MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	TAA	3	9	12	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009633	TCC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009633	GTTTT	2	10	1516	1525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009633	TAC	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009633	TAC	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009633	TTTA	2	8	1587	1594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009633	TAT	2	6	1595	1600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009633	GAGG	2	8	1611	1618	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009633	ATA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009633	AGG	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009633	TAA	2	6	3038	3043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009633	TAAA	2	8	3071	3078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009633	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009633	GTA	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009633	AAC	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009633	TAT	3	9	4250	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009633	TAA	2	6	4272	4277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009633	GAG	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009633	AATT	2	8	4614	4621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009633	AGG	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009633	AAT	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009633	ATT	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009633	ATA	3	9	9107	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009633	T	6	6	9189	9194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009633	TAAC	2	8	9199	9206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009633	TAAT	2	8	9228	9235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009633	A	6	6	9268	9273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009633	TAAT	2	8	9278	9285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009633	G	6	6	9319	9324	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009633	G	7	7	10919	10925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009633	C	6	6	10936	10941	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_009633	TAT	2	6	10944	10949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009633	A	7	7	10951	10957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009633	TA	3	6	10962	10967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009633	ATA	2	6	10971	10976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009633	A	6	6	10982	10987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009633	ACAG	2	8	10992	10999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009633	TAG	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009633	GAAAAA	2	12	11072	11083	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009633	CTT	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009633	AT	3	6	11121	11126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009633	CAAG	2	8	11159	11166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009633	TA	4	8	11321	11328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009633	GGC	2	6	11359	11364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009633	GAA	2	6	11417	11422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009633	GCG	2	6	11433	11438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009633	ACCT	2	8	11462	11469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009633	ACA	2	6	11481	11486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009633	CGA	2	6	11610	11615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009633	GCA	2	6	11684	11689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009633	GCA	2	6	11724	11729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009633	CGC	2	6	11731	11736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009633	GAA	2	6	11780	11785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009633	AGG	2	6	11801	11806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009633	CAG	2	6	11828	11833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009633	GTA	2	6	11934	11939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009633	AGG	2	6	12017	12022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009633	AGC	2	6	12243	12248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009633	GAA	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009633	GGT	2	6	12354	12359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009633	GTC	2	6	12368	12373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009633	TCGTG	2	10	12377	12386	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009633	CAG	2	6	12436	12441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009633	AG	3	6	12458	12463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009633	GGA	2	6	12481	12486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009633	ATC	2	6	12505	12510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009633	AC	3	6	12532	12537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009633	AC	3	6	12701	12706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009633	CAC	2	6	12716	12721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009633	AGG	2	6	12760	12765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009633	CCT	2	6	12842	12847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009633	GA	3	6	12886	12891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009633	TC	3	6	12897	12902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009633	TAA	2	6	12903	12908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009633	ATC	2	6	13029	13034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009633	GCTA	2	8	13040	13047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009633	GACT	2	8	13051	13058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009633	TAAA	2	8	13086	13093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009633	ATT	2	6	13132	13137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009633	CAA	2	6	13148	13153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009633	GTT	2	6	13154	13159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009633	TTA	2	6	13214	13219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009633	AGA	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009633	AGAA	2	8	13427	13434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009633	GCG	2	6	13453	13458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009633	AAG	3	9	13522	13530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009633	GTA	2	6	13536	13541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009633	AAG	2	6	13594	13599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009633	G	6	6	13654	13659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009633	ACC	2	6	13660	13665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009633	C	6	6	13664	13669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_009633	TAC	2	6	13679	13684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009633	TG	3	6	13795	13800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009633	TATGG	2	10	13834	13843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009633	GAT	2	6	14010	14015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009633	CGT	2	6	14171	14176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009633	AGC	2	6	14318	14323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009633	AGA	2	6	14482	14487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009633	GA	3	6	14486	14491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009633	ACA	2	6	14619	14624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009633	G	6	6	14664	14669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009633	GTTG	2	8	14696	14703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009633	TG	3	6	14702	14707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009633	GGTG	2	8	14864	14871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009633	GA	3	6	14874	14879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009633	CGG	2	6	15144	15149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009633	CAA	2	6	15238	15243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009633	TGG	2	6	15394	15399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009633	GTA	2	6	15424	15429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009633	GGT	2	6	15639	15644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009633	TCA	2	6	15754	15759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009633	GTA	2	6	15772	15777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009633	CGT	2	6	15834	15839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009633	GAG	2	6	15883	15888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009633	GTT	2	6	15937	15942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009633	C	6	6	16010	16015	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_009633	AAGAT	2	10	16018	16027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009633	AG	3	6	16041	16046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009633	GA	3	6	16172	16177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009633	A	7	7	16186	16192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009633	GTC	2	6	16373	16378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009633	ATT	2	6	16413	16418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009633	T	6	6	16421	16426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009633	ATA	3	9	16428	16436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009633	ACT	2	6	16440	16445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009633	ATC	2	6	16461	16466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009633	TCA	2	6	16487	16492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009633	ATTG	2	8	16497	16504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009633	GGA	2	6	16520	16525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009633	CAAT	2	8	16529	16536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009633	AAAGTT	2	12	16563	16574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009633	AAT	2	6	16624	16629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009633	A	8	8	16645	16652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009633	ATT	2	6	16678	16683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009633	TAA	2	6	16734	16739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009633	TTTA	2	8	16909	16916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009633	AAAC	2	8	16927	16934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009633	GTTT	2	8	16947	16954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009633	TTA	2	6	17022	17027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009633	TA	3	6	17063	17068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009633	TAG	2	6	17071	17076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009633	AT	3	6	17080	17085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009633	TAA	2	6	17086	17091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009633	A	6	6	17100	17105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009633	AGT	2	6	17370	17375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009633	T	7	7	17383	17389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009633	GTTAC	2	10	17390	17399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_009633	TAT	2	6	17454	17459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_009633	TAT	3	9	18037	18045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009633	T	8	8	18052	18059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_009633	A	6	6	19134	19139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_009633	TAA	2	6	22055	22060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_009633	C	6	6	51231	51236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
433	NC_009633	TAC	2	6	51246	51251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_009633	TG	3	6	51362	51367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_009633	CGT	2	6	51738	51743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_009633	AGC	2	6	51885	51890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_009633	GGTG	2	8	52431	52438	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_009633	CGT	2	6	53401	53406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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489	NC_009633	AG	3	6	55530	55535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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