MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015188	TTG	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015188	CAG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015188	CTG	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015188	TAT	2	6	1491	1496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015188	CCCGT	2	10	2076	2085	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015188	GTT	2	6	2166	2171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015188	GC	3	6	2472	2477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015188	CGG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015188	CG	3	6	2646	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015188	CGG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015188	GAA	3	9	2686	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015188	ACG	2	6	2697	2702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015188	AGA	2	6	3087	3092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015188	ACC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015188	GAT	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015188	TAAAC	2	10	3337	3346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015188	GT	3	6	3349	3354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015188	TCC	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015188	TGT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015188	TGCC	2	8	4039	4046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015188	TACG	2	8	4117	4124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015188	GTG	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015188	TGA	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015188	TGG	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015188	GGAT	2	8	7562	7569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015188	G	6	6	7602	7607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015188	CAT	2	6	11628	11633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015188	GAT	2	6	11658	11663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015188	ACC	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015188	CG	3	6	11732	11737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015188	TGC	2	6	13328	13333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015188	ATC	2	6	13401	13406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015188	GTA	2	6	13586	13591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015188	TGC	2	6	13617	13622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015188	GGTG	2	8	13642	13649	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015188	TCA	2	6	17101	17106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015188	GGT	2	6	17117	17122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015188	AGG	2	6	17215	17220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015188	GGCAT	2	10	22606	22615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015188	AAT	2	6	22709	22714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015188	ATT	2	6	22720	22725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015188	ATTTT	2	10	22771	22780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015188	TAG	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015188	TCG	2	6	23953	23958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015188	AC	3	6	23975	23980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015188	GT	3	6	23985	23990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015188	TGC	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015188	TTA	2	6	24082	24087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015188	ATT	2	6	24183	24188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015188	TCT	2	6	24208	24213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015188	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015188	GC	3	6	24268	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015188	TAT	2	6	24297	24302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015188	TCC	2	6	27966	27971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015188	ATG	2	6	27983	27988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015188	GA	3	6	28003	28008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015188	ACC	2	6	28021	28026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015188	GCCA	2	8	28096	28103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015188	AAG	2	6	30139	30144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015188	ATC	2	6	30158	30163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015188	GTCC	2	8	30186	30193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015188	TTGAA	2	10	30208	30217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015188	GCA	2	6	30232	30237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015188	TGG	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015188	AGC	2	6	30277	30282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015188	AT	3	6	30677	30682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015188	ACG	2	6	30745	30750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015188	GAT	2	6	30796	30801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015188	CTA	2	6	30854	30859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015188	TGAT	2	8	31923	31930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015188	GCT	2	6	31951	31956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015188	CAG	2	6	31973	31978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015188	AT	3	6	31983	31988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015188	TAG	2	6	32144	32149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015188	AGA	2	6	32436	32441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015188	ATG	2	6	32450	32455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015188	GAT	3	9	32510	32518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015188	CGA	2	6	32539	32544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015188	TGA	2	6	32553	32558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015188	CGA	2	6	32623	32628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015188	G	8	8	33878	33885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015188	AAT	2	6	33892	33897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015188	GAC	2	6	33921	33926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015188	TAATA	2	10	33938	33947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015188	CAA	3	9	33955	33963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015188	ATA	2	6	33974	33979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015188	CGG	2	6	34005	34010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015188	AAT	2	6	34018	34023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015188	TCT	2	6	34049	34054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015188	A	6	6	34066	34071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015188	ATA	2	6	34101	34106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015188	GA	3	6	35068	35073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015188	CGG	2	6	35107	35112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015188	ACT	3	9	36380	36388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015188	GTAT	2	8	36399	36406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015188	GAAC	2	8	36438	36445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015188	TAT	2	6	36478	36483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015188	AAAT	2	8	36485	36492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015188	TA	3	6	36505	36510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015188	ATT	2	6	36518	36523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015188	ATT	2	6	36611	36616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015188	TCAT	2	8	36648	36655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015188	TAG	2	6	37729	37734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015188	A	6	6	38525	38530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015188	CAG	2	6	38536	38541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015188	CTGG	2	8	38602	38609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015188	CTCCC	2	10	38645	38654	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_015188	GCG	2	6	38662	38667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015188	GAAT	2	8	38692	38699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015188	CGT	2	6	39938	39943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015188	G	6	6	40033	40038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015188	TTC	2	6	40060	40065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015188	GGC	2	6	40083	40088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015188	TCA	2	6	40144	40149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015188	GATTCG	2	12	40177	40188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015188	CGGG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015188	T	6	6	40509	40514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015188	CTG	2	6	40536	40541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015188	GGA	2	6	40578	40583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.