MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011984	TC	3	6	101173	101178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_011984	GTT	2	6	101189	101194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011984	TCG	2	6	101200	101205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011984	TC	3	6	101290	101295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_011984	TC	4	8	102509	102516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_011984	GAA	2	6	103129	103134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011984	GC	3	6	103155	103160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_011984	AGA	2	6	103245	103250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011984	CAA	2	6	103287	103292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011984	CGA	2	6	103307	103312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011984	GGT	2	6	103321	103326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011984	GGA	2	6	103414	103419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011984	GCC	2	6	103511	103516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_011984	TCG	2	6	103595	103600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011984	GCA	2	6	103625	103630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011984	GGT	2	6	103653	103658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011984	ACC	2	6	103766	103771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_011984	AAG	2	6	103812	103817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011984	TCG	2	6	103822	103827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011984	ATCG	2	8	103885	103892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_011984	CCAG	2	8	103992	103999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_011984	ATC	2	6	104012	104017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011984	TG	4	8	104047	104054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011984	TCC	2	6	104057	104062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011984	CGG	2	6	104089	104094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011984	CGT	2	6	104123	104128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011984	GAG	2	6	104153	104158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011984	AGG	2	6	106964	106969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011984	CAA	2	6	106977	106982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011984	GCCG	2	8	108037	108044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_011984	CTT	2	6	109597	109602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011984	AT	3	6	109728	109733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011984	CG	3	6	109816	109821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_011984	CCCA	2	8	109836	109843	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
535	NC_011984	GGCC	2	8	109916	109923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_011984	A	6	6	110863	110868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011984	AG	3	6	110943	110948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011984	TC	3	6	111962	111967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_011984	TCGA	2	8	111969	111976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_011984	CGCA	2	8	112008	112015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_011984	CGGC	2	8	113006	113013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_011984	TA	3	6	113015	113020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011984	GGC	2	6	113053	113058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011984	AAAC	2	8	116846	116853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_011984	GGCA	2	8	116865	116872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_011984	CAGC	2	8	116883	116890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_011984	CAG	2	6	116897	116902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011984	GATA	2	8	120091	120098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011984	GTG	2	6	121238	121243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011984	CGAT	2	8	121301	121308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_011984	CCCG	2	8	121339	121346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
552	NC_011984	ACA	2	6	121385	121390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011984	CTT	2	6	121394	121399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011984	CT	3	6	121433	121438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_011984	A	7	7	122624	122630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011984	GGA	2	6	122711	122716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011984	GGC	2	6	122879	122884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011984	GGAC	2	8	122906	122913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_011984	GTGTG	2	10	122921	122930	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011984	TTGCC	2	10	123366	123375	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
561	NC_011984	GGC	2	6	123390	123395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011984	CGC	2	6	123407	123412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_011984	CCT	2	6	123472	123477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_011984	GGA	2	6	123519	123524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011984	AAG	2	6	123536	123541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011984	GGC	2	6	123542	123547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011984	CGGA	2	8	124566	124573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_011984	GGC	2	6	124576	124581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011984	GAGGG	2	10	124584	124593	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011984	GAAGA	2	10	124607	124616	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011984	TC	3	6	124681	124686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_011984	CG	3	6	125766	125771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_011984	GCA	2	6	130904	130909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011984	AGG	2	6	130946	130951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011984	CGC	2	6	130992	130997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_011984	A	8	8	131893	131900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011984	GAT	2	6	131917	131922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011984	AGAAA	2	10	131958	131967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011984	AAG	2	6	131968	131973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011984	CGCTGT	2	12	132010	132021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011984	CTC	2	6	132036	132041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_011984	TCCGC	2	10	132123	132132	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
583	NC_011984	GGAA	2	8	132151	132158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011984	CTC	2	6	134001	134006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_011984	GCC	3	9	134028	134036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_011984	CGG	2	6	134052	134057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011984	TCGC	2	8	136163	136170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_011984	ATC	2	6	136219	136224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011984	TCG	2	6	136225	136230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011984	CGT	2	6	136258	136263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_011984	CGG	2	6	136325	136330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011984	GC	3	6	136360	136365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_011984	GGCC	2	8	136414	136421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_011984	TCC	2	6	136424	136429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011984	TGC	2	6	136435	136440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011984	GGC	2	6	136486	136491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011984	ACC	2	6	136682	136687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_011984	CGG	2	6	137296	137301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011984	GCC	2	6	137332	137337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011984	GGC	2	6	137347	137352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011984	AGAAA	2	10	137392	137401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011984	AG	3	6	137405	137410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011984	TCG	2	6	137442	137447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011984	GCCG	2	8	137459	137466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_011984	TCC	2	6	137487	137492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_011984	CCG	2	6	137523	137528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_011984	CCT	2	6	137576	137581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_011984	AGG	2	6	137586	137591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011984	TGG	2	6	139528	139533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011984	CAGT	2	8	139559	139566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_011984	CGGTG	2	10	139600	139609	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
612	NC_011984	AAGGC	2	10	139620	139629	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
613	NC_011984	GCA	2	6	139635	139640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011984	GAG	2	6	139664	139669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011984	CTG	2	6	139693	139698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011984	CGGT	2	8	139704	139711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_011984	GTG	2	6	139770	139775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011984	GCG	2	6	139805	139810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011984	TGG	2	6	139814	139819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011984	GGTC	2	8	139852	139859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_011984	TTC	2	6	139960	139965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011984	GCC	2	6	139979	139984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_011984	TCC	2	6	140019	140024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_011984	GCG	2	6	140048	140053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011984	CCG	2	6	140465	140470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_011984	GCG	2	6	140617	140622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011984	CTC	2	6	140634	140639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_011984	GGC	2	6	140648	140653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011984	TCC	2	6	140668	140673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_011984	CGC	2	6	140677	140682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_011984	CGG	2	6	140686	140691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011984	CG	3	6	140731	140736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_011984	CGT	2	6	140738	140743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011984	GAC	2	6	140763	140768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_011984	CAT	2	6	140949	140954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011984	GAA	2	6	141316	141321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011984	GTCG	2	8	141380	141387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
638	NC_011984	TGA	2	6	141733	141738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011984	CGC	2	6	141768	141773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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