MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009633	TAT	2	6	3537487	3537492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_009633	A	6	6	3538038	3538043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_009633	T	6	6	3538052	3538057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_009633	TAA	2	6	3538353	3538358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_009633	CCT	2	6	3538359	3538364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15006	NC_009633	TTC	2	6	3538372	3538377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_009633	TCC	2	6	3538914	3538919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_009633	TAT	2	6	3538949	3538954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_009633	ATA	2	6	3538958	3538963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_009633	CT	3	6	3539009	3539014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_009633	ATT	2	6	3539060	3539065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_009633	TAT	2	6	3539408	3539413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_009633	TCT	2	6	3539425	3539430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_009633	GTCATC	2	12	3539533	3539544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_009633	ATA	2	6	3539604	3539609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_009633	AGA	2	6	3539611	3539616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_009633	GAAA	2	8	3539651	3539658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_009633	TAA	2	6	3539705	3539710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_009633	GAG	2	6	3539742	3539747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_009633	AAG	2	6	3540245	3540250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_009633	T	6	6	3540257	3540262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_009633	CTT	2	6	3540276	3540281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_009633	TAAT	2	8	3540284	3540291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_009633	TCT	2	6	3542169	3542174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_009633	TCA	2	6	3542175	3542180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_009633	TTCAA	2	10	3542192	3542201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15027	NC_009633	ATT	2	6	3542206	3542211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_009633	CATT	2	8	3542222	3542229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15029	NC_009633	AT	3	6	3542358	3542363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_009633	AT	3	6	3542374	3542379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_009633	CAT	2	6	3542393	3542398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15033	NC_009633	TAC	3	9	3542459	3542467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_009633	CTT	2	6	3542538	3542543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_009633	CCT	2	6	3544901	3544906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_009633	TTAAT	2	10	3544912	3544921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_009633	TTA	2	6	3544925	3544930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_009633	TCC	2	6	3545722	3545727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15039	NC_009633	ATT	2	6	3545792	3545797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_009633	CATATC	2	12	3545807	3545818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_009633	AT	3	6	3545848	3545853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_009633	TTCT	2	8	3545949	3545956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15043	NC_009633	A	8	8	3546008	3546015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_009633	T	6	6	3546084	3546089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_009633	ATA	2	6	3547855	3547860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_009633	AAG	2	6	3547904	3547909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_009633	TAA	2	6	3549702	3549707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_009633	C	7	7	3549709	3549715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15049	NC_009633	CTC	2	6	3550899	3550904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15050	NC_009633	CCT	2	6	3553368	3553373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15051	NC_009633	TA	3	6	3553380	3553385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_009633	AAT	2	6	3554045	3554050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_009633	CT	3	6	3554069	3554074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15054	NC_009633	TCC	2	6	3555818	3555823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15055	NC_009633	CTT	2	6	3555911	3555916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_009633	TAAGT	2	10	3556009	3556018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_009633	ACT	2	6	3556026	3556031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_009633	ATT	2	6	3556060	3556065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_009633	ATTT	2	8	3556109	3556116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_009633	TCT	2	6	3556512	3556517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_009633	CAC	2	6	3557770	3557775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_009633	A	7	7	3560617	3560623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_009633	TTA	2	6	3560773	3560778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_009633	A	7	7	3560826	3560832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_009633	GCG	2	6	3560911	3560916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_009633	AT	3	6	3560947	3560952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_009633	CATATT	2	12	3561013	3561024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15068	NC_009633	TATT	3	12	3561021	3561032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_009633	ATTA	2	8	3561064	3561071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_009633	ATT	2	6	3561084	3561089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_009633	TAC	2	6	3561126	3561131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15073	NC_009633	TCTTTT	2	12	3563552	3563563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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15077	NC_009633	T	6	6	3563614	3563619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15080	NC_009633	A	7	7	3570454	3570460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_009633	CAA	2	6	3570483	3570488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15084	NC_009633	CTT	2	6	3570592	3570597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15086	NC_009633	TAT	2	6	3570632	3570637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15091	NC_009633	TG	3	6	3572082	3572087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_009633	TATAA	2	10	3572089	3572098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_009633	TAC	2	6	3572110	3572115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15096	NC_009633	ATT	2	6	3573378	3573383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_009633	T	6	6	3573389	3573394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_009633	ATCCC	2	10	3575274	3575283	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15099	NC_009633	TAT	2	6	3575288	3575293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_009633	A	6	6	3575307	3575312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_009633	TATTT	2	10	3575334	3575343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_009633	TCC	2	6	3583258	3583263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15103	NC_009633	ATC	2	6	3583687	3583692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15105	NC_009633	T	8	8	3584783	3584790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_009633	ATTT	2	8	3584833	3584840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_009633	TAAA	2	8	3584894	3584901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_009633	ACCGT	2	10	3584905	3584914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15109	NC_009633	A	7	7	3584956	3584962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_009633	TAGG	2	8	3585027	3585034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_009633	ATA	2	6	3585114	3585119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_009633	CTT	2	6	3585122	3585127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_009633	CCT	2	6	3585644	3585649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15114	NC_009633	GAA	2	6	3585661	3585666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_009633	AT	3	6	3585673	3585678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_009633	TAT	2	6	3585683	3585688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_009633	TA	3	6	3585715	3585720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_009633	C	6	6	3585742	3585747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15119	NC_009633	CGA	2	6	3585894	3585899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15121	NC_009633	TCT	2	6	3585988	3585993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_009633	GAGC	2	8	3586045	3586052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15123	NC_009633	ATTCA	2	10	3586711	3586720	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15124	NC_009633	T	6	6	3586721	3586726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15127	NC_009633	TAT	2	6	3587750	3587755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15129	NC_009633	C	6	6	3588513	3588518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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