MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 5911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011313	CATT	2	8	302910	302917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_011313	AG	3	6	302937	302942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011313	TGG	2	6	302984	302989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011313	AATC	2	8	303018	303025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_011313	CG	3	6	303096	303101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_011313	A	6	6	303129	303134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011313	GAA	2	6	303135	303140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011313	AG	4	8	303182	303189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011313	AATTC	2	10	303336	303345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_011313	AAG	2	6	303361	303366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011313	AAG	2	6	303484	303489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011313	GAA	3	9	303549	303557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011313	CAG	2	6	303582	303587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011313	TGG	2	6	303596	303601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011313	GTG	2	6	303705	303710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011313	TCA	2	6	303755	303760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011313	A	7	7	303782	303788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011313	TAT	2	6	303807	303812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011313	CAAA	2	8	303876	303883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_011313	ATG	2	6	303907	303912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011313	TAT	2	6	303936	303941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011313	CATC	2	8	303973	303980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_011313	A	6	6	304003	304008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011313	GA	3	6	304046	304051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011313	TGT	2	6	304107	304112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011313	ATGA	2	8	304143	304150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011313	AATTC	2	10	304152	304161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_011313	CTG	2	6	304168	304173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_011313	GCATT	2	10	305148	305157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1530	NC_011313	TGG	2	6	305185	305190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011313	GTG	2	6	305319	305324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011313	CGA	2	6	305426	305431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_011313	AAC	3	9	305542	305550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011313	TAA	2	6	305585	305590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011313	TGA	2	6	305612	305617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011313	GATC	2	8	305643	305650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_011313	CAT	2	6	305676	305681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011313	TTCT	2	8	305731	305738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_011313	ATA	2	6	305761	305766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011313	TAT	2	6	305776	305781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011313	TTAT	2	8	305890	305897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011313	TA	3	6	306036	306041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011313	CGG	2	6	306133	306138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011313	ATT	2	6	306200	306205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011313	CGC	2	6	306323	306328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_011313	TAA	2	6	306356	306361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011313	ATT	2	6	306591	306596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011313	GTTG	2	8	306647	306654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011313	AGT	2	6	306737	306742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011313	AT	3	6	306782	306787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011313	AT	3	6	306790	306795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011313	CAATAA	2	12	308014	308025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1553	NC_011313	T	7	7	309366	309372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011313	AAAT	2	8	309378	309385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011313	TATT	2	8	309412	309419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011313	A	6	6	309438	309443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011313	TTA	2	6	311636	311641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011313	AGT	2	6	311677	311682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011313	T	6	6	311687	311692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011313	TAA	2	6	311696	311701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011313	TAA	2	6	311729	311734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011313	TTTA	2	8	311760	311767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011313	AT	3	6	311778	311783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011313	GAA	2	6	311808	311813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011313	ATA	2	6	313242	313247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011313	T	7	7	313265	313271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011313	GTAA	2	8	313283	313290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011313	ATT	2	6	313327	313332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011313	GTG	2	6	313343	313348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011313	AT	3	6	313354	313359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011313	TTTTA	2	10	313373	313382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011313	TTA	2	6	313448	313453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011313	ATT	2	6	313456	313461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011313	CAT	2	6	313475	313480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011313	TGA	2	6	313543	313548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011313	AGA	2	6	313589	313594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011313	GTA	2	6	313599	313604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011313	GCA	2	6	313689	313694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_011313	AG	3	6	313748	313753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011313	GCG	2	6	313773	313778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_011313	GTT	2	6	313791	313796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011313	AAC	2	6	313830	313835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011313	AGA	2	6	313909	313914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011313	TTCA	2	8	313925	313932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_011313	ATT	2	6	313967	313972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011313	ATG	2	6	314013	314018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011313	TTC	2	6	314094	314099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_011313	GTC	2	6	314116	314121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011313	TTG	2	6	314131	314136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011313	TGA	2	6	314189	314194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011313	ATG	2	6	314203	314208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011313	GCA	2	6	314301	314306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011313	AGA	2	6	314309	314314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011313	CAA	4	12	314352	314363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011313	GCT	2	6	314385	314390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_011313	GAA	2	6	314469	314474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011313	TCAA	2	8	314498	314505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_011313	ACA	2	6	314584	314589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_011313	CGC	2	6	314651	314656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_011313	CG	3	6	314666	314671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_011313	TGT	2	6	314699	314704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011313	GTTC	2	8	314715	314722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_011313	CAAG	2	8	314781	314788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_011313	TGC	2	6	314789	314794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_011313	TCAA	2	8	314867	314874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_011313	GAA	2	6	314886	314891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011313	ATG	2	6	314895	314900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011313	AAGTG	2	10	315002	315011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011313	CAA	2	6	315075	315080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_011313	AC	3	6	315108	315113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_011313	A	7	7	315134	315140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011313	TTGT	2	8	316589	316596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011313	TTTTA	2	10	317542	317551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011313	AAT	2	6	318183	318188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011313	TTTA	2	8	318237	318244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011313	AAAGAA	2	12	318255	318266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011313	AAG	2	6	318285	318290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011313	ATA	2	6	318350	318355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011313	GAAG	2	8	321533	321540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011313	TCT	2	6	321561	321566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011313	TTA	2	6	321593	321598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011313	TAA	2	6	321611	321616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011313	TAA	2	6	321665	321670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011313	TTTGG	2	10	321674	321683	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011313	GTG	2	6	321687	321692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011313	CTT	2	6	321812	321817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011313	CTTG	2	8	321821	321828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_011313	TTAG	2	8	321835	321842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011313	TTCTAG	2	12	321852	321863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1630	NC_011313	TGT	2	6	321902	321907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011313	TA	3	6	322054	322059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011313	TTA	2	6	322082	322087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011313	A	6	6	322183	322188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011313	AT	3	6	322192	322197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011313	ATA	2	6	322238	322243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011313	TAG	2	6	322265	322270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_011313	A	6	6	434711	434716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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