MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 4208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015508	GCG	2	6	1609363	1609368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015508	CCG	2	6	1610956	1610961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_015508	CT	3	6	1610989	1610994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015508	CA	3	6	1611113	1611118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_015508	ATC	2	6	1611121	1611126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015508	CAT	2	6	1611512	1611517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015508	GCG	2	6	1611542	1611547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015508	TTG	2	6	1613517	1613522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015508	CGA	2	6	1613549	1613554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_015508	GAT	2	6	1615402	1615407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015508	GCG	2	6	1615577	1615582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_015508	GA	3	6	1615585	1615590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015508	TTGG	2	8	1616779	1616786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015508	CGT	2	6	1616821	1616826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_015508	ACC	2	6	1616891	1616896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_015508	ACA	2	6	1618510	1618515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015508	CG	3	6	1618519	1618524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_015508	GAA	2	6	1618525	1618530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015508	CG	3	6	1618543	1618548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_015508	A	6	6	1618559	1618564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015508	CAGC	2	8	1618740	1618747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_015508	GCA	2	6	1618755	1618760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_015508	GCT	2	6	1618782	1618787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015508	TCG	2	6	1618877	1618882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015508	CAT	2	6	1618884	1618889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015508	CGA	2	6	1622174	1622179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015508	TGT	2	6	1622219	1622224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015508	T	6	6	1622224	1622229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015508	A	6	6	1622980	1622985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015508	T	6	6	1622992	1622997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015508	GCTG	2	8	1623043	1623050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_015508	GGA	2	6	1623053	1623058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015508	TGG	2	6	1623137	1623142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015508	TCC	2	6	1623173	1623178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015508	GCT	2	6	1623185	1623190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015508	GCGTCG	2	12	1624371	1624382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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3038	NC_015508	GTT	2	6	1625547	1625552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015508	GTCA	2	8	1625553	1625560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_015508	ACG	2	6	1625623	1625628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_015508	GTT	2	6	1625629	1625634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015508	TGA	2	6	1626606	1626611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015508	GAG	2	6	1626671	1626676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3045	NC_015508	GAG	2	6	1626774	1626779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015508	T	6	6	1631400	1631405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_015508	GCG	2	6	1637962	1637967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015508	GTT	2	6	1637987	1637992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015508	GA	3	6	1638371	1638376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015508	TCAA	2	8	1641062	1641069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_015508	A	8	8	1641072	1641079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3058	NC_015508	ACAA	2	8	1643075	1643082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_015508	AG	3	6	1643087	1643092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015508	T	7	7	1643131	1643137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015508	TCCT	2	8	1643720	1643727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3063	NC_015508	GCA	2	6	1650491	1650496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015508	CAC	2	6	1650527	1650532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_015508	GCC	2	6	1650541	1650546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_015508	GCC	2	6	1650556	1650561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_015508	ATG	2	6	1650607	1650612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015508	CGG	2	6	1650617	1650622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015508	CTGT	2	8	1650749	1650756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_015508	TTGCG	2	10	1650801	1650810	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3071	NC_015508	CATC	2	8	1651724	1651731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3073	NC_015508	AT	3	6	1653769	1653774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015508	GAATG	2	10	1653787	1653796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015508	TCC	2	6	1653896	1653901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3077	NC_015508	TCGC	2	8	1662092	1662099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3080	NC_015508	TAT	2	6	1662186	1662191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015508	GCG	2	6	1662688	1662693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3083	NC_015508	A	7	7	1663566	1663572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015508	T	7	7	1663593	1663599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_015508	T	6	6	1665645	1665650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015508	T	8	8	1665773	1665780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_015508	CTG	2	6	1665809	1665814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3097	NC_015508	AAGG	2	8	1667788	1667795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_015508	A	7	7	1669477	1669483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_015508	A	8	8	1669576	1669583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015508	GCA	3	9	1669607	1669615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3105	NC_015508	GCG	2	6	1670636	1670641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3108	NC_015508	TCAA	2	8	1670730	1670737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_015508	AGG	2	6	1671891	1671896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015508	T	7	7	1673184	1673190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015508	TGA	2	6	1673192	1673197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015508	CTGC	2	8	1675138	1675145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_015508	TCT	2	6	1675318	1675323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015508	TCG	2	6	1675325	1675330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015508	A	7	7	1675338	1675344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015508	C	6	6	1675379	1675384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3117	NC_015508	A	7	7	1675425	1675431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015508	A	6	6	1675479	1675484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3120	NC_015508	TTC	2	6	1676828	1676833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015508	T	6	6	1676891	1676896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015508	TCGGA	2	10	1676930	1676939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3124	NC_015508	AAAAG	2	10	1681253	1681262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_015508	CAG	2	6	1681489	1681494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015508	A	6	6	1682435	1682440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015508	T	7	7	1682457	1682463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3132	NC_015508	GGC	2	6	1682655	1682660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3134	NC_015508	CG	4	8	1687524	1687531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3262	NC_015508	CGG	2	6	1702246	1702251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3395	NC_015508	CATG	2	8	1770320	1770327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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