MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 6106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011206	C	6	6	2819298	2819303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6002	NC_011206	ATT	2	6	2819939	2819944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011206	CAT	2	6	2822776	2822781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_011206	TAAT	2	8	2822786	2822793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011206	GATA	2	8	2828346	2828353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_011206	CAG	2	6	2828371	2828376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_011206	TC	3	6	2828388	2828393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_011206	GGTA	2	8	2829837	2829844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011206	C	6	6	2830982	2830987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6010	NC_011206	TCC	2	6	2833680	2833685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_011206	CTC	2	6	2834711	2834716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_011206	GAAT	2	8	2834726	2834733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_011206	TAA	2	6	2836746	2836751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011206	GA	4	8	2837736	2837743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011206	GCGCCA	2	12	2839061	2839072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_011206	GAT	2	6	2839074	2839079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_011206	CAC	2	6	2839847	2839852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_011206	GGT	2	6	2839870	2839875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011206	CGG	2	6	2839885	2839890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011206	GGAC	2	8	2839893	2839900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_011206	TTC	2	6	2840887	2840892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_011206	TG	3	6	2842956	2842961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_011206	CTC	2	6	2849274	2849279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_011206	GCC	2	6	2849289	2849294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_011206	TTG	2	6	2849343	2849348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011206	GCG	2	6	2849439	2849444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_011206	GTA	2	6	2849498	2849503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_011206	CAT	2	6	2849566	2849571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_011206	GCC	2	6	2849582	2849587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_011206	ACG	2	6	2849607	2849612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_011206	CTT	2	6	2849709	2849714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_011206	CTG	2	6	2849789	2849794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_011206	CTT	2	6	2849875	2849880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_011206	TGA	2	6	2849887	2849892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_011206	GCC	2	6	2849902	2849907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_011206	T	6	6	2850376	2850381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_011206	TG	3	6	2850421	2850426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011206	TGG	2	6	2850481	2850486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011206	TGGCA	2	10	2850512	2850521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_011206	CTGCC	2	10	2851316	2851325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6041	NC_011206	GCA	2	6	2851347	2851352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_011206	A	6	6	2851459	2851464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011206	TGC	2	6	2851572	2851577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_011206	ATG	2	6	2853130	2853135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011206	CAT	2	6	2853143	2853148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_011206	A	6	6	2853165	2853170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_011206	ATC	2	6	2853221	2853226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_011206	TGA	2	6	2853332	2853337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011206	AT	3	6	2853433	2853438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_011206	AACT	2	8	2853450	2853457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_011206	ATCA	2	8	2853464	2853471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_011206	ACA	2	6	2853528	2853533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011206	TGA	2	6	2853568	2853573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011206	TAAA	2	8	2853603	2853610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011206	AAAG	2	8	2853614	2853621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_011206	TCT	2	6	2853703	2853708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_011206	TAA	2	6	2853711	2853716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_011206	TTA	2	6	2853784	2853789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_011206	TAA	2	6	2853807	2853812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011206	AAAT	2	8	2853852	2853859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011206	ATG	2	6	2853905	2853910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_011206	TAC	2	6	2853916	2853921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011206	TCGG	2	8	2854082	2854089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_011206	GAC	2	6	2854097	2854102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_011206	T	6	6	2854113	2854118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011206	ACCG	2	8	2854156	2854163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_011206	CCT	2	6	2854194	2854199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_011206	ATG	2	6	2854265	2854270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011206	CCCG	2	8	2854314	2854321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6070	NC_011206	AG	3	6	2854358	2854363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011206	CAA	2	6	2854410	2854415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_011206	AGC	2	6	2854740	2854745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_011206	T	6	6	2854804	2854809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011206	G	6	6	2854885	2854890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011206	T	7	7	2854947	2854953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011206	ATC	2	6	2855093	2855098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_011206	CCG	2	6	2855135	2855140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_011206	CGG	2	6	2855141	2855146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_011206	TGA	2	6	2855193	2855198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_011206	GGA	2	6	2858158	2858163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011206	GCC	3	9	2858174	2858182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_011206	CAGGA	2	10	2858233	2858242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_011206	CCA	2	6	2861104	2861109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_011206	GCA	2	6	2861177	2861182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_011206	GAG	2	6	2861208	2861213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_011206	ACGGA	2	10	2867564	2867573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6087	NC_011206	CCG	2	6	2870158	2870163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_011206	ATT	2	6	2870225	2870230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011206	CTG	2	6	2870239	2870244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_011206	ATG	2	6	2870314	2870319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_011206	AGGT	2	8	2875145	2875152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011206	CGA	2	6	2875256	2875261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_011206	GAC	2	6	2878424	2878429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_011206	TCGGC	2	10	2880150	2880159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6095	NC_011206	TGA	3	9	2880165	2880173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011206	GAA	2	6	2880180	2880185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011206	C	6	6	2880532	2880537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6098	NC_011206	GC	3	6	2880558	2880563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_011206	TCC	2	6	2883735	2883740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_011206	TACA	2	8	2883893	2883900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_011206	CAA	2	6	2883938	2883943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_011206	TTC	2	6	2883983	2883988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_011206	GGC	2	6	2883997	2884002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_011206	TATTC	2	10	2884878	2884887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6105	NC_011206	ATGT	2	8	2885011	2885018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_011206	T	6	6	2885018	2885023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.