MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI03

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013208	CACC	2	8	2	9	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_013208	CCGCG	2	10	140	149	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_013208	CGC	2	6	168	173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013208	GGC	2	6	196	201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013208	CGC	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013208	C	6	6	222	227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_013208	GCGCG	2	10	240	249	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013208	TG	3	6	275	280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013208	CGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013208	CGACA	2	10	407	416	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013208	GGC	2	6	456	461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013208	CAAA	2	8	474	481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013208	AC	3	6	3938	3943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013208	ACC	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013208	AG	3	6	3990	3995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013208	TCCCCC	2	12	4036	4047	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
17	NC_013208	C	7	7	4043	4049	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_013208	GA	4	8	4059	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013208	AGA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013208	TG	3	6	4206	4211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013208	ACC	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013208	TTG	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013208	TTC	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013208	TCG	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013208	AACCC	2	10	4588	4597	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_013208	TTC	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013208	CAG	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013208	CCTTC	2	10	4728	4737	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_013208	TAC	2	6	4739	4744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013208	AGG	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013208	TCG	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013208	AGG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013208	GATT	2	8	4933	4940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013208	GGCG	2	8	4961	4968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013208	CCG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013208	GC	3	6	4990	4995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013208	ACA	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013208	CG	3	6	5044	5049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013208	CGG	3	9	5057	5065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013208	CG	3	6	5176	5181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013208	CCT	2	6	5935	5940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013208	TCCAA	2	10	6066	6075	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013208	CGC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013208	GAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013208	GCC	2	6	6101	6106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013208	CGAT	2	8	6192	6199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013208	GAA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013208	CTT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013208	CTT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013208	CCA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013208	CAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013208	AAT	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013208	AT	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013208	GGC	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013208	ACG	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013208	CCT	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013208	TCG	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013208	GC	3	6	7868	7873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013208	GC	3	6	7877	7882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.