MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU2

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010606	TC	3	6	39	44	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010606	GTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010606	AAC	2	6	79	84	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010606	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010606	GT	3	6	177	182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010606	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010606	A	6	6	1329	1334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010606	TCAAAT	2	12	1341	1352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010606	AAT	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010606	GCA	2	6	1375	1380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010606	TGAT	2	8	1384	1391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010606	T	7	7	1391	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010606	AGTAT	2	10	1398	1407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010606	T	7	7	1457	1463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010606	GA	3	6	1467	1472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010606	AATA	2	8	1473	1480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010606	TA	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010606	T	7	7	4522	4528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010606	TTAGA	2	10	4550	4559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010606	T	8	8	4976	4983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010606	ATA	2	6	5020	5025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010606	AT	3	6	5477	5482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010606	A	6	6	5514	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010606	T	6	6	5528	5533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010606	CTA	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010606	ACAA	2	8	5609	5616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010606	TTGAA	2	10	5620	5629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010606	TAA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010606	ACT	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010606	CAA	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010606	ATT	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010606	A	6	6	6453	6458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010606	AAC	2	6	6575	6580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010606	GAA	2	6	6585	6590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010606	A	7	7	6601	6607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010606	TAA	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010606	AT	4	8	6765	6772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010606	CTAA	2	8	6790	6797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010606	ATC	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010606	A	7	7	6846	6852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010606	TA	3	6	6854	6859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010606	TAG	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010606	AGAA	2	8	7368	7375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010606	CAA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010606	TAAT	2	8	7396	7403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010606	TAA	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010606	GTTG	2	8	7786	7793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010606	A	6	6	7811	7816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010606	TCA	2	6	7830	7835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010606	AGG	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010606	TAAA	2	8	7966	7973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010606	T	7	7	7978	7984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010606	TGAA	2	8	8015	8022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010606	CTATT	2	10	8088	8097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010606	TAC	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010606	TGT	2	6	8262	8267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010606	TAA	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010606	TGAT	2	8	8311	8318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010606	ATT	2	6	8345	8350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010606	TGA	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010606	AGAA	2	8	8467	8474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010606	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010606	ATT	2	6	8629	8634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010606	GAAA	2	8	9093	9100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010606	A	6	6	9707	9712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010606	TAA	2	6	9756	9761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010606	CAT	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010606	TGAA	2	8	9869	9876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010606	T	7	7	10129	10135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010606	TTG	2	6	10160	10165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010606	TA	3	6	10190	10195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010606	CAA	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010606	TTG	2	6	10250	10255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010606	TCC	2	6	10328	10333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010606	TAT	2	6	10345	10350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010606	ATTT	2	8	10356	10363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010606	TA	3	6	10368	10373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010606	A	6	6	10375	10380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010606	TTA	2	6	10532	10537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010606	CTT	2	6	10567	10572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010606	GTC	2	6	10575	10580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010606	TGAC	2	8	10600	10607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010606	AGG	2	6	10634	10639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010606	TCA	2	6	10656	10661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010606	AT	3	6	10709	10714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010606	TTAA	2	8	10715	10722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010606	T	6	6	10730	10735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010606	CAT	2	6	10771	10776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010606	A	6	6	11369	11374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010606	T	7	7	12150	12156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010606	GTT	2	6	12188	12193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010606	CAA	2	6	12203	12208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010606	A	6	6	12255	12260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010606	TAG	2	6	12269	12274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010606	AAC	2	6	14376	14381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010606	G	6	6	14388	14393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010606	CCT	2	6	14397	14402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010606	TTTA	2	8	14405	14412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010606	A	6	6	15750	15755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010606	TTA	2	6	15786	15791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010606	A	6	6	15854	15859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010606	ATG	2	6	15882	15887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010606	TGA	2	6	16088	16093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010606	AT	4	8	16113	16120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010606	TAA	2	6	16130	16135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010606	ATT	2	6	16144	16149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010606	GAT	3	9	16201	16209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010606	ACTT	2	8	16215	16222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010606	TGC	2	6	16223	16228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010606	AATT	2	8	16291	16298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010606	ATTA	2	8	16301	16308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010606	ATT	2	6	17514	17519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010606	TAAA	2	8	18744	18751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010606	AT	3	6	18771	18776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010606	TAT	2	6	18779	18784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010606	TGA	2	6	18808	18813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010606	AAAAT	2	10	18862	18871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010606	CTA	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010606	TCT	2	6	18901	18906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010606	TA	3	6	18988	18993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010606	TA	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010606	TCA	2	6	19080	19085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010606	TAT	2	6	19109	19114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010606	AAT	2	6	19197	19202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010606	T	6	6	19230	19235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010606	TTTC	2	8	19272	19279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010606	TTTA	2	8	19298	19305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010606	TAA	2	6	19316	19321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010606	TGA	2	6	19349	19354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010606	TGCT	2	8	19360	19367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010606	GGA	2	6	19403	19408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010606	ATG	2	6	19450	19455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010606	ATTA	2	8	19457	19464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010606	AAG	2	6	19504	19509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010606	TAC	2	6	19517	19522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010606	A	7	7	19527	19533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010606	TGA	2	6	19537	19542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010606	CCA	2	6	19575	19580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010606	T	6	6	19594	19599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010606	AAG	2	6	19632	19637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010606	AAC	2	6	19655	19660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010606	AAG	2	6	19676	19681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010606	G	6	6	19702	19707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010606	A	7	7	19714	19720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010606	TTAAG	2	10	19822	19831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010606	ATT	2	6	20476	20481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010606	AAT	2	6	20547	20552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010606	TTG	2	6	20557	20562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010606	AAG	2	6	20598	20603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010606	T	7	7	20620	20626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010606	A	6	6	20627	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010606	AAT	2	6	21917	21922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010606	CGGGC	2	10	21957	21966	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_010606	T	7	7	22072	22078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010606	GCA	2	6	22117	22122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010606	TTA	2	6	22214	22219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010606	CTT	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010606	GTC	2	6	22257	22262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_010606	TGAC	2	8	22282	22289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010606	AGG	2	6	22316	22321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010606	TCA	2	6	22338	22343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010606	AT	3	6	22404	22409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010606	TAA	2	6	22418	22423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010606	GTA	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010606	TA	3	6	22485	22490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010606	AATTT	2	10	22555	22564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010606	ATT	2	6	22588	22593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010606	CAC	2	6	22605	22610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_010606	TAG	2	6	22626	22631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_010606	TGA	2	6	22663	22668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010606	TATT	2	8	22677	22684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010606	CTA	2	6	22773	22778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_010606	AAT	2	6	22827	22832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010606	A	6	6	22870	22875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010606	TGA	2	6	22902	22907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010606	AAAG	2	8	22911	22918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010606	CAT	2	6	22942	22947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_010606	GGC	2	6	22957	22962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_010606	TCA	2	6	23014	23019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_010606	TAA	2	6	23094	23099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010606	GTA	2	6	23114	23119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010606	TA	3	6	23153	23158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010606	AATTT	2	10	23223	23232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010606	CAC	2	6	23272	23277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_010606	TAG	2	6	23293	23298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_010606	TGA	2	6	23330	23335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010606	TATT	2	8	23344	23351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010606	CTA	2	6	23440	23445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_010606	AAT	2	6	23494	23499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_010606	T	6	6	24142	24147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010606	TTG	2	6	24185	24190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_010606	A	7	7	34529	34535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_010606	TAAA	2	8	34645	34652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_010606	AGAGCA	2	12	34653	34664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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257	NC_010606	AGT	2	6	34844	34849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_010606	A	6	6	36483	36488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010606	AAC	2	6	36511	36516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_010606	TTAAAG	2	12	36537	36548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_010606	T	7	7	36573	36579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_010606	TTCTTT	2	12	36952	36963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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280	NC_010606	T	6	6	37002	37007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010606	ATT	2	6	37074	37079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010606	ACTA	2	8	37092	37099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_010606	ACC	2	6	37119	37124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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286	NC_010606	AT	3	6	37235	37240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010606	CAT	2	6	37247	37252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_010606	T	6	6	37277	37282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_010606	ATG	2	6	37320	37325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_010606	TTG	3	9	38172	38180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010606	CAA	3	9	38189	38197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_010606	AT	3	6	39114	39119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_010606	A	6	6	39176	39181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.