MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 6068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011761	TG	3	6	2945972	2945977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011761	TGG	2	6	2946032	2946037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011761	TGGCA	2	10	2946063	2946072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6004	NC_011761	GGC	2	6	2946415	2946420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_011761	CTGCC	2	10	2946867	2946876	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6006	NC_011761	GCA	2	6	2946898	2946903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_011761	A	6	6	2947010	2947015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011761	ATG	2	6	2948681	2948686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011761	CAT	2	6	2948694	2948699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_011761	A	6	6	2948716	2948721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011761	ATC	2	6	2948772	2948777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_011761	TGA	2	6	2948883	2948888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_011761	AT	3	6	2948984	2948989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011761	AACT	2	8	2949001	2949008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_011761	ATCA	2	8	2949015	2949022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_011761	ACA	2	6	2949079	2949084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011761	TGA	2	6	2949119	2949124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011761	TAAA	2	8	2949154	2949161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011761	AAAG	2	8	2949165	2949172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_011761	TCT	2	6	2949254	2949259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_011761	TAA	2	6	2949262	2949267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_011761	TTA	2	6	2949335	2949340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_011761	TAA	2	6	2949358	2949363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_011761	AAAT	2	8	2949403	2949410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_011761	ATG	2	6	2949456	2949461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011761	TAC	2	6	2949467	2949472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_011761	TCGG	2	8	2949633	2949640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_011761	CCCG	2	8	2949865	2949872	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6029	NC_011761	AG	3	6	2949909	2949914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011761	CAA	2	6	2949961	2949966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_011761	CGTA	2	8	2950043	2950050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_011761	AGT	2	6	2950118	2950123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_011761	AAG	3	9	2950182	2950190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_011761	TCT	2	6	2950192	2950197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_011761	GAA	2	6	2950229	2950234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011761	AGC	2	6	2950291	2950296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011761	T	6	6	2950355	2950360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011761	G	6	6	2950436	2950441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011761	T	7	7	2950498	2950504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011761	GGA	2	6	2953709	2953714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_011761	GCC	3	9	2953725	2953733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_011761	CAGGA	2	10	2953784	2953793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6043	NC_011761	CCA	2	6	2956655	2956660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_011761	GCA	2	6	2956728	2956733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_011761	GAG	2	6	2956759	2956764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011761	ACGGA	2	10	2963115	2963124	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6047	NC_011761	CCG	2	6	2965709	2965714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_011761	ATT	2	6	2965776	2965781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011761	CTG	2	6	2965790	2965795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_011761	ATG	2	6	2965865	2965870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_011761	AGGT	2	8	2970696	2970703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_011761	CGA	2	6	2970807	2970812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011761	GAC	2	6	2973975	2973980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_011761	TCGGC	2	10	2975701	2975710	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6055	NC_011761	TGA	3	9	2975716	2975724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_011761	GAA	2	6	2975731	2975736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_011761	TCC	2	6	2976065	2976070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_011761	C	6	6	2976083	2976088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6059	NC_011761	GC	3	6	2976109	2976114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_011761	TCC	2	6	2979286	2979291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_011761	CAA	2	6	2979489	2979494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_011761	TTC	2	6	2979534	2979539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011761	GGC	2	6	2979548	2979553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_011761	TATTC	2	10	2980429	2980438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6065	NC_011761	ATGT	2	8	2980562	2980569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011761	T	6	6	2980569	2980574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011761	T	7	7	2982272	2982278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011761	CTA	2	6	2982354	2982359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.