MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009633	TTA	2	6	3316133	3316138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009633	GAA	2	6	3316153	3316158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_009633	TAT	2	6	3316178	3316183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_009633	AAT	2	6	3316186	3316191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_009633	TTTA	2	8	3316196	3316203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_009633	T	6	6	3316239	3316244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_009633	A	7	7	3316252	3316258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_009633	TCAC	2	8	3316316	3316323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_009633	ATT	2	6	3316330	3316335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_009633	CGT	2	6	3316359	3316364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_009633	ATA	2	6	3316367	3316372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_009633	A	6	6	3316383	3316388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_009633	A	6	6	3316411	3316416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_009633	ATG	2	6	3316422	3316427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_009633	CCT	2	6	3317206	3317211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_009633	CA	3	6	3317267	3317272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_009633	TAA	2	6	3317311	3317316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_009633	TCC	2	6	3317326	3317331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_009633	AAT	2	6	3317342	3317347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_009633	T	6	6	3317395	3317400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_009633	A	7	7	3318482	3318488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_009633	GTT	2	6	3318492	3318497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_009633	T	6	6	3318496	3318501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_009633	TA	3	6	3318547	3318552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_009633	TGT	2	6	3318585	3318590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_009633	TTAT	2	8	3318626	3318633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_009633	AT	3	6	3318916	3318921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_009633	CCTT	2	8	3318926	3318933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14029	NC_009633	TCA	2	6	3318959	3318964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14031	NC_009633	AAG	2	6	3319291	3319296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_009633	ACCC	2	8	3319340	3319347	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14033	NC_009633	CTT	2	6	3319350	3319355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_009633	ATT	2	6	3319359	3319364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_009633	GCTT	2	8	3319385	3319392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14036	NC_009633	TAC	2	6	3319635	3319640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_009633	TTGT	2	8	3319722	3319729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_009633	AAAAT	2	10	3319937	3319946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_009633	GTT	2	6	3319998	3320003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_009633	TAAA	2	8	3320019	3320026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_009633	CAAATT	2	12	3320064	3320075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14042	NC_009633	TTAT	2	8	3321279	3321286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_009633	TA	3	6	3321346	3321351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_009633	TAC	2	6	3321370	3321375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_009633	TTTC	2	8	3321429	3321436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14047	NC_009633	TAC	2	6	3322053	3322058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14049	NC_009633	TTA	2	6	3322082	3322087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_009633	CT	3	6	3322151	3322156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_009633	TAT	2	6	3322216	3322221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009633	TAA	2	6	3322354	3322359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009633	AAT	2	6	3322368	3322373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_009633	AGTT	2	8	3322392	3322399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_009633	AGG	2	6	3322661	3322666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_009633	ATA	2	6	3322681	3322686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009633	GAA	2	6	3322731	3322736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009633	GAT	2	6	3322839	3322844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009633	ACA	2	6	3322850	3322855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_009633	T	6	6	3322969	3322974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_009633	ATT	2	6	3322980	3322985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_009633	TA	3	6	3323010	3323015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_009633	GTA	2	6	3323045	3323050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_009633	A	6	6	3323067	3323072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_009633	A	7	7	3323136	3323142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_009633	GCTTT	2	10	3323150	3323159	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14067	NC_009633	ACCT	2	8	3323507	3323514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_009633	TTC	2	6	3323515	3323520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_009633	AG	3	6	3323536	3323541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_009633	ATG	2	6	3323573	3323578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_009633	TC	3	6	3323583	3323588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_009633	CCT	2	6	3326279	3326284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_009633	AAT	2	6	3326298	3326303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_009633	TCA	2	6	3326385	3326390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_009633	TAAT	2	8	3326397	3326404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_009633	ATT	2	6	3327173	3327178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_009633	ACT	2	6	3327193	3327198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14079	NC_009633	TTA	2	6	3328913	3328918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_009633	AGTT	2	8	3329437	3329444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_009633	AT	4	8	3329475	3329482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_009633	T	6	6	3329491	3329496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_009633	TAC	2	6	3329531	3329536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_009633	TGATT	2	10	3329665	3329674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_009633	A	7	7	3329700	3329706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_009633	CTAC	2	8	3329742	3329749	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_009633	ATT	2	6	3329760	3329765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_009633	ATT	2	6	3331843	3331848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_009633	C	6	6	3331867	3331872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14090	NC_009633	ATT	2	6	3331920	3331925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_009633	GAA	2	6	3331930	3331935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_009633	ATA	2	6	3332025	3332030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_009633	GCT	2	6	3332121	3332126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14096	NC_009633	GATT	2	8	3332174	3332181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_009633	AT	4	8	3332202	3332209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_009633	A	6	6	3332289	3332294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_009633	AGG	2	6	3332319	3332324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_009633	CTT	2	6	3333031	3333036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_009633	TTA	2	6	3333057	3333062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_009633	AGTTTC	2	12	3333076	3333087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14103	NC_009633	T	7	7	3333093	3333099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_009633	AC	3	6	3333108	3333113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_009633	CAA	2	6	3333114	3333119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14108	NC_009633	AAG	2	6	3333224	3333229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_009633	TTAT	2	8	3333237	3333244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_009633	GAT	2	6	3333252	3333257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_009633	TCAA	2	8	3333263	3333270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14112	NC_009633	AAGA	2	8	3333317	3333324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_009633	ACCT	2	8	3333422	3333429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14114	NC_009633	TA	3	6	3333449	3333454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_009633	ATC	3	9	3333746	3333754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_009633	TC	3	6	3333782	3333787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14117	NC_009633	TCA	2	6	3333795	3333800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_009633	CAA	2	6	3333826	3333831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_009633	CTC	2	6	3333852	3333857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_009633	ATC	2	6	3333951	3333956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_009633	CAT	2	6	3334028	3334033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_009633	CT	3	6	3334034	3334039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14123	NC_009633	ATG	2	6	3334187	3334192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_009633	CAA	2	6	3334207	3334212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_009633	C	6	6	3334270	3334275	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14126	NC_009633	CAT	2	6	3334332	3334337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_009633	TTCAG	2	10	3334427	3334436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14128	NC_009633	TAC	2	6	3334446	3334451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_009633	AAT	2	6	3334482	3334487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14131	NC_009633	AC	3	6	3334527	3334532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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