MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	A	6	6	13	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013164	TAG	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013164	TGG	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013164	AT	3	6	2579	2584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013164	TAG	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013164	AAT	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013164	A	6	6	4318	4323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013164	AAATT	2	10	4372	4381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013164	AGT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013164	TGT	2	6	4401	4406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013164	TGT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013164	TA	4	8	4474	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013164	TA	3	6	4529	4534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013164	ATA	3	9	4550	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013164	ATT	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013164	A	7	7	4582	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013164	A	6	6	4590	4595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013164	TA	3	6	4604	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013164	ATTT	2	8	4611	4618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013164	TAA	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013164	ATT	2	6	8885	8890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013164	TTAA	2	8	8892	8899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013164	TA	4	8	8907	8914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013164	AAT	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013164	TAT	2	6	8982	8987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013164	TA	3	6	9011	9016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013164	T	7	7	9018	9024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013164	AGG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013164	GAT	2	6	9096	9101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013164	A	6	6	9150	9155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013164	TATT	2	8	9172	9179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013164	ACC	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013164	AGG	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013164	TAA	2	6	9231	9236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013164	ATG	3	9	9270	9278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013164	TAA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013164	TAA	2	6	9379	9384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013164	AGG	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013164	AGTA	2	8	9551	9558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013164	ATT	2	6	9562	9567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013164	ATT	2	6	9749	9754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013164	ATAA	2	8	9982	9989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013164	ATG	2	6	9992	9997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013164	A	6	6	10031	10036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013164	CTAA	2	8	10037	10044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013164	AGG	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013164	T	6	6	10055	10060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013164	AGT	2	6	10094	10099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013164	ATA	2	6	10103	10108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013164	GTA	2	6	10170	10175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013164	A	6	6	10232	10237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013164	AAT	2	6	10306	10311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013164	ATT	2	6	10342	10347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013164	ATA	2	6	10378	10383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013164	AAT	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013164	ATTG	2	8	10424	10431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013164	TAAT	2	8	10474	10481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013164	AAT	2	6	10487	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013164	CTTC	2	8	10541	10548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013164	ATA	2	6	10551	10556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013164	T	6	6	10636	10641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013164	T	6	6	10677	10682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013164	AGC	2	6	10704	10709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013164	TTC	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013164	ATTT	2	8	10799	10806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013164	ATA	2	6	10807	10812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013164	T	6	6	10819	10824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013164	T	7	7	10841	10847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013164	CTAA	2	8	10888	10895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013164	TAAAA	2	10	10940	10949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013164	GTA	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013164	T	7	7	10980	10986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013164	CGA	2	6	11012	11017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013164	TA	3	6	11040	11045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013164	TAA	2	6	11053	11058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013164	ATA	2	6	11063	11068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013164	AAAT	2	8	11086	11093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013164	ACT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013164	AAATT	2	10	11108	11117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013164	GTA	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013164	TAG	2	6	11140	11145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013164	AAT	2	6	12450	12455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013164	TAG	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013164	AGG	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013164	ATATT	2	10	12763	12772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013164	AGG	2	6	12785	12790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013164	A	6	6	18550	18555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013164	TA	3	6	18583	18588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013164	AT	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013164	T	6	6	18652	18657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013164	AT	3	6	18686	18691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013164	GA	3	6	18739	18744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013164	T	6	6	18809	18814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013164	A	6	6	18828	18833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013164	A	6	6	18892	18897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013164	TAA	2	6	18974	18979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013164	AAG	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013164	A	7	7	20755	20761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013164	T	6	6	20793	20798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013164	TGCT	2	8	20822	20829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013164	ATTA	2	8	20866	20873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013164	TAA	2	6	20892	20897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013164	ATT	2	6	21037	21042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013164	GAGG	2	8	21051	21058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013164	TATTTT	2	12	21478	21489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013164	TA	3	6	21544	21549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013164	ATAA	2	8	21581	21588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013164	ATTTC	2	10	38935	38944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013164	TAT	2	6	38956	38961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013164	AGAA	2	8	43111	43118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013164	TTAGA	2	10	43145	43154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013164	TAG	2	6	43166	43171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013164	T	7	7	43184	43190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013164	AAAAAT	2	12	43229	43240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013164	ATTC	2	8	43369	43376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013164	A	8	8	43390	43397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013164	AGG	2	6	43408	43413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013164	ATA	2	6	43570	43575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013164	AGG	2	6	43602	43607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013164	ATA	2	6	45671	45676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013164	CTT	2	6	45736	45741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013164	AAG	2	6	45751	45756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013164	GAT	2	6	45779	45784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013164	TAAAA	2	10	45787	45796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013164	A	6	6	45793	45798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013164	AAC	2	6	45803	45808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013164	AGA	2	6	45812	45817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013164	ATT	2	6	45825	45830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013164	ATA	2	6	45917	45922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013164	A	6	6	45987	45992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013164	TGC	2	6	46006	46011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013164	A	6	6	46070	46075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013164	ACT	2	6	46120	46125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013164	A	6	6	46133	46138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013164	ACT	2	6	46191	46196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013164	AAG	2	6	46206	46211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013164	TAT	2	6	46219	46224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013164	AGATGA	2	12	46254	46265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013164	AGA	2	6	46275	46280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013164	AGA	2	6	46297	46302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013164	AAC	2	6	46309	46314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013164	A	7	7	46332	46338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013164	GAA	2	6	46370	46375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013164	AAT	2	6	46386	46391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013164	GAA	2	6	46392	46397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013164	TAA	2	6	46439	46444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013164	GAA	2	6	46459	46464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013164	TA	3	6	46564	46569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013164	TAA	2	6	46574	46579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013164	ATA	2	6	46600	46605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013164	TCA	2	6	46612	46617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013164	TAG	2	6	46640	46645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013164	CA	3	6	46696	46701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_013164	AGA	2	6	46734	46739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013164	A	6	6	46777	46782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013164	ATG	2	6	46828	46833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013164	AT	3	6	46843	46848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013164	TAA	2	6	46911	46916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013164	TAAAT	2	10	46996	47005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_013164	AT	3	6	47081	47086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_013164	TAA	2	6	48647	48652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013164	T	6	6	50474	50479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_013164	TAT	2	6	75450	75455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_013164	GA	4	8	79850	79857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013164	TGA	2	6	89018	89023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013164	ACT	2	6	89042	89047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_013164	TTAA	2	8	89189	89196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_013164	AGG	2	6	92576	92581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_013164	T	7	7	93271	93277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013164	GTA	2	6	93322	93327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_013164	AGA	2	6	93558	93563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_013164	A	6	6	93571	93576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_013164	ACT	2	6	93598	93603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_013164	CTGA	2	8	93650	93657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
302	NC_013164	CTA	2	6	93661	93666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_013164	AAG	2	6	93725	93730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_013164	AAG	2	6	93740	93745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_013164	AAT	2	6	96152	96157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_013164	T	6	6	98142	98147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_013164	T	6	6	98195	98200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.