MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 5911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011313	AG	3	6	202925	202930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011313	GTTTG	2	10	202946	202955	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011313	A	6	6	203361	203366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011313	T	6	6	203387	203392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011313	CTTT	2	8	204329	204336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_011313	ATTTG	2	10	204349	204358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011313	ATA	2	6	205475	205480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011313	A	6	6	205494	205499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011313	GAA	2	6	205504	205509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011313	GAT	2	6	205544	205549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011313	TAT	2	6	205572	205577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011313	TAAA	2	8	205585	205592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011313	TA	3	6	205630	205635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011313	ATT	2	6	205645	205650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011313	GCT	2	6	205675	205680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011313	T	6	6	207080	207085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011313	TCT	2	6	207119	207124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011313	TAT	2	6	207217	207222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011313	AAT	2	6	207235	207240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011313	ATA	2	6	207283	207288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011313	AC	4	8	207373	207380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_011313	ATA	2	6	207410	207415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011313	ATT	2	6	207465	207470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011313	ATTTT	2	10	207517	207526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011313	AAAT	2	8	207527	207534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011313	TC	3	6	208411	208416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_011313	A	6	6	208423	208428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011313	GAA	2	6	208466	208471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011313	A	6	6	208470	208475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011313	ATTG	2	8	208495	208502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011313	CTT	2	6	210910	210915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011313	ATA	2	6	210918	210923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011313	ATT	3	9	210946	210954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011313	ATA	2	6	210966	210971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011313	ATT	2	6	210984	210989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011313	ACT	2	6	211001	211006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011313	TAA	2	6	211047	211052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011313	TAAT	2	8	211063	211070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011313	G	6	6	211192	211197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011313	GGC	2	6	211211	211216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011313	TCAAT	2	10	211282	211291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_011313	AT	3	6	211321	211326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011313	TGATAA	2	12	212273	212284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011313	ATT	2	6	212298	212303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011313	GTT	2	6	212692	212697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011313	ATT	2	6	212733	212738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011313	AAAC	2	8	212748	212755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_011313	TAA	2	6	212774	212779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011313	AAC	2	6	212918	212923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011313	TC	3	6	212934	212939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_011313	ATT	2	6	212946	212951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011313	TAC	2	6	212958	212963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011313	CAA	2	6	213064	213069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011313	CAC	2	6	213098	213103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_011313	GGCGT	2	10	213163	213172	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_011313	AAG	2	6	213212	213217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011313	TAT	2	6	213296	213301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011313	A	6	6	213309	213314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011313	CCT	2	6	213319	213324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_011313	TAAT	2	8	213398	213405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011313	ACAAAA	2	12	213406	213417	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1062	NC_011313	GAAT	2	8	213489	213496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011313	GGTT	2	8	213501	213508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011313	TTAT	2	8	213521	213528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011313	ACA	2	6	213531	213536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011313	ACA	2	6	213541	213546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011313	TCCAT	2	10	213603	213612	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_011313	ATTAA	2	10	213663	213672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011313	CAA	2	6	213856	213861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011313	GTT	2	6	213867	213872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011313	ATC	2	6	213875	213880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011313	AAG	2	6	213924	213929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011313	CAC	2	6	213955	213960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_011313	ACA	2	6	213961	213966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011313	ATT	2	6	213971	213976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011313	TTTG	2	8	213998	214005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011313	AAT	2	6	214006	214011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011313	TTTA	2	8	214085	214092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011313	TGG	2	6	214192	214197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011313	CTT	2	6	214264	214269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011313	T	6	6	214313	214318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011313	A	6	6	214401	214406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011313	T	7	7	214426	214432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011313	CAA	2	6	215742	215747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_011313	GTT	2	6	215942	215947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011313	TCA	2	6	215948	215953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011313	GTT	2	6	215967	215972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011313	TTA	2	6	215996	216001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011313	TTA	2	6	216027	216032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011313	AAT	2	6	216058	216063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011313	TAA	2	6	216129	216134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011313	T	7	7	216221	216227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011313	GCAT	2	8	216323	216330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_011313	ATA	2	6	216374	216379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011313	TG	3	6	216446	216451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011313	TCA	2	6	216452	216457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011313	ATG	2	6	216464	216469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011313	TCT	3	9	216473	216481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011313	GAGTC	2	10	216504	216513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_011313	AGA	2	6	216566	216571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011313	TATT	2	8	216578	216585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011313	TTTTA	2	10	216637	216646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011313	TA	3	6	216664	216669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011313	ATA	2	6	216673	216678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011313	AATC	2	8	216684	216691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_011313	CCT	2	6	216697	216702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_011313	ATT	2	6	217452	217457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011313	AGA	2	6	218626	218631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011313	A	6	6	218726	218731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011313	TGG	2	6	218797	218802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011313	ATA	2	6	218938	218943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011313	T	7	7	218994	219000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011313	TGT	2	6	220480	220485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011313	AAT	2	6	220504	220509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011313	ACG	2	6	220512	220517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011313	CTTT	2	8	220565	220572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_011313	CGACA	2	10	220599	220608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_011313	AG	3	6	220683	220688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011313	TGACGC	2	12	220714	220725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011313	TAA	2	6	220764	220769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011313	CGT	2	6	220893	220898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011313	CAC	2	6	220987	220992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_011313	CTT	2	6	221032	221037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011313	TAA	2	6	221039	221044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011313	TCA	3	9	221061	221069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011313	TCT	2	6	221181	221186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011313	TAT	2	6	221281	221286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011313	ATC	2	6	221319	221324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011313	T	7	7	221692	221698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011313	TAA	2	6	221713	221718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011313	TATTG	2	10	221746	221755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011313	AAG	2	6	221783	221788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011313	CAA	2	6	223857	223862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011313	TAA	2	6	223880	223885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011313	ATT	2	6	223942	223947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011313	AAT	2	6	223960	223965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011313	CTT	2	6	223981	223986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1269	NC_011313	ATA	2	6	245938	245943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_011313	AATC	2	8	245949	245956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1271	NC_011313	CCT	2	6	245962	245967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1273	NC_011313	TA	4	8	246891	246898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_011313	ATG	2	6	283885	283890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_011313	GTC	2	6	283936	283941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_011313	TCG	2	6	283970	283975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_011313	A	6	6	284004	284009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_011313	AGA	2	6	284087	284092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_011313	GCT	2	6	284115	284120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_011313	TCA	2	6	284173	284178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_011313	TTG	2	6	284354	284359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_011313	A	7	7	285669	285675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_011313	T	6	6	285695	285700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_011313	AAG	2	6	285804	285809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_011313	GCAA	2	8	285838	285845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_011313	TG	3	6	285967	285972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_011313	GTT	2	6	286046	286051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1428	NC_011313	TG	3	6	286126	286131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_011313	TAT	2	6	286158	286163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_011313	AAT	2	6	286169	286174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_011313	AC	3	6	286179	286184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_011313	AT	3	6	286210	286215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_011313	T	6	6	286281	286286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_011313	A	6	6	286297	286302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_011313	CGCT	2	8	286534	286541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_011313	CAT	2	6	286572	286577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_011313	TCTG	2	8	286709	286716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1438	NC_011313	TAA	2	6	286753	286758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_011313	TCG	2	6	286852	286857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1440	NC_011313	CGTG	2	8	286859	286866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1441	NC_011313	GTT	2	6	287096	287101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_011313	TCA	2	6	287102	287107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_011313	GTT	2	6	287121	287126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_011313	TTA	2	6	287181	287186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_011313	AAT	2	6	287212	287217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_011313	TAA	2	6	287283	287288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_011313	T	7	7	287375	287381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_011313	GCAT	2	8	287477	287484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1450	NC_011313	ATA	2	6	287528	287533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_011313	TG	3	6	287600	287605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_011313	TCA	2	6	287606	287611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_011313	ATG	2	6	287618	287623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_011313	TCT	3	9	287627	287635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_011313	AGA	2	6	287720	287725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_011313	TATT	2	8	287732	287739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_011313	TTTTA	2	10	287791	287800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_011313	TA	3	6	287818	287823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_011313	ATA	2	6	287827	287832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_011313	CCT	2	6	287851	287856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1463	NC_011313	ATT	2	6	288606	288611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_011313	TGA	3	9	289627	289635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1466	NC_011313	AATC	2	8	291482	291489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1467	NC_011313	AAT	2	6	291490	291495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_011313	ATT	2	6	291513	291518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_011313	TACC	2	8	292367	292374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1473	NC_011313	TG	3	6	293728	293733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_011313	TA	3	6	294750	294755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_011313	AAT	2	6	294806	294811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_011313	AAGT	2	8	294829	294836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1490	NC_011313	ATA	2	6	301893	301898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_011313	TACG	2	8	302816	302823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1500	NC_011313	AGCA	2	8	302881	302888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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