MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 6106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011206	AT	3	6	2669189	2669194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011206	CCTTC	2	10	2669244	2669253	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5503	NC_011206	AC	3	6	2669352	2669357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_011206	TGG	2	6	2669429	2669434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011206	TGG	2	6	2669508	2669513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_011206	GT	3	6	2669603	2669608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011206	AGG	2	6	2669632	2669637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011206	GCT	2	6	2669733	2669738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_011206	GT	3	6	2669773	2669778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011206	ACG	2	6	2669874	2669879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_011206	GGCTT	2	10	2669907	2669916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5512	NC_011206	GT	3	6	2669942	2669947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011206	TCC	2	6	2669993	2669998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_011206	CACGA	2	10	2670093	2670102	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_011206	GAC	2	6	2670106	2670111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_011206	GCA	2	6	2670118	2670123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_011206	TTC	2	6	2670196	2670201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011206	GCC	2	6	2670439	2670444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_011206	TCC	2	6	2670459	2670464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_011206	CCA	2	6	2670500	2670505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_011206	C	6	6	2670632	2670637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5522	NC_011206	GCT	2	6	2670649	2670654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_011206	CTT	3	9	2670674	2670682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011206	TCC	2	6	2670726	2670731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_011206	CTT	2	6	2670758	2670763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011206	CTG	2	6	2670817	2670822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_011206	GTC	2	6	2670867	2670872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_011206	TCG	2	6	2670892	2670897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_011206	TGG	2	6	2670901	2670906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011206	CTC	2	6	2670942	2670947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_011206	GCC	2	6	2671123	2671128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_011206	ATC	2	6	2671195	2671200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_011206	CA	3	6	2671240	2671245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_011206	CGT	2	6	2671303	2671308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_011206	TGA	2	6	2672662	2672667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011206	CGG	2	6	2672684	2672689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_011206	GTA	2	6	2675116	2675121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_011206	TCT	2	6	2675167	2675172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_011206	GCC	2	6	2675247	2675252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_011206	C	6	6	2675665	2675670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5541	NC_011206	CTG	2	6	2675701	2675706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011206	CGG	2	6	2676941	2676946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011206	AGGG	2	8	2677753	2677760	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_011206	ATA	2	6	2681805	2681810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011206	ACC	2	6	2681820	2681825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_011206	ACG	2	6	2681838	2681843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011206	TCC	2	6	2682932	2682937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_011206	GCT	2	6	2683909	2683914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011206	CCCT	2	8	2684262	2684269	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5550	NC_011206	CAT	2	6	2684373	2684378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_011206	GCCT	2	8	2684391	2684398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_011206	GC	3	6	2687640	2687645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_011206	GGCA	2	8	2687687	2687694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_011206	AGA	2	6	2688680	2688685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011206	GAG	2	6	2688688	2688693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011206	CGG	2	6	2691423	2691428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_011206	GCGG	2	8	2691489	2691496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_011206	TGGC	2	8	2691511	2691518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_011206	CTG	2	6	2691546	2691551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011206	TCC	2	6	2691670	2691675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_011206	AGC	2	6	2691720	2691725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_011206	GGC	2	6	2691737	2691742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011206	TTGC	2	8	2691851	2691858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_011206	CAC	2	6	2691866	2691871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_011206	CGG	2	6	2691876	2691881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_011206	CT	3	6	2691891	2691896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_011206	TAA	2	6	2691975	2691980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011206	ACC	2	6	2691982	2691987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_011206	TGC	2	6	2692007	2692012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011206	CCCA	2	8	2692031	2692038	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5571	NC_011206	TATC	2	8	2692131	2692138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_011206	TAA	3	9	2692157	2692165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011206	TGG	2	6	2692245	2692250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011206	CAGG	2	8	2692293	2692300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_011206	AG	3	6	2692338	2692343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011206	AT	3	6	2692371	2692376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011206	GAT	2	6	2692404	2692409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011206	CGAA	2	8	2694009	2694016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_011206	GAG	2	6	2694739	2694744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011206	TGT	2	6	2696699	2696704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011206	CG	3	6	2696774	2696779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_011206	CAA	2	6	2696821	2696826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_011206	GTGG	2	8	2696857	2696864	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011206	ATG	2	6	2696880	2696885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011206	TGC	2	6	2696909	2696914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_011206	GGC	2	6	2696973	2696978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_011206	TTTG	2	8	2697102	2697109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011206	GGTT	2	8	2697136	2697143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011206	TTA	2	6	2697169	2697174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_011206	TGG	2	6	2700307	2700312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011206	ATGGAA	2	12	2700341	2700352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_011206	TGG	2	6	2700364	2700369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011206	GGC	2	6	2700884	2700889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_011206	C	6	6	2700935	2700940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5595	NC_011206	ATT	2	6	2700980	2700985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_011206	GGT	2	6	2700990	2700995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_011206	GGT	2	6	2701059	2701064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011206	TGC	2	6	2701071	2701076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_011206	CGA	2	6	2701107	2701112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_011206	AC	3	6	2701114	2701119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_011206	ATG	2	6	2701120	2701125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011206	TAAT	2	8	2701181	2701188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011206	C	6	6	2701235	2701240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5604	NC_011206	GGC	2	6	2701257	2701262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011206	GGA	2	6	2701495	2701500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_011206	GCCA	2	8	2701573	2701580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_011206	GGC	2	6	2701594	2701599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011206	TCA	2	6	2701723	2701728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011206	CGT	2	6	2701735	2701740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_011206	A	7	7	2701757	2701763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011206	GCG	2	6	2701908	2701913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_011206	TG	3	6	2701917	2701922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011206	TGG	2	6	2701937	2701942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_011206	GCT	2	6	2701995	2702000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011206	GCCT	2	8	2702003	2702010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_011206	C	6	6	2702023	2702028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5617	NC_011206	TAT	2	6	2702070	2702075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_011206	CGT	2	6	2702144	2702149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_011206	CAT	2	6	2702178	2702183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_011206	ATGG	2	8	2702201	2702208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011206	AAT	2	6	2702213	2702218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011206	CGG	2	6	2702247	2702252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_011206	GAT	2	6	2702274	2702279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011206	GATTC	2	10	2702800	2702809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5625	NC_011206	CAGG	2	8	2702860	2702867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_011206	A	6	6	2702871	2702876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011206	TGT	2	6	2702911	2702916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_011206	TAA	2	6	2703002	2703007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_011206	AT	3	6	2703028	2703033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_011206	AT	3	6	2703138	2703143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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