MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid S25

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013438	AAT	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013438	AATT	2	8	577	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013438	TAC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013438	T	6	6	632	637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013438	ATT	2	6	864	869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013438	A	6	6	902	907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013438	AAACAA	2	12	954	965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013438	A	6	6	967	972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013438	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013438	TAT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013438	TTTC	2	8	1269	1276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013438	TATT	2	8	1283	1290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013438	A	6	6	1299	1304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013438	A	6	6	1469	1474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013438	A	6	6	1476	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013438	T	6	6	1488	1493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013438	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013438	TAT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013438	T	7	7	2675	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013438	ATA	2	6	3936	3941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013438	TATT	2	8	3957	3964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013438	C	6	6	4021	4026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_013438	TAT	2	6	6846	6851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013438	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013438	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013438	TAA	2	6	6870	6875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013438	TTA	2	6	6877	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013438	TAA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013438	A	6	6	11850	11855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013438	TTC	2	6	13293	13298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013438	A	6	6	13324	13329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013438	A	7	7	16957	16963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013438	T	7	7	16977	16983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013438	AT	3	6	17032	17037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013438	GAT	2	6	17120	17125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013438	TAA	2	6	17152	17157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013438	TA	3	6	17182	17187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013438	TAA	2	6	17218	17223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013438	T	8	8	17455	17462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013438	T	7	7	17495	17501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013438	TTTG	2	8	17517	17524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013438	TAT	2	6	17589	17594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013438	TAT	2	6	17660	17665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013438	TAAGT	2	10	17705	17714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013438	T	7	7	18583	18589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013438	TAA	2	6	18599	18604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013438	ATA	2	6	18619	18624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013438	ATT	2	6	18634	18639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013438	ATA	2	6	18648	18653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013438	AAT	2	6	21233	21238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013438	A	8	8	22197	22204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013438	T	6	6	22222	22227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013438	T	6	6	22467	22472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013438	TAA	2	6	22526	22531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013438	ATTAA	2	10	22543	22552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013438	TAA	2	6	22566	22571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013438	TAT	2	6	22596	22601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013438	ATT	2	6	22615	22620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013438	TAA	2	6	22633	22638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013438	TAA	2	6	22641	22646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013438	A	6	6	22657	22662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013438	TTC	2	6	22668	22673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013438	AAAG	2	8	22688	22695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013438	AAT	2	6	22899	22904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013438	ATT	2	6	23545	23550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013438	T	6	6	23553	23558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013438	GTT	2	6	23752	23757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013438	G	6	6	25769	25774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013438	CAAA	2	8	25895	25902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013438	ACAA	2	8	27495	27502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013438	AAT	2	6	27507	27512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013438	AAT	2	6	28981	28986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013438	ATT	2	6	28989	28994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013438	TAA	2	6	28999	29004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013438	ATT	2	6	29008	29013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013438	ATAA	2	8	29017	29024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013438	TAA	2	6	30388	30393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013438	ATT	3	9	30394	30402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013438	TAA	2	6	30404	30409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013438	ATT	3	9	30410	30418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013438	TGA	2	6	30453	30458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013438	T	9	9	30950	30958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013438	TAT	2	6	30965	30970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013438	TAA	2	6	30976	30981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013438	ATT	3	9	30982	30990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013438	TAA	2	6	30992	30997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013438	ATT	3	9	30998	31006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013438	TAA	2	6	31008	31013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013438	TTA	2	6	31015	31020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.