MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_A

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010942	GT	3	6	8	13	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010942	TTC	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010942	TTA	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010942	GTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010942	ACT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010942	A	6	6	289	294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010942	TTC	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010942	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010942	TTA	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010942	ATAAAA	2	12	834	845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010942	A	7	7	842	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010942	TAT	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010942	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010942	CAAT	2	8	1124	1131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010942	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010942	CGT	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010942	T	6	6	1335	1340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010942	GTA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010942	TTTTC	2	10	1480	1489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010942	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010942	GTT	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010942	A	6	6	1629	1634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010942	TGA	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010942	CTT	2	6	2705	2710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010942	T	7	7	2709	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010942	TAAA	2	8	3714	3721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010942	TTTG	2	8	3770	3777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010942	A	7	7	3784	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010942	AAAAC	2	10	3840	3849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010942	GGC	3	9	3893	3901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010942	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010942	ATC	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010942	ATC	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010942	TAAA	2	8	4069	4076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010942	AAT	2	6	4175	4180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010942	T	6	6	4225	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010942	T	6	6	4292	4297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010942	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010942	ATTTAT	2	12	4367	4378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010942	TC	3	6	4387	4392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010942	TTC	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010942	TCT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010942	TAA	2	6	4464	4469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010942	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010942	TTA	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010942	TTGA	2	8	5342	5349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010942	T	6	6	5354	5359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010942	GTCG	2	8	5415	5422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010942	CCGT	2	8	5456	5463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010942	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010942	T	7	7	5519	5525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010942	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010942	GTA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.