	2	6	16796	16801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016077	AC	3	6	16822	16827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016077	TAC	2	6	16829	16834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016077	CAA	2	6	16844	16849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016077	AC	3	6	16992	16997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016077	CAC	2	6	17007	17012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016077	GAT	2	6	17078	17083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016077	CCT	2	6	17134	17139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016077	TC	3	6	17181	17186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016077	AGA	2	6	17263	17268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016077	A	6	6	17272	17277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016077	TGT	2	6	17286	17291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016077	CTA	2	6	17414	17419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016077	GCAA	2	8	17494	17501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016077	CCA	2	6	17534	17539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016077	GGA	2	6	17601	17606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016077	GCG	2	6	17635	17640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016077	CCTA	2	8	17710	17717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016077	AG	3	6	17743	17748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016077	AGGA	2	8	17770	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016077	G	6	6	17832	17837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016077	ACC	2	6	17838	17843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016077	CTT	2	6	17859	17864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016077	GAA	2	6	17986	17991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016077	CGGAGC	2	12	18036	18047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016077	GGA	2	6	18144	18149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016077	TGC	2	6	18342	18347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016077	GA	3	6	18369	18374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016077	AAC	2	6	18464	18469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016077	AGC	2	6	18487	18492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016077	GTC	2	6	18629	18634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016077	TGG	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016077	TCG	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016077	GCA	2	6	18820	18825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016077	CG	3	6	18863	18868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016077	CTGAGG	2	12	18923	18934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016077	GCC	2	6	19008	19013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016077	GA	3	6	19043	19048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016077	GTG	2	6	19127	19132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016077	AGA	2	6	19168	19173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016077	AAG	2	6	19265	19270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016077	CGG	2	6	19316	19321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016077	TGAAAT	2	12	19425	19436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016077	GCC	2	6	19573	19578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016077	ACC	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016077	CCT	2	6	19672	19677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016077	CGGA	2	8	19714	19721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016077	CG	3	6	19725	19730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016077	TC	3	6	19873	19878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016077	TCA	2	6	19924	19929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016077	GGGCT	2	10	19956	19965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016077	CGT	2	6	20004	20009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016077	GCT	2	6	20058	20063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016077	GGAC	2	8	20086	20093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016077	TC	3	6	20197	20202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016077	CAA	2	6	20385	20390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016077	CAG	2	6	20442	20447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016077	GGA	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016077	T	7	7	20564	20570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016077	TCTT	2	8	20579	20586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016077	ATC	2	6	20605	20610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016077	TGT	2	6	20617	20622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016077	ATG	2	6	20653	20658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016077	AAT	2	6	20707	20712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016077	ATAAA	2	10	20728	20737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016077	AAG	2	6	20778	20783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016077	AGG	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016077	GAT	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016077	GAT	2	6	21013	21018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016077	TGA	2	6	21046	21051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016077	TGA	3	9	21120	21128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016077	TG	3	6	21149	21154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016077	GAT	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016077	AT	3	6	21200	21205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016077	TGC	2	6	21209	21214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016077	TA	3	6	21221	21226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016077	AAG	2	6	21245	21250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016077	TGA	2	6	21278	21283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016077	TAG	2	6	21295	21300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016077	GCG	2	6	21326	21331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016077	T	8	8	21339	21346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016077	T	7	7	21381	21387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016077	TCA	2	6	22425	22430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016077	ATT	2	6	22462	22467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016077	GAAG	2	8	23702	23709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016077	GGA	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016077	TTC	2	6	24238	24243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016077	T	7	7	24249	24255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016077	T	6	6	24276	24281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016077	GTT	2	6	24293	24298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016077	ATG	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016077	AGG	2	6	24371	24376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016077	GAAGG	2	10	24378	24387	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016077	TTA	2	6	24392	24397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016077	TCCTTT	2	12	25264	25275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_016077	T	6	6	25998	26003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016077	TGTT	2	8	26156	26163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016077	TGA	2	6	26219	26224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016077	T	6	6	26265	26270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_016077	AAT	2	6	33864	33869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016077	GGA	2	6	33951	33956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016077	AGG	2	6	38987	38992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_016077	CGC	2	6	120831	120836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_016077	TGT	2	6	120870	120875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_016077	CAG	2	6	120953	120958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_016077	ATT	2	6	120994	120999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_016077	GGA	2	6	121143	121148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
439	NC_016077	AGG	2	6	121267	121272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_016077	TCCC	2	8	121455	121462	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
442	NC_016077	GGT	2	6	121481	121486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_016077	TAC	2	6	121667	121672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_016077	CAA	2	6	121682	121687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_016077	AC	3	6	121830	121835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_016077	CAC	2	6	121845	121850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_016077	GAT	2	6	121916	121921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_016077	AGA	2	6	122101	122106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_016077	TGT	2	6	122124	122129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_016077	CCA	2	6	122372	122377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_016077	GGA	2	6	122439	122444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_016077	GCG	2	6	122473	122478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_016077	CCTA	2	8	122548	122555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_016077	AG	3	6	122581	122586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016077	AGGA	2	8	122608	122615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016077	G	6	6	122670	122675	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
468	NC_016077	ACC	2	6	122676	122681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
469	NC_016077	CTT	2	6	122697	122702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_016077	GAA	2	6	122824	122829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_016077	CGGAGC	2	12	122874	122885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_016077	GGA	2	6	122982	122987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
473	NC_016077	TGC	2	6	123180	123185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_016077	AAC	2	6	123302	123307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_016077	AGC	2	6	123325	123330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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478	NC_016077	TGG	2	6	123491	123496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
479	NC_016077	TCG	2	6	123578	123583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_016077	CGG	2	6	124154	124159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_016077	ACC	2	6	124425	124430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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494	NC_016077	CG	3	6	124563	124568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_016077	TC	3	6	124711	124716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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