MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 6106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011206	GT	3	6	514918	514923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011206	ACC	2	6	514989	514994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_011206	GTCAA	2	10	515021	515030	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_011206	TCT	2	6	515185	515190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011206	TGA	2	6	515222	515227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011206	GGA	2	6	515239	515244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011206	AGTG	2	8	515247	515254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011206	TGA	2	6	515295	515300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011206	GAA	2	6	515330	515335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011206	GA	3	6	515351	515356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011206	GAA	2	6	515398	515403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011206	GGA	2	6	515434	515439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011206	CGG	2	6	515594	515599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011206	ATG	2	6	515670	515675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011206	TAC	2	6	515768	515773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011206	GAT	2	6	515794	515799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011206	TGG	2	6	515844	515849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011206	ACC	2	6	515865	515870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_011206	TGG	2	6	515925	515930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011206	TCC	2	6	515951	515956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_011206	GGA	2	6	515968	515973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011206	AGTG	2	8	516010	516017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011206	GACA	2	8	516045	516052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_011206	GGT	2	6	516088	516093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011206	C	6	6	516154	516159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_011206	CGT	2	6	516283	516288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011206	GAAG	2	8	516330	516337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011206	GTT	2	6	516386	516391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011206	AT	3	6	516593	516598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011206	CCTTC	2	10	516623	516632	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1031	NC_011206	GACCA	2	10	516667	516676	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_011206	GGC	2	6	516692	516697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011206	ACC	2	6	516712	516717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_011206	GTT	2	6	516846	516851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011206	T	6	6	516850	516855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011206	ATG	2	6	516871	516876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011206	A	6	6	516880	516885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011206	AG	3	6	517400	517405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011206	ATGT	2	8	518917	518924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011206	GAG	2	6	522880	522885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011206	GA	3	6	523165	523170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011206	CCG	2	6	525261	525266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011206	CGT	2	6	525280	525285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011206	GTG	2	6	527392	527397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011206	CGC	3	9	527419	527427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_011206	CCT	2	6	529872	529877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011206	GAT	2	6	535243	535248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011206	GCG	2	6	535257	535262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011206	TGC	2	6	535279	535284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011206	GCG	2	6	535296	535301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011206	CGT	2	6	535309	535314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011206	TCC	2	6	535549	535554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_011206	CG	3	6	535655	535660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_011206	TCC	2	6	536174	536179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_011206	GCG	2	6	536201	536206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011206	CGT	3	9	536222	536230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011206	GCA	2	6	536248	536253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011206	TCC	2	6	536539	536544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_011206	AAC	2	6	537527	537532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011206	TGT	2	6	537591	537596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011206	GTC	2	6	537664	537669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011206	ACG	3	9	537715	537723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011206	GTC	2	6	537767	537772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011206	GCGCCG	2	12	537805	537816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011206	AT	3	6	537857	537862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011206	TGG	2	6	537940	537945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011206	TTC	2	6	537971	537976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011206	AGCCT	2	10	538550	538559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_011206	GCA	2	6	538583	538588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011206	AT	3	6	538604	538609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011206	T	6	6	538614	538619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011206	CAT	2	6	538635	538640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011206	AAT	2	6	538654	538659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011206	TTG	2	6	538676	538681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011206	TTA	2	6	538718	538723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011206	TA	3	6	538738	538743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011206	GCT	2	6	538813	538818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011206	CGG	2	6	538824	538829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011206	TA	3	6	538842	538847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011206	ATC	2	6	538949	538954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011206	GGC	2	6	538973	538978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011206	AG	3	6	539382	539387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011206	CGG	2	6	539401	539406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011206	GC	5	10	540526	540535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_011206	CTCC	2	8	543191	543198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_011206	C	6	6	543343	543348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1087	NC_011206	ATC	2	6	543379	543384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011206	GCC	2	6	543394	543399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_011206	GAT	2	6	544869	544874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011206	CCGA	2	8	544892	544899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_011206	AGGGCG	2	12	552527	552538	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1092	NC_011206	CGA	2	6	553347	553352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011206	GCT	2	6	559076	559081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011206	CCG	2	6	559095	559100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_011206	TGG	2	6	559105	559110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011206	T	6	6	560734	560739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011206	TGCCA	2	10	560777	560786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1098	NC_011206	T	6	6	560820	560825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011206	CTC	2	6	563783	563788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_011206	GAT	2	6	563801	563806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011206	GA	3	6	563820	563825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011206	GC	3	6	568983	568988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_011206	GCC	2	6	569108	569113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_011206	CCT	2	6	574669	574674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_011206	CAA	2	6	574701	574706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011206	A	7	7	574705	574711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011206	CG	3	6	574757	574762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_011206	TTG	2	6	574767	574772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011206	GCAG	2	8	574807	574814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_011206	CGG	2	6	574818	574823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011206	CAA	2	6	576059	576064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011206	TGG	2	6	580113	580118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011206	TGG	2	6	580204	580209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011206	AGG	2	6	580292	580297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011206	AGG	2	6	580910	580915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011206	TCC	2	6	583833	583838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_011206	GCC	2	6	583847	583852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_011206	GTG	2	6	585157	585162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011206	AG	3	6	585235	585240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011206	GGA	2	6	585271	585276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011206	T	6	6	586766	586771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011206	GCC	2	6	586775	586780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_011206	GTGC	2	8	587429	587436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_011206	GGA	2	6	587439	587444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011206	AGT	2	6	587484	587489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011206	CTGC	2	8	587492	587499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_011206	TTC	2	6	590300	590305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011206	CT	3	6	590335	590340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_011206	CCG	2	6	592899	592904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_011206	ATC	2	6	596956	596961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011206	TTCAA	2	10	596963	596972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_011206	A	6	6	596996	597001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011206	AGG	2	6	597013	597018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011206	GTA	2	6	597023	597028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011206	TA	3	6	597027	597032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011206	CTG	2	6	597732	597737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_011206	TGCG	2	8	597859	597866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1181	NC_011206	TCG	2	6	611874	611879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_011206	GCCT	2	8	631914	631921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_011206	GCGG	2	8	631985	631992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1266	NC_011206	A	8	8	631995	632002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_011206	TTTG	2	8	632027	632034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_011206	GTT	2	6	704938	704943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_011206	TAA	2	6	740863	740868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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