MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV2

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015187	GT	3	6	1429	1434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015187	ATC	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015187	AGG	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015187	A	6	6	2071	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015187	GT	3	6	2107	2112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015187	TCA	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015187	TCA	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015187	TGG	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015187	AGA	2	6	5427	5432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015187	TCG	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015187	GTCAA	2	10	8872	8881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015187	TA	3	6	8920	8925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015187	GA	3	6	8961	8966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015187	GAC	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015187	TAG	2	6	12889	12894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015187	GCAA	2	8	12916	12923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015187	CGG	2	6	13173	13178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015187	CCTG	2	8	13235	13242	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015187	GTCA	2	8	13258	13265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015187	CTT	2	6	13290	13295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015187	TG	3	6	15745	15750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015187	GGC	3	9	15788	15796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015187	CAAA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015187	TCG	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015187	CAT	2	6	15946	15951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015187	ATG	2	6	17020	17025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015187	AG	3	6	18896	18901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015187	CGG	2	6	18959	18964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015187	GGC	2	6	18980	18985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015187	CAGG	2	8	18997	19004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015187	AGA	2	6	19169	19174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015187	GCC	2	6	19264	19269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015187	CCT	2	6	19296	19301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015187	CCA	2	6	19331	19336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015187	GCG	2	6	20341	20346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015187	CGG	2	6	20352	20357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015187	GTC	2	6	20440	20445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015187	TCC	2	6	21824	21829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015187	ATG	2	6	21841	21846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015187	GA	3	6	21861	21866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015187	ACC	2	6	21879	21884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015187	TAC	2	6	21950	21955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015187	A	6	6	21964	21969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015187	AT	3	6	21976	21981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015187	CAA	2	6	21982	21987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015187	GCGCG	2	10	22039	22048	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015187	CGG	2	6	22617	22622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015187	GCAGG	2	10	22662	22671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015187	GCA	2	6	22685	22690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015187	TA	3	6	22706	22711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015187	GGCGC	2	10	26293	26302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015187	CGG	2	6	26307	26312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015187	GGC	2	6	26317	26322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015187	GAG	2	6	26350	26355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015187	GCGCG	2	10	26418	26427	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015187	GCGG	2	8	28084	28091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015187	GAA	2	6	28102	28107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015187	GCG	2	6	28136	28141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015187	G	6	6	33629	33634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015187	GA	3	6	33648	33653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015187	TGC	2	6	33781	33786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015187	TGT	2	6	40373	40378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015187	ACC	2	6	40397	40402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015187	TCT	2	6	40523	40528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015187	CTC	2	6	41249	41254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015187	TAT	2	6	41276	41281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015187	CGA	2	6	45018	45023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015187	AAC	2	6	45059	45064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015187	TGC	2	6	45095	45100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015187	AC	3	6	45104	45109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015187	CCA	2	6	45152	45157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015187	GC	3	6	45166	45171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015187	CTTT	2	8	45540	45547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015187	AGG	2	6	46165	46170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015187	GTG	2	6	46226	46231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015187	ATTG	2	8	46304	46311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015187	GGA	2	6	46336	46341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015187	AAC	2	6	46369	46374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015187	GGC	2	6	46477	46482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015187	TCTCG	2	10	46495	46504	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015187	GTT	2	6	46531	46536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015187	TC	3	6	46615	46620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015187	TGA	2	6	46665	46670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015187	ATC	2	6	46689	46694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015187	T	7	7	46919	46925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015187	TCT	2	6	46992	46997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015187	TAT	2	6	47101	47106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015187	GTC	2	6	47133	47138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015187	CGC	2	6	47146	47151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015187	GC	3	6	47215	47220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015187	C	7	7	48431	48437	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_015187	T	6	6	48464	48469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015187	GCG	2	6	48706	48711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015187	GCG	2	6	48850	48855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015187	CTT	2	6	48911	48916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015187	CCT	2	6	48949	48954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015187	TGA	2	6	53133	53138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015187	TGG	2	6	53205	53210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015187	GGAT	2	8	53228	53235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015187	G	6	6	53268	53273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015187	CGG	2	6	53936	53941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015187	CGG	2	6	53960	53965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015187	CGC	2	6	54018	54023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015187	TGA	2	6	54024	54029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015187	CCAG	2	8	54030	54037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015187	CCA	2	6	54079	54084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015187	ATC	2	6	54137	54142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015187	GAA	2	6	54157	54162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015187	CGA	2	6	54183	54188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015187	CGC	2	6	54201	54206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015187	GAG	2	6	64642	64647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015187	TTG	2	6	64672	64677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015187	GGT	2	6	64718	64723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015187	CTG	2	6	65158	65163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015187	GC	3	6	65184	65189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015187	CAT	2	6	65237	65242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015187	ACA	2	6	65264	65269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015187	CA	3	6	65268	65273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015187	CG	3	6	65276	65281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015187	CT	3	6	65291	65296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015187	GCG	2	6	65303	65308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015187	TCA	2	6	65310	65315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015187	CG	3	6	65337	65342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015187	AGG	2	6	65371	65376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015187	TGG	2	6	65481	65486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.