MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 incision element

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014000	GAATT	2	10	6	15	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014000	T	6	6	6775	6780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014000	TTGG	2	8	6782	6789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014000	A	6	6	6791	6796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014000	T	6	6	7216	7221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014000	CAG	2	6	7786	7791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014000	TATC	2	8	10019	10026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014000	TGTGTC	2	12	10028	10039	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014000	A	6	6	10043	10048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014000	AT	3	6	10074	10079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014000	CA	3	6	10097	10102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014000	GTA	2	6	10128	10133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014000	TTC	2	6	10143	10148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014000	CAT	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014000	CT	3	6	10236	10241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014000	GTTAG	2	10	10335	10344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014000	TTC	2	6	10349	10354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014000	T	8	8	10357	10364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014000	ACA	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014000	TGA	2	6	10712	10717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014000	TTG	2	6	13051	13056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014000	CGT	2	6	14200	14205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014000	ACA	2	6	15502	15507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014000	GAA	2	6	15521	15526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014000	TAC	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014000	CAAA	2	8	15551	15558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014000	CAAT	2	8	16201	16208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014000	TCA	2	6	16278	16283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014000	A	6	6	16320	16325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014000	A	6	6	16332	16337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014000	TGG	2	6	16418	16423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014000	TTA	2	6	18325	18330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014000	T	7	7	18357	18363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014000	TAAAT	2	10	18384	18393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014000	CGG	2	6	19396	19401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014000	TTG	2	6	19414	19419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014000	TAG	2	6	19846	19851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014000	TTA	2	6	19874	19879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014000	AC	3	6	19900	19905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014000	AGT	2	6	19922	19927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014000	CTA	2	6	19934	19939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014000	AG	3	6	19965	19970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014000	CGCA	2	8	20053	20060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014000	GAC	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014000	T	7	7	20083	20089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014000	GACG	2	8	20167	20174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014000	GTT	2	6	20230	20235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014000	TTGAGT	2	12	21449	21460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014000	AGA	2	6	21466	21471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014000	T	6	6	22206	22211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014000	T	6	6	22262	22267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014000	CCG	2	6	22275	22280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014000	TGG	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014000	GCG	2	6	24373	24378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014000	ACT	2	6	24380	24385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014000	TG	3	6	24395	24400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014000	GCA	2	6	24405	24410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014000	ATTT	2	8	24468	24475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014000	GGC	2	6	24522	24527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014000	GGC	2	6	24613	24618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014000	GAA	2	6	24622	24627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014000	CGAC	2	8	24646	24653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014000	CAA	2	6	24663	24668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014000	TG	3	6	24684	24689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014000	TCA	3	9	24703	24711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014000	AATTGG	2	12	24729	24740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014000	TTC	2	6	25567	25572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014000	ATG	2	6	25573	25578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014000	A	6	6	25628	25633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014000	CA	3	6	25634	25639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014000	TTGATT	2	12	26035	26046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014000	TAAA	2	8	26054	26061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014000	T	7	7	26075	26081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014000	CCA	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014000	AT	3	6	26685	26690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014000	A	7	7	26737	26743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014000	TAC	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014000	ATA	2	6	27136	27141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014000	AT	3	6	27182	27187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014000	CTT	2	6	27222	27227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014000	A	8	8	27271	27278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014000	CCG	2	6	27282	27287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014000	AATT	2	8	27319	27326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014000	CAAA	2	8	27938	27945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014000	CGC	2	6	28006	28011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014000	AGA	2	6	28075	28080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014000	CAT	2	6	28088	28093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014000	A	6	6	28130	28135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014000	AC	3	6	28200	28205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014000	GTACAC	2	12	28210	28221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014000	ATT	2	6	28246	28251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014000	CAA	2	6	28322	28327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014000	ATAA	2	8	29911	29918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014000	TCT	2	6	29922	29927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014000	TA	3	6	29939	29944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014000	A	7	7	30003	30009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014000	AGG	2	6	30111	30116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014000	ACG	2	6	33939	33944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014000	TGT	2	6	33968	33973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014000	A	6	6	33977	33982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014000	AT	3	6	34009	34014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014000	GTG	2	6	34021	34026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014000	TGCTT	2	10	34066	34075	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014000	GCT	2	6	34106	34111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014000	TAAT	2	8	35804	35811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014000	TAAT	2	8	35824	35831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014000	ACA	2	6	37059	37064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014000	GGC	2	6	37108	37113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014000	CCG	2	6	37127	37132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.