MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p2ABSDF

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010396	CT	3	6	31	36	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010396	T	7	7	45	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010396	A	6	6	119	124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010396	AGCGA	2	10	133	142	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010396	T	7	7	161	167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010396	A	6	6	189	194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010396	AGCGAA	2	12	211	222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010396	AGCGA	2	10	238	247	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010396	AT	3	6	283	288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010396	ACT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010396	ACT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010396	ACT	2	6	415	420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010396	ACT	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010396	TA	3	6	455	460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010396	AT	3	6	467	472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010396	ATTG	2	8	2033	2040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010396	T	6	6	2041	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010396	A	7	7	2070	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010396	TCT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010396	AAAT	2	8	4610	4617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010396	T	7	7	4632	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010396	A	6	6	5431	5436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010396	T	9	9	5457	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010396	GTC	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010396	ATT	2	6	5703	5708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010396	AG	3	6	5759	5764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010396	GAAT	2	8	5765	5772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010396	A	6	6	5811	5816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010396	ATC	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010396	TGCAT	2	10	5857	5866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010396	CACG	2	8	5925	5932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010396	TAAA	2	8	5944	5951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010396	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010396	TAA	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010396	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010396	ATT	2	6	6080	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010396	CTT	2	6	6088	6093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010396	TTA	2	6	6109	6114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010396	AAT	2	6	6172	6177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010396	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010396	TAA	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010396	TGC	2	6	6250	6255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010396	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010396	TTTA	2	8	6307	6314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010396	TTAA	2	8	6326	6333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010396	AAT	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010396	ATA	2	6	7916	7921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010396	TTG	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010396	TTC	2	6	10186	10191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010396	CACG	2	8	11073	11080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010396	TAAA	2	8	11092	11099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010396	CAA	2	6	11184	11189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010396	TGT	2	6	11230	11235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010396	CAA	2	6	11241	11246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010396	CAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010396	A	6	6	11268	11273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010396	T	7	7	11302	11308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010396	ATTT	2	8	11385	11392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010396	ATA	2	6	11431	11436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010396	CTT	2	6	11466	11471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010396	AG	3	6	11617	11622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010396	TCGT	2	8	11675	11682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010396	TTCT	2	8	11732	11739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010396	T	6	6	11780	11785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010396	TTCA	2	8	11935	11942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010396	A	6	6	11978	11983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010396	T	6	6	11995	12000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010396	AAAAGC	2	12	12001	12012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010396	CAT	2	6	12018	12023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010396	AGA	2	6	14313	14318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010396	AAT	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010396	AT	3	6	14360	14365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010396	GTT	2	6	14372	14377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010396	AT	3	6	14379	14384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010396	CCAT	2	8	14415	14422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010396	CAT	2	6	14453	14458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010396	CAC	2	6	14473	14478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010396	ACA	2	6	14502	14507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010396	A	6	6	14643	14648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010396	CAG	2	6	14777	14782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010396	AAG	2	6	14883	14888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010396	AAC	3	9	14922	14930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010396	TA	3	6	15018	15023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010396	AAG	2	6	15071	15076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010396	A	6	6	15563	15568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010396	ATTAT	2	10	17067	17076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010396	CGAG	2	8	17862	17869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010396	CTT	2	6	17940	17945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010396	A	6	6	18007	18012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010396	AGCGA	2	10	18020	18029	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010396	TTGCTT	2	12	18038	18049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010396	ATA	2	6	18065	18070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010396	A	6	6	18074	18079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010396	CTC	2	6	18153	18158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010396	T	6	6	18170	18175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010396	T	6	6	18180	18185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010396	GCTAT	2	10	18208	18217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010396	TCAAA	2	10	19754	19763	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010396	A	6	6	19792	19797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010396	AGA	2	6	19933	19938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010396	AG	3	6	19940	19945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010396	ATA	2	6	22192	22197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010396	TAA	2	6	22234	22239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010396	TGA	2	6	22299	22304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010396	TAA	2	6	22356	22361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010396	ATTG	2	8	23900	23907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010396	GTA	2	6	23914	23919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010396	ATTT	2	8	24168	24175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010396	TAA	2	6	24177	24182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010396	ATT	2	6	24225	24230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010396	ATT	2	6	24250	24255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010396	T	6	6	24254	24259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010396	TTCA	2	8	24266	24273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010396	TATT	2	8	24290	24297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010396	ACA	2	6	24303	24308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010396	AAT	2	6	24322	24327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010396	A	6	6	24351	24356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010396	TCA	2	6	24403	24408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010396	T	7	7	24410	24416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010396	AT	3	6	24449	24454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010396	GTT	2	6	24474	24479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010396	A	6	6	24508	24513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010396	T	6	6	24521	24526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010396	T	6	6	24548	24553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010396	AAC	2	6	24561	24566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010396	T	7	7	24589	24595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010396	A	7	7	24615	24621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010396	ATC	2	6	24658	24663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010396	GTG	2	6	24673	24678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010396	TG	3	6	24677	24682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010396	A	7	7	24685	24691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010396	A	6	6	24765	24770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010396	TATT	2	8	24772	24779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010396	TTCA	2	8	24816	24823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010396	A	6	6	24908	24913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010396	A	6	6	24947	24952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010396	AG	3	6	24959	24964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.