MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	CCG	2	6	326395	326400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_009484	AGAC	2	8	326407	326414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_009484	TGG	2	6	326980	326985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009484	C	13	13	326991	327003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_009484	AGG	2	6	328936	328941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009484	ATGG	2	8	328947	328954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009484	TCG	2	6	328977	328982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009484	GGC	2	6	328992	328997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009484	TGA	2	6	329001	329006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009484	GGCAGC	2	12	329022	329033	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009484	CGG	2	6	329149	329154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009484	CTT	2	6	329262	329267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009484	GCG	2	6	329298	329303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009484	CA	3	6	330567	330572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_009484	CCG	2	6	330599	330604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_009484	A	7	7	330618	330624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009484	CGA	2	6	330727	330732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009484	CCA	2	6	330744	330749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_009484	ACC	2	6	330824	330829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_009484	TGG	2	6	330834	330839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009484	TCA	2	6	330960	330965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009484	CGGC	2	8	331017	331024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_009484	TCC	2	6	331038	331043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_009484	CG	3	6	331084	331089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_009484	TCG	2	6	331158	331163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009484	ACT	2	6	331191	331196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009484	GTT	2	6	331264	331269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009484	GGAG	2	8	331296	331303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009484	CCG	2	6	331389	331394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_009484	CCG	2	6	338151	338156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_009484	GCC	2	6	338162	338167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_009484	GCCA	2	8	338195	338202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_009484	ACA	2	6	338214	338219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009484	CGC	2	6	338276	338281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_009484	ACA	2	6	338358	338363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009484	TTTA	2	8	338442	338449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009484	CCG	2	6	338533	338538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_009484	TGG	2	6	338551	338556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009484	GCC	2	6	338568	338573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_009484	ACC	2	6	338607	338612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_009484	A	6	6	338655	338660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009484	AGGA	2	8	338713	338720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009484	GCA	2	6	338741	338746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009484	CGAA	2	8	338776	338783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_009484	ATA	2	6	338828	338833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009484	GAT	2	6	338903	338908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009484	TCC	3	9	338944	338952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_009484	GGC	2	6	338992	338997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009484	TGA	2	6	339068	339073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009484	CCG	2	6	339152	339157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_009484	GCG	2	6	341622	341627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009484	CCG	2	6	341654	341659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_009484	CGT	2	6	341711	341716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009484	GCC	2	6	341726	341731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_009484	CGC	2	6	341743	341748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_009484	CCTG	2	8	341827	341834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_009484	GCG	2	6	341867	341872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_009484	GCC	2	6	341914	341919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_009484	CGG	2	6	341931	341936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009484	GC	3	6	342549	342554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_009484	TGA	2	6	342569	342574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009484	TCT	2	6	342607	342612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009484	CCG	2	6	342638	342643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_009484	GAA	2	6	342678	342683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009484	CGCA	2	8	350725	350732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_009484	CCGG	2	8	350736	350743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_009484	GCC	2	6	350751	350756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_009484	GC	3	6	350757	350762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_009484	CAT	2	6	350768	350773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009484	CGG	2	6	353045	353050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009484	CGC	2	6	353059	353064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_009484	GCCG	2	8	353067	353074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_009484	GCCC	2	8	353093	353100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
575	NC_009484	AGGCG	2	10	353133	353142	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
576	NC_009484	GGCC	2	8	353167	353174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_009484	CTTC	2	8	356562	356569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_009484	CG	3	6	356607	356612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_009484	GGC	2	6	356618	356623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_009484	AT	3	6	365811	365816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009484	CCCGG	2	10	365829	365838	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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588	NC_009484	CGG	2	6	367755	367760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009484	TC	3	6	369973	369978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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592	NC_009484	GTCAA	2	10	371948	371957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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594	NC_009484	CG	3	6	372014	372019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_009484	CGC	4	12	372032	372043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_009484	GACC	2	8	372070	372077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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599	NC_009484	GTC	2	6	374633	374638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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603	NC_009484	AGCC	2	8	375483	375490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_009484	CCCG	2	8	376970	376977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
605	NC_009484	CCCG	2	8	377004	377011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
606	NC_009484	CCCG	2	8	377038	377045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
607	NC_009484	CGC	2	6	377080	377085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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614	NC_009484	CGGC	2	8	388766	388773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009484	CGT	2	6	391219	391224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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619	NC_009484	GC	3	6	395772	395777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_009484	GCC	2	6	395847	395852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_009484	TCG	2	6	395855	395860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_009484	CG	4	8	397034	397041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_009484	CCCCG	2	10	397054	397063	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
633	NC_009484	GCC	2	6	397078	397083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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635	NC_009484	TGC	2	6	397100	397105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_009484	CGA	2	6	397154	397159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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919	NC_009484	G	6	6	511139	511144	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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931	NC_009484	CGG	2	6	517177	517182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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948	NC_009484	ACA	2	6	535129	535134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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950	NC_009484	CGG	2	6	536419	536424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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976	NC_009484	CA	3	6	546303	546308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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988	NC_009484	CTC	2	6	550471	550476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_009484	CATT	2	8	555046	555053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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