MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_009633	AT	3	6	3406203	3406208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_009633	ATG	2	6	3406216	3406221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_009633	AGT	2	6	3406271	3406276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_009633	AAAT	2	8	3406299	3406306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_009633	CCT	2	6	3406825	3406830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_009633	AGTT	2	8	3406867	3406874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_009633	CTC	2	6	3406914	3406919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14508	NC_009633	TA	3	6	3406984	3406989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_009633	ATG	2	6	3406993	3406998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_009633	GT	3	6	3407324	3407329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_009633	CCA	2	6	3407335	3407340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_009633	CG	3	6	3407362	3407367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14513	NC_009633	ATA	2	6	3407416	3407421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_009633	CTT	2	6	3407464	3407469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_009633	TATAG	2	10	3407481	3407490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_009633	AT	3	6	3407494	3407499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_009633	TCT	2	6	3407502	3407507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_009633	TAA	2	6	3407520	3407525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_009633	GCTCC	2	10	3407647	3407656	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14520	NC_009633	GAT	2	6	3407730	3407735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_009633	AT	3	6	3407763	3407768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_009633	ATA	2	6	3407791	3407796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_009633	TAA	2	6	3407798	3407803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_009633	T	6	6	3408287	3408292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_009633	ATT	2	6	3408305	3408310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_009633	CCCTA	2	10	3408361	3408370	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14527	NC_009633	GAGT	2	8	3408372	3408379	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_009633	CCA	2	6	3408408	3408413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14529	NC_009633	TAG	2	6	3408419	3408424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_009633	AGT	2	6	3408443	3408448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_009633	GAA	2	6	3408461	3408466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_009633	TTA	2	6	3409377	3409382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_009633	TTA	2	6	3409409	3409414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_009633	ATA	2	6	3409434	3409439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_009633	A	8	8	3409444	3409451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_009633	GTG	2	6	3409557	3409562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_009633	AGTA	2	8	3409644	3409651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_009633	ACA	2	6	3410340	3410345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_009633	A	7	7	3411447	3411453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_009633	CTT	2	6	3411595	3411600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_009633	CTA	2	6	3411667	3411672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_009633	TAC	2	6	3411731	3411736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_009633	AATA	2	8	3411750	3411757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_009633	ATG	2	6	3411782	3411787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_009633	TAG	2	6	3411810	3411815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_009633	ATG	2	6	3411819	3411824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_009633	TTG	2	6	3411852	3411857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_009633	GTTC	2	8	3411866	3411873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14549	NC_009633	AGG	2	6	3411894	3411899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_009633	AAT	2	6	3414619	3414624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_009633	ATG	2	6	3414626	3414631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_009633	AATAG	2	10	3414812	3414821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_009633	ACT	2	6	3414827	3414832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14554	NC_009633	CATT	2	8	3414865	3414872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14555	NC_009633	GATG	2	8	3414907	3414914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_009633	GTA	2	6	3414917	3414922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14559	NC_009633	AAC	2	6	3415269	3415274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14560	NC_009633	CA	3	6	3415284	3415289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14561	NC_009633	GGT	2	6	3415370	3415375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_009633	GTG	2	6	3415522	3415527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_009633	CGC	2	6	3415596	3415601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14564	NC_009633	CAA	2	6	3415606	3415611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_009633	T	7	7	3416390	3416396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14568	NC_009633	TAC	2	6	3416483	3416488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_009633	A	7	7	3416549	3416555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_009633	CT	3	6	3416644	3416649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14571	NC_009633	TGA	2	6	3416667	3416672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14573	NC_009633	AAC	2	6	3416704	3416709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_009633	TC	3	6	3416710	3416715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14575	NC_009633	TGTT	2	8	3416720	3416727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_009633	ATTT	3	12	3416738	3416749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14579	NC_009633	T	7	7	3418041	3418047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_009633	GTG	2	6	3418150	3418155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_009633	TGCA	2	8	3418176	3418183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14582	NC_009633	CTT	2	6	3418192	3418197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_009633	CTT	2	6	3418205	3418210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_009633	GAT	2	6	3418237	3418242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_009633	ATT	2	6	3418281	3418286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_009633	ATTTT	2	10	3418291	3418300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_009633	AT	4	8	3418331	3418338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_009633	CTT	2	6	3418966	3418971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14589	NC_009633	CAC	2	6	3419033	3419038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14591	NC_009633	T	6	6	3419745	3419750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_009633	T	6	6	3419773	3419778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_009633	CCTTT	2	10	3419914	3419923	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14594	NC_009633	TGC	2	6	3419930	3419935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14596	NC_009633	ATT	2	6	3420049	3420054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_009633	ATA	2	6	3420065	3420070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_009633	TAT	2	6	3420631	3420636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_009633	AC	3	6	3420653	3420658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14600	NC_009633	A	6	6	3420664	3420669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_009633	CT	3	6	3420697	3420702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14602	NC_009633	CT	3	6	3420787	3420792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14603	NC_009633	ATA	2	6	3421984	3421989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_009633	AT	3	6	3422012	3422017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_009633	TATAG	2	10	3422851	3422860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_009633	AT	3	6	3422864	3422869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_009633	TCT	2	6	3422872	3422877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14609	NC_009633	TTTG	2	8	3422962	3422969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_009633	T	7	7	3423031	3423037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_009633	TAA	2	6	3423074	3423079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_009633	TA	3	6	3423103	3423108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_009633	ATA	2	6	3423133	3423138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_009633	GAT	2	6	3423168	3423173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_009633	TAAA	2	8	3424872	3424879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_009633	AAGC	2	8	3424880	3424887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14617	NC_009633	GCTT	2	8	3424909	3424916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14618	NC_009633	ATTT	2	8	3426873	3426880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_009633	C	6	6	3430864	3430869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14620	NC_009633	TCC	2	6	3432154	3432159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14621	NC_009633	TTGTT	3	15	3432160	3432174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_009633	TAA	2	6	3432258	3432263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_009633	TGA	2	6	3432296	3432301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_009633	AGCT	2	8	3432371	3432378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14625	NC_009633	CT	3	6	3432411	3432416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14626	NC_009633	AGATA	2	10	3432417	3432426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_009633	T	6	6	3432444	3432449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_009633	TTC	2	6	3432510	3432515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14629	NC_009633	TCT	2	6	3432528	3432533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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