MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 6106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011206	CCG	2	6	232840	232845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_011206	GTCC	2	8	232874	232881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_011206	GGCC	2	8	240160	240167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_011206	T	7	7	240997	241003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011206	TATTT	2	10	241016	241025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011206	TGC	2	6	241087	241092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011206	GAG	2	6	241120	241125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011206	CT	3	6	241188	241193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_011206	CCT	2	6	241205	241210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_011206	CAG	2	6	241258	241263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011206	GC	3	6	242132	242137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_011206	GCC	2	6	242145	242150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_011206	AGC	2	6	243185	243190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011206	ACTGGT	2	12	243254	243265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_011206	CTGCC	2	10	243309	243318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
516	NC_011206	CAG	2	6	243363	243368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011206	C	6	6	243419	243424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
518	NC_011206	T	6	6	243465	243470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011206	CTG	2	6	251119	251124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011206	GCCTG	2	10	251130	251139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
521	NC_011206	ATC	2	6	251257	251262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_011206	CTT	2	6	251288	251293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011206	TGA	2	6	251404	251409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011206	CCG	2	6	251983	251988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011206	TCTG	2	8	252025	252032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_011206	CA	3	6	252206	252211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_011206	TTG	2	6	252226	252231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011206	GT	3	6	252259	252264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011206	ATG	2	6	252287	252292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011206	A	6	6	252311	252316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011206	TAC	2	6	252377	252382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011206	A	6	6	252396	252401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011206	TAA	2	6	252406	252411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011206	TATAA	2	10	252451	252460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011206	GAT	2	6	252504	252509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011206	A	6	6	252588	252593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011206	T	6	6	252604	252609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011206	T	6	6	252621	252626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011206	ATC	2	6	252643	252648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011206	AT	3	6	252664	252669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011206	T	6	6	252677	252682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011206	CTTT	2	8	252683	252690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_011206	T	6	6	252688	252693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011206	TAA	2	6	252696	252701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011206	TAC	2	6	252800	252805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011206	TAG	2	6	252808	252813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011206	C	6	6	252870	252875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
548	NC_011206	ATG	2	6	253009	253014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011206	CTG	2	6	253064	253069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011206	GA	3	6	253113	253118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011206	T	7	7	253144	253150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011206	ATT	2	6	253190	253195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011206	A	7	7	253230	253236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011206	GGT	2	6	253286	253291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011206	ACCC	2	8	253305	253312	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
556	NC_011206	GGTCA	2	10	255722	255731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_011206	TTTG	2	8	255841	255848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011206	GAT	2	6	256212	256217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011206	AG	3	6	256245	256250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011206	T	7	7	256285	256291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011206	T	6	6	256342	256347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011206	T	6	6	256382	256387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011206	GTGC	2	8	256394	256401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_011206	ATT	2	6	256437	256442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011206	TA	3	6	256508	256513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011206	ATTT	2	8	256537	256544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011206	TAC	2	6	256546	256551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011206	ATT	2	6	256552	256557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011206	TTA	2	6	256622	256627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011206	TGGT	2	8	256649	256656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011206	CTG	2	6	256689	256694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011206	CCA	2	6	256716	256721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_011206	TGCG	2	8	256759	256766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_011206	AAT	2	6	256858	256863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011206	TTG	2	6	256992	256997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011206	GAA	2	6	257163	257168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011206	TTCA	2	8	257176	257183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_011206	C	7	7	257267	257273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
579	NC_011206	TCT	2	6	258299	258304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011206	CG	3	6	258318	258323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_011206	CAC	3	9	258372	258380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_011206	TA	3	6	258412	258417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011206	TTCT	2	8	258454	258461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_011206	GCC	2	6	258468	258473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_011206	AAC	2	6	258816	258821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011206	ACGA	2	8	261308	261315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_011206	TGGAG	2	10	261653	261662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011206	AC	3	6	261665	261670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_011206	AG	3	6	262591	262596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011206	AAT	2	6	262637	262642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011206	AG	3	6	262647	262652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011206	GGGAC	2	10	262692	262701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
593	NC_011206	ATC	2	6	262743	262748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011206	CTT	2	6	262824	262829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011206	CCCA	2	8	264831	264838	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
596	NC_011206	GGGGC	2	10	264858	264867	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
597	NC_011206	TAG	2	6	264947	264952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011206	GTG	2	6	265012	265017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011206	GTC	2	6	265059	265064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011206	ATC	2	6	265184	265189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011206	CAA	2	6	265207	265212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011206	GCT	2	6	265253	265258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011206	CGG	2	6	265686	265691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011206	GGC	2	6	265708	265713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011206	CTGG	2	8	265729	265736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_011206	GGA	2	6	265804	265809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011206	GTC	2	6	265857	265862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011206	CGT	2	6	265886	265891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011206	CTT	2	6	265939	265944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011206	TTTC	2	8	265961	265968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_011206	T	7	7	265978	265984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011206	CGG	2	6	266126	266131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011206	CAA	2	6	266333	266338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011206	GTT	2	6	268467	268472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011206	GGA	2	6	268556	268561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011206	ATTTA	2	10	268567	268576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011206	CTC	2	6	269649	269654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_011206	TCA	2	6	269702	269707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011206	TGC	2	6	269745	269750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011206	CAG	2	6	269764	269769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011206	CAG	2	6	269789	269794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011206	GCATT	2	10	269806	269815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
623	NC_011206	AACCT	2	10	269833	269842	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
624	NC_011206	GAT	2	6	269896	269901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011206	TAT	2	6	269908	269913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011206	ATC	2	6	269963	269968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011206	CG	4	8	269980	269987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_011206	GAA	2	6	273088	273093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011206	CTG	2	6	275355	275360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011206	TA	3	6	275362	275367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011206	ACA	2	6	275392	275397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011206	CTG	2	6	275443	275448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011206	CTG	2	6	275585	275590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011206	GAGC	2	8	276134	276141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_011206	GT	3	6	276145	276150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011206	TGC	2	6	276175	276180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011206	CTCGG	2	10	276308	276317	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
638	NC_011206	GAG	2	6	276329	276334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011206	CCA	2	6	276382	276387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_011206	TCCT	2	8	276514	276521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_011206	AGTA	2	8	276538	276545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011206	GCGGA	2	10	276569	276578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
643	NC_011206	GTT	2	6	276588	276593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011206	CTG	2	6	276608	276613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_011206	CCG	2	6	276697	276702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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648	NC_011206	CAC	2	6	278824	278829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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651	NC_011206	GCC	3	9	283210	283218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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662	NC_011206	ATAA	2	8	283899	283906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_011206	GCG	2	6	284734	284739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_011206	CGCC	2	8	284746	284753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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667	NC_011206	CCT	2	6	287113	287118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_011206	CCG	2	6	288210	288215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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676	NC_011206	TGA	2	6	288472	288477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
677	NC_011206	ACC	2	6	289858	289863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
678	NC_011206	CCA	2	6	290297	290302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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681	NC_011206	CCA	2	6	290404	290409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
682	NC_011206	CTG	2	6	290454	290459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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733	NC_011206	ATC	2	6	315364	315369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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765	NC_011206	ACATG	2	10	340795	340804	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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771	NC_011206	TGG	2	6	353226	353231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_011206	AG	4	8	353277	353284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
773	NC_011206	GC	3	6	354154	354159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
774	NC_011206	GGC	2	6	354194	354199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_011206	AG	3	6	511944	511949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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