MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 12833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009922	TAC	2	6	3054310	3054315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_009922	TA	3	6	3054329	3054334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_009922	TC	4	8	3054352	3054359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_009922	TTTA	2	8	3054393	3054400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_009922	AGG	2	6	3054412	3054417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_009922	TGAT	2	8	3055016	3055023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_009922	AGG	2	6	3055092	3055097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_009922	ATG	2	6	3055146	3055151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_009922	ATG	2	6	3055164	3055169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_009922	ATTCA	2	10	3055322	3055331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12511	NC_009922	ATC	2	6	3056159	3056164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_009922	A	7	7	3056250	3056256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_009922	T	6	6	3056293	3056298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_009922	TAT	2	6	3056336	3056341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_009922	T	6	6	3056409	3056414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_009922	TCAT	2	8	3056420	3056427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12517	NC_009922	AT	3	6	3056546	3056551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_009922	TCTTT	2	10	3056555	3056564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12519	NC_009922	CCCT	2	8	3058219	3058226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12520	NC_009922	TCC	2	6	3059062	3059067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_009922	TCC	2	6	3061098	3061103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12522	NC_009922	CT	3	6	3061105	3061110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_009922	TTC	2	6	3061114	3061119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12526	NC_009922	TAA	2	6	3062238	3062243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_009922	ATAGA	2	10	3062266	3062275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_009922	GGT	3	9	3062285	3062293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12531	NC_009922	CTT	2	6	3066540	3066545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12533	NC_009922	TCC	2	6	3067996	3068001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_009922	AAT	2	6	3068407	3068412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12536	NC_009922	TATAA	2	10	3068471	3068480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12538	NC_009922	GTTTT	2	10	3068893	3068902	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_009922	TTCTG	2	10	3068907	3068916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12540	NC_009922	CTT	2	6	3068919	3068924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_009922	A	6	6	3068930	3068935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_009922	CAT	2	6	3068951	3068956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_009922	T	8	8	3068971	3068978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_009922	ATTT	2	8	3069040	3069047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_009922	AT	3	6	3069136	3069141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_009922	AATA	2	8	3069154	3069161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_009922	ATA	2	6	3069183	3069188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_009922	AGG	2	6	3069194	3069199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_009922	T	7	7	3070724	3070730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_009922	CTCC	2	8	3072499	3072506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12551	NC_009922	ATTT	2	8	3072517	3072524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_009922	TAAA	2	8	3072528	3072535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_009922	T	6	6	3075994	3075999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_009922	CAT	2	6	3076006	3076011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12557	NC_009922	TAA	2	6	3078167	3078172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_009922	TTG	2	6	3078246	3078251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_009922	AT	3	6	3078330	3078335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_009922	T	7	7	3078335	3078341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_009922	A	6	6	3078352	3078357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_009922	GAT	2	6	3078390	3078395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12564	NC_009922	AAT	2	6	3078417	3078422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12566	NC_009922	T	6	6	3078463	3078468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_009922	TAAA	2	8	3078476	3078483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_009922	AT	3	6	3078549	3078554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_009922	CATTT	2	10	3078585	3078594	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12594	NC_009922	CATA	2	8	3082287	3082294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12597	NC_009922	A	8	8	3082329	3082336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12601	NC_009922	AT	3	6	3083235	3083240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_009922	GTTAA	2	10	3083244	3083253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_009922	ATTTGA	2	12	3083256	3083267	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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12610	NC_009922	ATA	2	6	3083567	3083572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_009922	AT	3	6	3083583	3083588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_009922	T	6	6	3083630	3083635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_009922	TA	3	6	3083654	3083659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_009922	TCTT	2	8	3083700	3083707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12615	NC_009922	TAT	2	6	3083886	3083891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_009922	TTAAAT	2	12	3084213	3084224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_009922	T	7	7	3084226	3084232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_009922	TATC	2	8	3084281	3084288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12833	NC_009922	AT	3	6	3123541	3123546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.