MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 6068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011761	TGG	2	6	325313	325318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011761	GGT	2	6	325340	325345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011761	GTGG	2	8	325391	325398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011761	GGC	2	6	325548	325553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011761	CAC	2	6	325566	325571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_011761	CCCG	2	8	325599	325606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
507	NC_011761	CTT	2	6	325617	325622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_011761	GCC	2	6	325657	325662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_011761	GCC	2	6	325704	325709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_011761	GCA	3	9	325794	325802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011761	GAA	2	6	325816	325821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011761	GTG	2	6	325852	325857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011761	CG	3	6	325952	325957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_011761	GGC	2	6	325962	325967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011761	GTG	2	6	325978	325983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011761	CCA	2	6	326003	326008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_011761	CTG	2	6	326095	326100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011761	G	6	6	326125	326130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011761	CCG	2	6	326141	326146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011761	CTG	2	6	326167	326172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011761	ACC	2	6	326182	326187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_011761	TGG	2	6	326270	326275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011761	GGT	2	6	326331	326336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011761	GCC	2	6	326353	326358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011761	GCG	2	6	326461	326466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011761	TGC	2	6	326531	326536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011761	GTG	2	6	326545	326550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011761	ATC	2	6	326551	326556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011761	TGA	2	6	326573	326578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011761	TGG	2	6	326579	326584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011761	TCG	2	6	326737	326742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011761	CGA	3	9	326865	326873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011761	GC	3	6	326909	326914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_011761	ACG	2	6	326921	326926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011761	CAG	2	6	327030	327035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011761	GCC	2	6	327091	327096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011761	GGTC	2	8	327129	327136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_011761	G	7	7	332857	332863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011761	GA	3	6	332874	332879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011761	AG	3	6	332944	332949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011761	AGC	2	6	333020	333025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011761	TCG	2	6	333034	333039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011761	TG	3	6	333131	333136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011761	GC	3	6	333163	333168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_011761	GAT	2	6	333176	333181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011761	GGC	2	6	333248	333253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011761	AG	3	6	333426	333431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011761	CCA	2	6	333470	333475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_011761	CGA	2	6	333479	333484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011761	GAC	2	6	333504	333509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_011761	GCA	2	6	333553	333558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011761	GAA	2	6	333612	333617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011761	GGA	2	6	333645	333650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011761	AAG	3	9	333694	333702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011761	CAG	2	6	333721	333726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011761	G	6	6	333739	333744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011761	GTG	2	6	333870	333875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011761	GGA	2	6	333912	333917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011761	GGC	2	6	333932	333937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011761	GAA	2	6	334175	334180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011761	TGC	2	6	334253	334258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011761	GTC	2	6	334265	334270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011761	TCGTG	2	10	334274	334283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
564	NC_011761	GGA	2	6	334378	334383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011761	AC	3	6	334429	334434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_011761	AAGCC	2	10	334460	334469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_011761	CGT	2	6	334497	334502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011761	AC	3	6	334598	334603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_011761	AGC	2	6	334638	334643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011761	CCT	2	6	334739	334744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_011761	CA	3	6	334767	334772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_011761	CCA	2	6	334863	334868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_011761	CCA	2	6	334942	334947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011761	GT	3	6	335019	335024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011761	GGAAG	2	10	335122	335131	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011761	AT	3	6	335182	335187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011761	AAGC	2	8	335278	335285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_011761	CCAG	2	8	335316	335323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011761	GT	3	6	335356	335361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011761	GTA	2	6	335426	335431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011761	GCG	2	6	335432	335437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011761	AGC	2	6	335449	335454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011761	ATG	2	6	335459	335464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011761	G	6	6	335595	335600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011761	TCC	2	6	335605	335610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_011761	ACTT	2	8	335774	335781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_011761	CAGA	2	8	336125	336132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_011761	CGG	2	6	336133	336138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011761	CGTC	2	8	336146	336153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_011761	AGG	2	6	336239	336244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011761	AGC	2	6	336255	336260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011761	AAAG	2	8	336269	336276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011761	AGTCG	2	10	336291	336300	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
594	NC_011761	CG	3	6	336304	336309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_011761	GT	3	6	336350	336355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011761	GT	3	6	336400	336405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011761	ACC	2	6	336471	336476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_011761	GTCAA	2	10	336503	336512	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
599	NC_011761	TCT	2	6	336667	336672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011761	TGA	2	6	336704	336709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011761	GGA	2	6	336721	336726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011761	AGTG	2	8	336729	336736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011761	TGA	2	6	336777	336782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011761	GAA	2	6	336812	336817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011761	GA	3	6	336833	336838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011761	GAA	2	6	336880	336885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011761	GGA	2	6	336916	336921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011761	CGG	2	6	337076	337081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011761	ATG	2	6	337152	337157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011761	TAC	2	6	337250	337255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011761	GAT	2	6	337276	337281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011761	TGG	2	6	337326	337331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011761	ACC	2	6	337347	337352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_011761	TGG	2	6	337407	337412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011761	TCC	2	6	337433	337438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_011761	GGA	2	6	337450	337455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011761	AGTG	2	8	337492	337499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011761	GACA	2	8	337527	337534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_011761	GGT	2	6	337570	337575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011761	C	6	6	337636	337641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_011761	CGT	2	6	337765	337770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011761	GAAG	2	8	337812	337819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011761	GTT	2	6	337868	337873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011761	AT	3	6	338075	338080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011761	CCTTC	2	10	338105	338114	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
626	NC_011761	GACCA	2	10	338149	338158	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
627	NC_011761	GGC	2	6	338174	338179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011761	ACC	2	6	338194	338199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_011761	GTT	2	6	338328	338333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011761	T	6	6	338332	338337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011761	ATG	2	6	338353	338358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011761	A	6	6	338362	338367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011761	AG	3	6	338882	338887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011761	ATGT	2	8	340399	340406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011761	GAG	2	6	344362	344367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011761	GA	3	6	344647	344652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011761	CCG	2	6	346743	346748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_011761	CGT	2	6	346762	346767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011761	GTG	2	6	348874	348879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011761	CGC	3	9	348901	348909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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642	NC_011761	GAT	2	6	356725	356730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_011761	CGT	2	6	356791	356796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_011761	GA	3	6	385302	385307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
683	NC_011761	GC	3	6	390465	390470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_011761	GCC	2	6	390590	390595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_011761	GAA	2	6	435024	435029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
768	NC_011761	GCGG	2	8	435056	435063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
769	NC_011761	CCG	2	6	435096	435101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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