MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011989	GCGGA	2	10	2451056	2451065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6502	NC_011989	GAAGC	2	10	2454827	2454836	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6503	NC_011989	TC	3	6	2454847	2454852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_011989	ATA	2	6	2455366	2455371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011989	ACAA	2	8	2455875	2455882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6506	NC_011989	T	6	6	2456330	2456335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_011989	TCC	2	6	2457620	2457625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_011989	GCG	2	6	2457656	2457661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_011989	GTT	2	6	2457778	2457783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_011989	TTC	2	6	2457795	2457800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_011989	TTC	2	6	2457850	2457855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011989	AACC	2	8	2457987	2457994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_011989	TCG	3	9	2458036	2458044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_011989	TC	3	6	2458049	2458054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6515	NC_011989	CCG	2	6	2459377	2459382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_011989	TAA	2	6	2460244	2460249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011989	AT	3	6	2460262	2460267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_011989	TGAA	2	8	2460277	2460284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_011989	CTTG	2	8	2460297	2460304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6520	NC_011989	GGA	2	6	2461493	2461498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_011989	GCT	2	6	2461547	2461552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_011989	TCC	2	6	2461606	2461611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_011989	ATAA	2	8	2461644	2461651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_011989	CTA	2	6	2461652	2461657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_011989	CCA	2	6	2461685	2461690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_011989	GCC	2	6	2461745	2461750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_011989	TCAGG	2	10	2461774	2461783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6528	NC_011989	GTT	2	6	2463420	2463425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_011989	CGCA	2	8	2463438	2463445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_011989	GCT	2	6	2463452	2463457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_011989	A	7	7	2463577	2463583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_011989	CGT	2	6	2463652	2463657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_011989	AAC	2	6	2463658	2463663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_011989	GCACAG	2	12	2463704	2463715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_011989	CAA	2	6	2463756	2463761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_011989	T	6	6	2463802	2463807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_011989	T	6	6	2463868	2463873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_011989	GTC	2	6	2463906	2463911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_011989	CAG	3	9	2463980	2463988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_011989	CG	3	6	2463989	2463994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_011989	CACC	2	8	2464119	2464126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6542	NC_011989	ATC	2	6	2464144	2464149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_011989	AGG	2	6	2464218	2464223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_011989	TGAAT	2	10	2468364	2468373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_011989	TCA	2	6	2468430	2468435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_011989	AGG	2	6	2468439	2468444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_011989	GCA	2	6	2470197	2470202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_011989	GT	3	6	2470239	2470244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_011989	GAA	2	6	2472312	2472317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011989	GCG	2	6	2472324	2472329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_011989	CAAT	2	8	2472331	2472338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_011989	CAT	2	6	2472395	2472400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_011989	GCC	2	6	2472416	2472421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_011989	T	7	7	2472525	2472531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_011989	TA	3	6	2472544	2472549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_011989	A	6	6	2472583	2472588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_011989	CTA	2	6	2473367	2473372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_011989	T	6	6	2473386	2473391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_011989	A	6	6	2473456	2473461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_011989	A	6	6	2473514	2473519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011989	TC	3	6	2473573	2473578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_011989	T	6	6	2473580	2473585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_011989	CGG	2	6	2474076	2474081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_011989	AGC	2	6	2474232	2474237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_011989	AT	3	6	2474278	2474283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_011989	AATT	2	8	2474320	2474327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_011989	ACA	2	6	2476130	2476135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_011989	AGC	2	6	2477501	2477506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_011989	CAT	2	6	2478170	2478175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_011989	GCA	2	6	2478187	2478192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_011989	CAA	2	6	2478193	2478198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_011989	CTTC	2	8	2481997	2482004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_011989	CAT	2	6	2482063	2482068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_011989	GCT	2	6	2482159	2482164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_011989	TCGATT	2	12	2482184	2482195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6576	NC_011989	TCG	2	6	2482196	2482201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_011989	GGA	2	6	2482239	2482244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_011989	GCT	2	6	2484280	2484285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_011989	T	6	6	2484651	2484656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_011989	A	6	6	2484804	2484809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_011989	GT	3	6	2484818	2484823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_011989	AC	3	6	2484843	2484848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_011989	CTT	2	6	2484855	2484860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_011989	GGC	2	6	2485754	2485759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_011989	TCG	2	6	2485764	2485769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_011989	TCT	2	6	2486374	2486379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_011989	ACC	2	6	2486383	2486388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_011989	ATG	2	6	2486390	2486395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_011989	AAC	2	6	2487920	2487925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_011989	CCAG	2	8	2488821	2488828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_011989	TCA	2	6	2488884	2488889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_011989	AC	3	6	2488968	2488973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_011989	TACA	2	8	2489044	2489051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_011989	TCAC	2	8	2489073	2489080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_011989	GAC	2	6	2489097	2489102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_011989	CT	3	6	2490586	2490591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6597	NC_011989	AAC	2	6	2490593	2490598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_011989	CCG	2	6	2490689	2490694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_011989	CGG	2	6	2490736	2490741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_011989	TTGG	2	8	2490753	2490760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_011989	TC	3	6	2490770	2490775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_011989	CCA	2	6	2490781	2490786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_011989	TGTA	2	8	2490816	2490823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_011989	CGC	2	6	2490847	2490852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_011989	GAA	2	6	2490874	2490879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_011989	CTT	2	6	2491903	2491908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_011989	GAAA	2	8	2491924	2491931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011989	GGA	2	6	2492020	2492025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_011989	GATC	2	8	2492933	2492940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6610	NC_011989	TGA	2	6	2493056	2493061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_011989	CGGA	2	8	2493064	2493071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6612	NC_011989	GCT	2	6	2493101	2493106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_011989	CCGA	2	8	2493198	2493205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_011989	GCT	2	6	2493245	2493250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_011989	CGG	2	6	2493258	2493263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_011989	TCC	2	6	2493371	2493376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_011989	GGC	2	6	2493404	2493409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_011989	GCC	2	6	2493452	2493457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_011989	CAT	2	6	2499623	2499628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_011989	CG	3	6	2499629	2499634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_011989	CGGG	2	8	2499718	2499725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6622	NC_011989	GCC	2	6	2499787	2499792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_011989	CTTCT	2	10	2499799	2499808	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6624	NC_011989	CGA	2	6	2499907	2499912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_011989	CAC	2	6	2499919	2499924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_011989	TGG	2	6	2499936	2499941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_011989	CGT	2	6	2499946	2499951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_011989	GCA	2	6	2499960	2499965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_011989	TCCA	2	8	2500082	2500089	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6630	NC_011989	GTCG	2	8	2500141	2500148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6632	NC_011989	CGTC	2	8	2500209	2500216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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