MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009633	TAAA	2	8	2574246	2574253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_009633	AAT	2	6	2574260	2574265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009633	GTT	2	6	2574270	2574275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_009633	ATC	2	6	2574323	2574328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_009633	TTGTT	2	10	2574358	2574367	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_009633	GGT	2	6	2574507	2574512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_009633	AATT	2	8	2574524	2574531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_009633	CGACA	2	10	2574635	2574644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11509	NC_009633	AAAG	2	8	2574777	2574784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_009633	GTT	2	6	2574800	2574805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_009633	GTT	2	6	2574810	2574815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_009633	GTT	2	6	2574820	2574825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_009633	TAG	2	6	2574828	2574833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_009633	ATG	2	6	2574847	2574852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_009633	TAC	2	6	2575013	2575018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_009633	AC	3	6	2575017	2575022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_009633	CTA	2	6	2575025	2575030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_009633	CAT	2	6	2575032	2575037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_009633	TACTT	2	10	2575050	2575059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11520	NC_009633	GTC	2	6	2575104	2575109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_009633	TAA	2	6	2575128	2575133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_009633	ATATA	2	10	2576332	2576341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_009633	A	7	7	2576341	2576347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_009633	AGG	2	6	2576354	2576359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_009633	TAA	2	6	2576995	2577000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_009633	TAAAA	2	10	2577016	2577025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_009633	A	6	6	2577022	2577027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_009633	CTTT	2	8	2577047	2577054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_009633	T	6	6	2577052	2577057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_009633	ATT	2	6	2577096	2577101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_009633	T	7	7	2577109	2577115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_009633	A	6	6	2577122	2577127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_009633	CTC	2	6	2577133	2577138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_009633	AATTG	2	10	2577154	2577163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_009633	A	6	6	2578687	2578692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_009633	ACT	2	6	2578724	2578729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_009633	TAT	2	6	2578755	2578760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_009633	TA	3	6	2578794	2578799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_009633	TTTC	2	8	2580100	2580107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11540	NC_009633	TTTA	2	8	2580274	2580281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_009633	AT	4	8	2580351	2580358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_009633	TATTC	2	10	2582515	2582524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11543	NC_009633	A	7	7	2582547	2582553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_009633	TATT	2	8	2582558	2582565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_009633	AAAT	2	8	2582574	2582581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_009633	ATA	2	6	2582597	2582602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_009633	ACTC	2	8	2582916	2582923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_009633	GTT	2	6	2582934	2582939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_009633	GGGT	2	8	2585839	2585846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_009633	TCA	2	6	2588520	2588525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_009633	TAT	2	6	2588532	2588537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_009633	ACTCA	2	10	2588564	2588573	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11553	NC_009633	TCC	2	6	2590036	2590041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_009633	TA	3	6	2590055	2590060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_009633	ATT	2	6	2590071	2590076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_009633	TAAA	2	8	2590086	2590093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_009633	A	8	8	2590091	2590098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_009633	TCC	2	6	2591678	2591683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_009633	TAA	2	6	2591954	2591959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_009633	CTT	2	6	2591990	2591995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_009633	TCCTT	2	10	2593099	2593108	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11562	NC_009633	CTA	2	6	2593150	2593155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_009633	AT	3	6	2593171	2593176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_009633	T	7	7	2593176	2593182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_009633	GAGCG	2	10	2593267	2593276	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11566	NC_009633	GTT	2	6	2593310	2593315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_009633	GTT	2	6	2593349	2593354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_009633	GAT	2	6	2593380	2593385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_009633	T	6	6	2593763	2593768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_009633	ATA	2	6	2593771	2593776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_009633	TCC	2	6	2604126	2604131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_009633	CCT	2	6	2607736	2607741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_009633	TCC	2	6	2609234	2609239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_009633	TCCC	2	8	2615395	2615402	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11575	NC_009633	CAT	2	6	2615429	2615434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11577	NC_009633	A	6	6	2615654	2615659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_009633	AC	3	6	2616949	2616954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_009633	ATT	2	6	2616976	2616981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_009633	TAC	2	6	2616986	2616991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_009633	ACCC	2	8	2618237	2618244	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11582	NC_009633	CTTT	2	8	2618270	2618277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_009633	CTTT	2	8	2618727	2618734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11584	NC_009633	TTC	2	6	2619216	2619221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_009633	TCA	2	6	2619251	2619256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_009633	CTT	2	6	2619291	2619296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_009633	CCT	2	6	2621977	2621982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_009633	CTTT	2	8	2621992	2621999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_009633	CCA	2	6	2622103	2622108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_009633	TATC	2	8	2622164	2622171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11592	NC_009633	CAT	2	6	2622172	2622177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_009633	TAT	2	6	2622255	2622260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_009633	CTCC	2	8	2622263	2622270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11595	NC_009633	AAT	2	6	2622299	2622304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_009633	GTA	2	6	2622355	2622360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_009633	CCT	2	6	2622875	2622880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_009633	TTC	2	6	2623522	2623527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_009633	C	6	6	2623546	2623551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11600	NC_009633	ATA	2	6	2623571	2623576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_009633	TAAT	2	8	2623597	2623604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_009633	GCT	2	6	2623608	2623613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_009633	TAC	2	6	2625436	2625441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_009633	TGG	2	6	2625484	2625489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11606	NC_009633	CCT	2	6	2630537	2630542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11607	NC_009633	CCT	2	6	2631325	2631330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11608	NC_009633	TAT	2	6	2631374	2631379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_009633	T	7	7	2631406	2631412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_009633	TAT	2	6	2631414	2631419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_009633	TGTT	2	8	2631428	2631435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_009633	TA	3	6	2631451	2631456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_009633	AGG	2	6	2631504	2631509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_009633	TTG	2	6	2631885	2631890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_009633	TATC	2	8	2632320	2632327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_009633	TATC	3	12	2632329	2632340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_009633	TA	5	10	2632343	2632352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_009633	ATAG	3	12	2632359	2632370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_009633	AT	3	6	2632371	2632376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_009633	TG	3	6	2632389	2632394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_009633	ATT	2	6	2632424	2632429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_009633	AAG	2	6	2632494	2632499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_009633	TG	3	6	2632511	2632516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_009633	TG	3	6	2632534	2632539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_009633	T	6	6	2632546	2632551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_009633	TATTTT	2	12	2632637	2632648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_009633	ATT	2	6	2632684	2632689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_009633	TGTCG	2	10	2633234	2633243	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11629	NC_009633	CCT	2	6	2635179	2635184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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