MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 12960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015138	CATGG	2	10	4306800	4306809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10002	NC_015138	CG	3	6	4306818	4306823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_015138	GGC	2	6	4306825	4306830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_015138	TTCC	2	8	4308826	4308833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_015138	GGCG	2	8	4308834	4308841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_015138	C	6	6	4312496	4312501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10007	NC_015138	GCG	2	6	4312509	4312514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_015138	ATA	2	6	4312619	4312624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_015138	CGA	2	6	4312643	4312648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_015138	TCC	2	6	4312666	4312671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_015138	AAT	2	6	4312678	4312683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_015138	TGC	2	6	4316008	4316013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_015138	CGC	2	6	4316655	4316660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_015138	CGCC	2	8	4316682	4316689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10015	NC_015138	GGCG	2	8	4316704	4316711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_015138	AGA	2	6	4316766	4316771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_015138	CT	3	6	4316773	4316778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_015138	GCAT	2	8	4316845	4316852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_015138	AGC	2	6	4316874	4316879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_015138	GCC	2	6	4318560	4318565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_015138	TCTT	2	8	4321113	4321120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_015138	TCCG	2	8	4321193	4321200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_015138	CGCAC	2	10	4321231	4321240	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10024	NC_015138	CTCC	2	8	4321426	4321433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10025	NC_015138	GAA	2	6	4321459	4321464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015138	CGT	2	6	4322427	4322432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_015138	GC	3	6	4322492	4322497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_015138	T	7	7	4322499	4322505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_015138	GCCCC	2	10	4323565	4323574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10030	NC_015138	GGCA	2	8	4324923	4324930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_015138	GCCCT	2	10	4324960	4324969	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10032	NC_015138	CG	4	8	4327754	4327761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_015138	GGA	2	6	4328462	4328467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_015138	CTC	2	6	4329595	4329600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_015138	A	6	6	4329617	4329622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_015138	CTT	2	6	4330566	4330571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_015138	GTC	2	6	4330572	4330577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_015138	TCT	2	6	4330583	4330588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_015138	TCC	2	6	4331458	4331463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_015138	GCA	2	6	4331484	4331489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015138	CAG	2	6	4331536	4331541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_015138	CGT	2	6	4331574	4331579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_015138	GC	3	6	4331597	4331602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_015138	TCGC	2	8	4331733	4331740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_015138	GCG	2	6	4334665	4334670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_015138	GCG	2	6	4334704	4334709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_015138	CG	3	6	4334759	4334764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_015138	CG	3	6	4334778	4334783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_015138	TC	4	8	4334788	4334795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_015138	TGCA	2	8	4334803	4334810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_015138	GCCA	2	8	4334814	4334821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_015138	GGC	2	6	4334830	4334835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_015138	GCA	2	6	4334850	4334855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_015138	GCCCA	2	10	4334901	4334910	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10055	NC_015138	GAAG	2	8	4334924	4334931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_015138	GGC	2	6	4334934	4334939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_015138	GC	3	6	4334965	4334970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_015138	GC	3	6	4334994	4334999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_015138	TGC	2	6	4335024	4335029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_015138	ACCG	2	8	4335087	4335094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_015138	GCC	2	6	4335097	4335102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_015138	CGC	2	6	4335113	4335118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_015138	CGGCG	2	10	4335120	4335129	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10064	NC_015138	GGAG	2	8	4336833	4336840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_015138	GGCCG	2	10	4336848	4336857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10066	NC_015138	GCC	2	6	4336867	4336872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_015138	T	7	7	4336880	4336886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_015138	CA	3	6	4336929	4336934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_015138	ATT	2	6	4338405	4338410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_015138	GCGCC	2	10	4338526	4338535	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10071	NC_015138	GCA	2	6	4338541	4338546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_015138	CCGCG	2	10	4338935	4338944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10073	NC_015138	CGCA	2	8	4338980	4338987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_015138	GCCC	2	8	4338995	4339002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10075	NC_015138	CCGGC	2	10	4339009	4339018	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10076	NC_015138	CG	3	6	4339045	4339050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10077	NC_015138	GGGC	2	8	4339555	4339562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_015138	CGC	2	6	4339565	4339570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_015138	CTC	2	6	4340224	4340229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_015138	CCGT	2	8	4340290	4340297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_015138	GCA	2	6	4340299	4340304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_015138	GCAG	2	8	4340315	4340322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10083	NC_015138	CAG	2	6	4340976	4340981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_015138	TGCCG	2	10	4341000	4341009	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10085	NC_015138	CCG	2	6	4341016	4341021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_015138	CCT	2	6	4341073	4341078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10087	NC_015138	CTC	2	6	4341079	4341084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10088	NC_015138	CTGCCG	2	12	4341089	4341100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10089	NC_015138	CGGC	2	8	4343017	4343024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_015138	CCGG	2	8	4343027	4343034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_015138	CGG	2	6	4343038	4343043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_015138	GGC	2	6	4347303	4347308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_015138	CCACC	2	10	4347328	4347337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10094	NC_015138	CGC	2	6	4348490	4348495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_015138	GCC	2	6	4355033	4355038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_015138	GCA	2	6	4355087	4355092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_015138	GGC	2	6	4355105	4355110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_015138	CG	3	6	4355123	4355128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_015138	GGCA	2	8	4355131	4355138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_015138	GAG	2	6	4355167	4355172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_015138	GCCT	2	8	4355742	4355749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_015138	CAG	2	6	4355753	4355758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_015138	CGG	2	6	4355768	4355773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_015138	CAC	2	6	4355774	4355779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_015138	TCAC	2	8	4356307	4356314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_015138	GAA	2	6	4356373	4356378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_015138	TGG	2	6	4356876	4356881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_015138	C	6	6	4356888	4356893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10109	NC_015138	GTC	2	6	4358260	4358265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_015138	GCCGC	2	10	4358298	4358307	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10111	NC_015138	TCC	2	6	4358392	4358397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_015138	CTT	2	6	4358408	4358413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_015138	CGG	3	9	4361950	4361958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_015138	TC	3	6	4363130	4363135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_015138	GCGG	2	8	4363161	4363168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_015138	TGC	2	6	4363173	4363178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_015138	CCATG	2	10	4363209	4363218	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10118	NC_015138	CAC	2	6	4363275	4363280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_015138	T	6	6	4363309	4363314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_015138	AC	3	6	4363399	4363404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_015138	GAC	2	6	4365076	4365081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_015138	C	6	6	4365083	4365088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10123	NC_015138	C	6	6	4365107	4365112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10124	NC_015138	TGC	2	6	4365123	4365128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_015138	GAC	2	6	4365145	4365150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_015138	CTG	2	6	4365184	4365189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_015138	CTA	2	6	4365288	4365293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_015138	TGT	2	6	4370470	4370475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_015138	T	7	7	4370959	4370965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_015138	CCG	2	6	4373766	4373771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10262	NC_015138	GCCA	2	8	4415248	4415255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10263	NC_015138	GGC	2	6	4415344	4415349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10266	NC_015138	CG	3	6	4415453	4415458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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