MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 5911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011313	TGC	2	6	1063133	1063138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_011313	CCA	2	6	1063153	1063158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_011313	CTG	2	6	1063201	1063206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_011313	AG	3	6	1063346	1063351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011313	TTA	2	6	1063365	1063370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011313	AAT	2	6	1063464	1063469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011313	GGT	2	6	1063491	1063496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011313	AGG	2	6	1063502	1063507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011313	TGG	2	6	1063511	1063516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011313	CAA	2	6	1063572	1063577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_011313	AGA	2	6	1063595	1063600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011313	AGC	2	6	1063681	1063686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011313	TATC	2	8	1063704	1063711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_011313	CG	3	6	1063807	1063812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_011313	GTG	2	6	1063819	1063824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_011313	TGA	2	6	1063838	1063843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011313	TAGAA	2	10	1063868	1063877	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011313	TCA	2	6	1063901	1063906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011313	GTG	2	6	1063921	1063926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011313	CGG	2	6	1064015	1064020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011313	TGAA	2	8	1064056	1064063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011313	CCA	2	6	1064082	1064087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_011313	CAT	2	6	1064093	1064098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011313	CGC	2	6	1064156	1064161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_011313	ACC	2	6	1064397	1064402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_011313	TC	3	6	1064431	1064436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_011313	TCC	2	6	1064528	1064533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_011313	ATT	2	6	1064547	1064552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011313	ATA	2	6	1064641	1064646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011313	TTA	2	6	1064653	1064658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011313	AAAT	2	8	1064707	1064714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011313	TAGTT	2	10	1064741	1064750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011313	ACG	2	6	1064918	1064923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011313	AGC	2	6	1064983	1064988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_011313	AAC	2	6	1064989	1064994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_011313	GTG	2	6	1065018	1065023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011313	CTC	2	6	1065138	1065143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_011313	TTC	2	6	1065144	1065149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011313	TA	3	6	1066685	1066690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011313	ATA	2	6	1066694	1066699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011313	AATC	2	8	1066705	1066712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_011313	CCT	2	6	1066718	1066723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_011313	CAGA	2	8	1067507	1067514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_011313	TGA	2	6	1067644	1067649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011313	AGCG	2	8	1067682	1067689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_011313	AGG	2	6	1067926	1067931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011313	GT	3	6	1068004	1068009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011313	TTGT	2	8	1069001	1069008	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011313	ATT	2	6	1069084	1069089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011313	TGTTC	2	10	1069208	1069217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_011313	ATC	2	6	1069233	1069238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_011313	ATC	2	6	1069264	1069269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011313	ACTT	2	8	1069286	1069293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_011313	AGG	2	6	1070117	1070122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011313	ATT	2	6	1070166	1070171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011313	TTC	2	6	1071123	1071128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011313	AT	3	6	1071185	1071190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011313	A	6	6	1071929	1071934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011313	TTA	2	6	1071947	1071952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011313	T	6	6	1071963	1071968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011313	TGAA	2	8	1074807	1074814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011313	TATTAA	2	12	1074835	1074846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011313	T	6	6	1074870	1074875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011313	TCA	2	6	1074913	1074918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011313	GAG	2	6	1074939	1074944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011313	ATA	2	6	1074956	1074961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011313	TCA	2	6	1074997	1075002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_011313	ATTA	2	8	1075017	1075024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011313	ATT	2	6	1075032	1075037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011313	TGA	2	6	1076011	1076016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011313	A	7	7	1076019	1076025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011313	AGG	2	6	1076037	1076042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011313	AGA	2	6	1076132	1076137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011313	TTC	2	6	1077129	1077134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011313	TAG	2	6	1077144	1077149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011313	AC	3	6	1077163	1077168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_011313	A	6	6	1077169	1077174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_011313	T	6	6	1077240	1077245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011313	TCTT	2	8	1077288	1077295	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_011313	TGTTT	2	10	1077301	1077310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011313	GAT	2	6	1077463	1077468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011313	TTTA	2	8	1077470	1077477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011313	AAG	2	6	1077505	1077510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011313	AATA	3	12	1077519	1077530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011313	T	6	6	1077573	1077578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011313	ATT	2	6	1077583	1077588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011313	TAAG	2	8	1077633	1077640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011313	A	7	7	1077675	1077681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011313	T	7	7	1077697	1077703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011313	T	6	6	1077741	1077746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011313	ATTT	2	8	1077754	1077761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_011313	ATTT	2	8	1077769	1077776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_011313	T	6	6	1077774	1077779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011313	AAAT	2	8	1077783	1077790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011313	T	6	6	1077874	1077879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011313	GTAT	2	8	1077880	1077887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_011313	TAT	2	6	1077916	1077921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011313	TAAAT	2	10	1077928	1077937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011313	ATTT	2	8	1077967	1077974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011313	TAA	2	6	1077982	1077987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011313	GTTT	2	8	1078000	1078007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011313	TTAG	2	8	1078011	1078018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011313	ATT	2	6	1078080	1078085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011313	AAT	2	6	1078086	1078091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011313	AGT	2	6	1078092	1078097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011313	TTAAT	2	10	1078107	1078116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011313	CTT	2	6	1080361	1080366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011313	TAC	2	6	1081968	1081973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_011313	T	6	6	1081989	1081994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_011313	AAAC	2	8	1081996	1082003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_011313	TAA	2	6	1082690	1082695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011313	AGT	2	6	1082746	1082751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011313	AAT	2	6	1082753	1082758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011313	CCA	2	6	1082868	1082873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_011313	ATT	2	6	1082967	1082972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011313	A	7	7	1083014	1083020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011313	GAT	2	6	1083042	1083047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011313	AAAT	2	8	1083068	1083075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011313	ATA	2	6	1083082	1083087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011313	TGG	2	6	1083089	1083094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011313	AAG	2	6	1083113	1083118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011313	TG	3	6	1083170	1083175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011313	ACT	2	6	1083213	1083218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_011313	CAAG	2	8	1083243	1083250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_011313	TGTT	2	8	1083253	1083260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011313	A	6	6	1083287	1083292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011313	AT	3	6	1083316	1083321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011313	ATC	2	6	1083451	1083456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_011313	AG	3	6	1083464	1083469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011313	TTTA	2	8	1083481	1083488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011313	TAA	2	6	1083593	1083598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_011313	A	7	7	1083652	1083658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5379	NC_011313	TA	3	6	1114449	1114454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_011313	AAT	2	6	1115994	1115999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_011313	CAA	2	6	1116051	1116056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5382	NC_011313	TCC	2	6	1116779	1116784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5383	NC_011313	CATC	2	8	1116790	1116797	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5384	NC_011313	TTA	2	6	1117970	1117975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_011313	AT	4	8	1117982	1117989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_011313	ACA	2	6	1117993	1117998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5387	NC_011313	TTAT	2	8	1118066	1118073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_011313	ATA	2	6	1118928	1118933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_011313	ATG	2	6	1118967	1118972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_011313	ATC	2	6	1119026	1119031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_011313	TAA	2	6	1119034	1119039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_011313	AT	3	6	1119043	1119048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_011313	A	6	6	1119061	1119066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_011313	ACG	2	6	1119174	1119179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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