MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011312	ATG	2	6	2429033	2429038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_011312	AAG	2	6	2429043	2429048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_011312	T	6	6	2429092	2429097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_011312	GTTT	2	8	2429106	2429113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_011312	T	7	7	2429111	2429117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_011312	TA	3	6	2429151	2429156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_011312	TTAC	2	8	2429281	2429288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12508	NC_011312	ACA	2	6	2429295	2429300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011312	CAA	2	6	2429329	2429334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_011312	TAAC	2	8	2429378	2429385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_011312	A	7	7	2429465	2429471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_011312	AGA	2	6	2429473	2429478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_011312	TAC	2	6	2429489	2429494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_011312	TTAC	2	8	2429500	2429507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12515	NC_011312	GGAGT	2	10	2429548	2429557	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_011312	TGA	2	6	2429568	2429573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_011312	TTG	2	6	2429594	2429599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_011312	TAA	2	6	2429625	2429630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_011312	ATTTA	2	10	2429637	2429646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_011312	AAG	2	6	2429652	2429657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_011312	ACA	2	6	2429667	2429672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_011312	TCA	2	6	2429738	2429743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_011312	AGC	2	6	2429808	2429813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_011312	ATC	2	6	2429823	2429828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_011312	TGG	2	6	2429853	2429858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_011312	TAG	2	6	2429933	2429938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_011312	TGATAA	2	12	2429967	2429978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_011312	GAT	2	6	2429980	2429985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_011312	CAA	3	9	2429989	2429997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_011312	TTCA	2	8	2430129	2430136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12531	NC_011312	CTT	2	6	2430236	2430241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_011312	GTTT	2	8	2430288	2430295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_011312	TAAGG	2	10	2430340	2430349	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_011312	TAA	2	6	2430354	2430359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_011312	GAAA	2	8	2430361	2430368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_011312	A	8	8	2430366	2430373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_011312	G	6	6	2430389	2430394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_011312	ACG	2	6	2430395	2430400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_011312	TGC	2	6	2430427	2430432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_011312	T	7	7	2430520	2430526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_011312	GTT	3	9	2430588	2430596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_011312	TCAAT	2	10	2430653	2430662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12543	NC_011312	T	8	8	2430689	2430696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_011312	TTAT	2	8	2430734	2430741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_011312	A	7	7	2430763	2430769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_011312	AGTT	2	8	2430796	2430803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_011312	ATA	2	6	2430819	2430824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_011312	GAT	2	6	2433615	2433620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_011312	T	7	7	2433650	2433656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_011312	AGG	2	6	2434431	2434436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_011312	GATT	2	8	2434442	2434449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_011312	TAT	2	6	2434455	2434460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_011312	TA	3	6	2434464	2434469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_011312	GT	3	6	2435985	2435990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_011312	GTT	2	6	2436002	2436007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_011312	TTAT	2	8	2436008	2436015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_011312	TTGA	2	8	2436110	2436117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_011312	TCT	2	6	2436176	2436181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_011312	GCG	2	6	2436221	2436226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_011312	ATG	2	6	2436254	2436259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_011312	CCT	2	6	2436410	2436415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_011312	GGT	2	6	2436445	2436450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_011312	AG	3	6	2436586	2436591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_011312	TGC	2	6	2436679	2436684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_011312	C	6	6	2436684	2436689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12566	NC_011312	T	6	6	2436759	2436764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_011312	TA	3	6	2438357	2438362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_011312	ATA	2	6	2438366	2438371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_011312	AATC	2	8	2438377	2438384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12570	NC_011312	CCT	2	6	2438390	2438395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_011312	GTT	2	6	2438426	2438431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_011312	TGC	2	6	2438489	2438494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_011312	TTAT	2	8	2438516	2438523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_011312	CAATA	2	10	2438591	2438600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12575	NC_011312	TGG	2	6	2438738	2438743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_011312	TGA	2	6	2439172	2439177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12578	NC_011312	T	6	6	2439256	2439261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_011312	TGAA	2	8	2439286	2439293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_011312	TTC	2	6	2439373	2439378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_011312	AGG	2	6	2439418	2439423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_011312	ACA	2	6	2439490	2439495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_011312	ACGCA	2	10	2439521	2439530	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12584	NC_011312	CTTA	2	8	2439544	2439551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12585	NC_011312	GCAA	2	8	2439572	2439579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12586	NC_011312	CTT	3	9	2439604	2439612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_011312	T	7	7	2439642	2439648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_011312	ATC	2	6	2439661	2439666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_011312	TCA	2	6	2439761	2439766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12592	NC_011312	TTG	2	6	2439934	2439939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_011312	TCA	2	6	2439971	2439976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_011312	TCG	2	6	2439978	2439983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_011312	T	6	6	2440014	2440019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_011312	AAT	2	6	2440032	2440037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_011312	CAT	2	6	2440122	2440127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_011312	TTTC	2	8	2440158	2440165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12599	NC_011312	ATA	2	6	2440280	2440285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_011312	CAT	2	6	2440344	2440349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_011312	TTA	2	6	2440385	2440390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_011312	CCA	2	6	2440424	2440429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_011312	T	8	8	2440452	2440459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_011312	CTTTTT	2	12	2440476	2440487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12605	NC_011312	AAC	2	6	2440556	2440561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_011312	T	6	6	2440582	2440587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_011312	CT	3	6	2440616	2440621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12608	NC_011312	T	6	6	2440657	2440662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_011312	TGCT	2	8	2440666	2440673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12610	NC_011312	GA	3	6	2440683	2440688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_011312	CTTT	2	8	2440755	2440762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_011312	T	6	6	2440840	2440845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_011312	ATA	2	6	2440871	2440876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_011312	GTA	2	6	2440887	2440892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_011312	TCC	2	6	2440921	2440926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_011312	TCA	2	6	2440982	2440987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_011312	AAT	2	6	2441093	2441098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_011312	AAT	2	6	2441203	2441208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_011312	TTTC	2	8	2441220	2441227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12620	NC_011312	TCA	2	6	2441243	2441248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_011312	T	6	6	2441295	2441300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_011312	AGCCA	2	10	2441321	2441330	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12623	NC_011312	CA	3	6	2441351	2441356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12624	NC_011312	TTA	2	6	2441375	2441380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_011312	TAAC	2	8	2442807	2442814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_011312	TAG	2	6	2442839	2442844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_011312	CTG	2	6	2442867	2442872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12628	NC_011312	AATA	2	8	2442873	2442880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_011312	A	9	9	2442901	2442909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12630	NC_011312	A	6	6	2442935	2442940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12631	NC_011312	AAAGT	2	10	2442988	2442997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12632	NC_011312	TAC	2	6	2443116	2443121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12634	NC_011312	ATGA	2	8	2443133	2443140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12754	NC_011312	TAA	2	6	2491108	2491113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12755	NC_011312	AAGT	2	8	2491189	2491196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12756	NC_011312	ATC	2	6	2492463	2492468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12757	NC_011312	ACTTA	2	10	2492475	2492484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12758	NC_011312	T	6	6	2492522	2492527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12887	NC_011312	CAGG	2	8	2514554	2514561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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