MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011982	GAA	2	6	202635	202640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011982	TGAGG	2	10	202645	202654	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011982	G	6	6	202689	202694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011982	GATA	2	8	202738	202745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011982	CGTA	2	8	202754	202761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_011982	ATT	2	6	202786	202791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011982	CTG	2	6	202795	202800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011982	TGA	2	6	202809	202814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011982	A	6	6	202814	202819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011982	GCG	2	6	202847	202852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011982	CGTTA	2	10	202917	202926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_011982	ATA	2	6	202995	203000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011982	TGT	2	6	203598	203603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011982	TGTCG	2	10	203669	203678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_011982	GTT	2	6	203742	203747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011982	GCC	2	6	203753	203758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_011982	CTGCG	2	10	203775	203784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_011982	CAA	2	6	203828	203833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011982	GGA	2	6	203837	203842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011982	CGA	2	6	204456	204461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011982	TGA	2	6	204479	204484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011982	CGG	2	6	204515	204520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011982	GCC	2	6	204526	204531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_011982	CTT	2	6	204723	204728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011982	CGG	2	6	204764	204769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011982	GC	3	6	204778	204783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_011982	ATCTG	2	10	204794	204803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_011982	AAG	2	6	204817	204822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011982	TTG	2	6	204851	204856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011982	CCCG	2	8	204919	204926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1031	NC_011982	GA	3	6	204956	204961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011982	TTG	2	6	204968	204973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011982	GA	3	6	205014	205019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011982	AAG	2	6	206226	206231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011982	CGC	3	9	206246	206254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011982	GCC	2	6	206634	206639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_011982	CGC	2	6	206736	206741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_011982	TTCAC	2	10	206755	206764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_011982	GTCA	2	8	206771	206778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_011982	CCT	2	6	206780	206785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_011982	ATCA	2	8	206788	206795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_011982	GGT	2	6	206804	206809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011982	GCAA	2	8	206825	206832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_011982	CCG	2	6	206857	206862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_011982	CCG	2	6	206935	206940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_011982	A	6	6	206974	206979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011982	TTGA	2	8	207017	207024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011982	GCA	2	6	207073	207078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011982	GTC	2	6	207142	207147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011982	AT	3	6	207179	207184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011982	AT	3	6	207254	207259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011982	AT	3	6	207262	207267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011982	TTAT	2	8	207284	207291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011982	GAT	3	9	207292	207300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011982	GAA	3	9	207960	207968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011982	ATA	2	6	207986	207991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011982	AG	3	6	208034	208039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011982	GTC	2	6	208060	208065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011982	AGT	2	6	208075	208080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011982	TTCAA	2	10	209655	209664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_011982	CGAC	2	8	211446	211453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011982	C	6	6	211472	211477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_011982	CGG	2	6	211495	211500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011982	ATC	2	6	211533	211538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011982	GA	3	6	211586	211591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011982	ACG	2	6	211654	211659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011982	AAG	2	6	211684	211689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011982	GC	3	6	211754	211759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_011982	GTC	2	6	211769	211774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011982	GC	3	6	211822	211827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_011982	GCG	2	6	211832	211837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011982	TGC	2	6	211847	211852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011982	TGG	2	6	211885	211890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011982	TCG	2	6	211893	211898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011982	ATG	2	6	211931	211936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011982	CGGG	2	8	211985	211992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_011982	CAG	2	6	212021	212026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011982	AAAGA	2	10	212028	212037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011982	ACG	2	6	212042	212047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011982	AAG	2	6	212053	212058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011982	CCG	2	6	212126	212131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011982	CATG	2	8	212226	212233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_011982	CGAC	2	8	212252	212259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_011982	CTTC	2	8	212271	212278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_011982	GGT	2	6	212320	212325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011982	GTCC	2	8	212359	212366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011982	ATTTC	2	10	212484	212493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_011982	GGC	2	6	212514	212519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011982	T	7	7	212523	212529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011982	ATC	2	6	212676	212681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011982	GC	3	6	212712	212717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011982	TGGCG	2	10	212756	212765	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_011982	TTC	3	9	212776	212784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011982	CTT	2	6	212835	212840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011982	ATC	3	9	212875	212883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011982	CAC	2	6	212974	212979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_011982	C	6	6	213110	213115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_011982	TGG	2	6	213132	213137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011982	TGA	2	6	213176	213181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011982	AAT	2	6	213195	213200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011982	TCG	2	6	213234	213239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011982	AAG	2	6	213244	213249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011982	A	6	6	213250	213255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011982	AAT	2	6	213265	213270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011982	TTGT	2	8	213352	213359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011982	TAA	2	6	213370	213375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011982	ATTA	2	8	213406	213413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011982	AT	3	6	213431	213436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011982	GATG	2	8	213462	213469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011982	ATG	2	6	213473	213478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011982	TTAG	2	8	213486	213493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011982	TA	3	6	213524	213529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011982	ATAA	2	8	213560	213567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011982	T	7	7	215038	215044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011982	TTC	2	6	215196	215201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011982	AGT	2	6	217518	217523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011982	ACGTT	2	10	217562	217571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_011982	T	6	6	217570	217575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011982	TAA	2	6	217589	217594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011982	AAT	2	6	217632	217637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011982	AGT	2	6	217648	217653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011982	TAT	2	6	217657	217662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011982	ATGG	2	8	217664	217671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011982	TTA	2	6	217723	217728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011982	TCT	2	6	217742	217747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011982	TAT	2	6	217771	217776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011982	T	8	8	217781	217788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011982	AT	3	6	217962	217967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011982	TTGC	2	8	218068	218075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_011982	CGC	2	6	218096	218101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_011982	CGAG	2	8	218204	218211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_011982	TGA	2	6	218214	218219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011982	GCCT	2	8	218246	218253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_011982	TGG	2	6	218317	218322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011982	GC	3	6	218339	218344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_011982	ATG	2	6	218376	218381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011982	GTCG	2	8	218411	218418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1271	NC_011982	CTT	2	6	258769	258774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_011982	CAGC	2	8	258794	258801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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