MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 11953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008782	GTC	2	6	1509746	1509751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_008782	TGC	2	6	1509763	1509768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008782	GCA	2	6	1509804	1509809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008782	GCA	2	6	1509892	1509897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008782	CCTC	2	8	1511804	1511811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4006	NC_008782	TTG	2	6	1514854	1514859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008782	GAA	2	6	1515718	1515723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008782	GCC	2	6	1515743	1515748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_008782	CAT	2	6	1515751	1515756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008782	CGC	2	6	1515835	1515840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_008782	CGT	2	6	1515848	1515853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008782	GGC	2	6	1516013	1516018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008782	GCC	2	6	1516023	1516028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_008782	CCGG	2	8	1516035	1516042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_008782	GTA	2	6	1516045	1516050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008782	AT	3	6	1516085	1516090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008782	GTGCG	2	10	1516104	1516113	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_008782	AG	3	6	1516192	1516197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008782	AGG	2	6	1516206	1516211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008782	ACC	2	6	1516222	1516227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_008782	GCC	2	6	1516228	1516233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_008782	TGC	2	6	1516261	1516266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008782	TTG	2	6	1516307	1516312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008782	GAA	2	6	1516364	1516369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008782	AAC	2	6	1516381	1516386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008782	T	6	6	1516453	1516458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008782	AAG	2	6	1516479	1516484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008782	GT	3	6	1516492	1516497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008782	CAA	2	6	1516507	1516512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008782	ACCG	2	8	1516548	1516555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_008782	CCT	2	6	1516597	1516602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_008782	T	6	6	1516611	1516616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008782	GA	3	6	1516624	1516629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008782	AGCG	2	8	1516724	1516731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008782	AGCC	2	8	1516789	1516796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_008782	GTG	2	6	1516800	1516805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008782	GGA	2	6	1516847	1516852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008782	AG	3	6	1516958	1516963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008782	CGG	2	6	1516968	1516973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_008782	GGC	2	6	1517035	1517040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008782	CCT	2	6	1517442	1517447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_008782	CG	3	6	1517841	1517846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_008782	GC	3	6	1517885	1517890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_008782	TGG	2	6	1517899	1517904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008782	CG	3	6	1517911	1517916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_008782	GGC	2	6	1517923	1517928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008782	GC	3	6	1517939	1517944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_008782	TCG	2	6	1517974	1517979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008782	GCG	2	6	1517993	1517998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008782	CTG	2	6	1518027	1518032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008782	GGCT	2	8	1518082	1518089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_008782	AGC	2	6	1518118	1518123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008782	CGG	2	6	1518290	1518295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_008782	CGA	2	6	1518494	1518499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_008782	GC	3	6	1518552	1518557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_008782	CAG	2	6	1518590	1518595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_008782	GGC	2	6	1518648	1518653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008782	GATG	2	8	1518756	1518763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008782	CAC	2	6	1518784	1518789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_008782	TGG	2	6	1519951	1519956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008782	GTT	2	6	1519974	1519979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008782	T	6	6	1522191	1522196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008782	GCAA	2	8	1522230	1522237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_008782	AAG	2	6	1522262	1522267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008782	T	7	7	1522356	1522362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008782	GCT	2	6	1522735	1522740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008782	GTC	2	6	1522753	1522758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008782	GAA	2	6	1522802	1522807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008782	CGG	2	6	1524282	1524287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008782	GGA	2	6	1527293	1527298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008782	ATG	2	6	1529159	1529164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008782	A	6	6	1529166	1529171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008782	CAA	2	6	1529231	1529236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_008782	GTAC	2	8	1530315	1530322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_008782	A	6	6	1530330	1530335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008782	CCAG	2	8	1530342	1530349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_008782	CAA	2	6	1530980	1530985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008782	GTT	2	6	1530994	1530999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008782	GGC	2	6	1531050	1531055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008782	CTG	2	6	1531113	1531118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_008782	GAC	2	6	1531170	1531175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_008782	CTG	2	6	1532793	1532798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008782	TG	3	6	1532797	1532802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008782	TCC	2	6	1532829	1532834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_008782	GCCG	2	8	1532874	1532881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_008782	CAC	2	6	1532943	1532948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_008782	AAG	2	6	1533039	1533044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008782	CA	3	6	1533117	1533122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_008782	AGGT	2	8	1533123	1533130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008782	CAA	2	6	1533149	1533154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008782	C	6	6	1533350	1533355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4092	NC_008782	T	6	6	1534639	1534644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008782	AAC	2	6	1537810	1537815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008782	CAG	2	6	1541027	1541032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008782	GTG	2	6	1541066	1541071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008782	GCC	2	6	1541082	1541087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_008782	AGC	2	6	1541145	1541150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_008782	CGA	2	6	1541182	1541187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008782	GCC	2	6	1541226	1541231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_008782	C	6	6	1541289	1541294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4101	NC_008782	ATC	2	6	1541331	1541336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008782	TCG	2	6	1541359	1541364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008782	GC	3	6	1541365	1541370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_008782	GGCC	2	8	1541399	1541406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_008782	GGCC	2	8	1541438	1541445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_008782	GAGGCC	2	12	1541448	1541459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_008782	GCC	2	6	1541475	1541480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_008782	GCCG	2	8	1541493	1541500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_008782	GCCC	2	8	1541509	1541516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4110	NC_008782	AGC	2	6	1541587	1541592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_008782	TCGG	2	8	1541646	1541653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_008782	GTT	2	6	1542045	1542050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008782	TGA	2	6	1542064	1542069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008782	CAC	2	6	1542212	1542217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_008782	GGTC	2	8	1542221	1542228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_008782	GCA	2	6	1542243	1542248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008782	AAG	2	6	1542267	1542272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008782	AGA	2	6	1542285	1542290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008782	TCC	2	6	1542441	1542446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_008782	CCG	2	6	1544110	1544115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_008782	GCA	2	6	1544117	1544122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008782	ACC	2	6	1544154	1544159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_008782	TTC	2	6	1544166	1544171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008782	CAG	2	6	1544204	1544209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008782	AGA	2	6	1544317	1544322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008782	GCC	2	6	1544324	1544329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_008782	CCG	2	6	1544350	1544355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_008782	GGTG	2	8	1544392	1544399	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008782	ATC	2	6	1544409	1544414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_008782	GC	3	6	1544450	1544455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_008782	GCT	2	6	1544463	1544468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008782	GC	3	6	1544510	1544515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_008782	ATC	2	6	1544525	1544530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_008782	GCA	2	6	1544544	1544549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_008782	GCCAC	2	10	1544563	1544572	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4136	NC_008782	CAA	2	6	1544581	1544586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_008782	TGCGCG	2	12	1544635	1544646	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_008782	CGA	2	6	1544667	1544672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_008782	ACG	2	6	1544690	1544695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_008782	GCA	2	6	1544699	1544704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_008782	CTCA	2	8	1544781	1544788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_008782	AGCA	2	8	1544789	1544796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4143	NC_008782	GCC	2	6	1544850	1544855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4144	NC_008782	CAC	2	6	1544914	1544919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4145	NC_008782	CTTGC	2	10	1544939	1544948	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4146	NC_008782	CTG	2	6	1544975	1544980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4147	NC_008782	TTC	2	6	1545024	1545029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_008782	ACTT	2	8	1545089	1545096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4149	NC_008782	CAG	2	6	1545172	1545177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_008782	GACC	2	8	1545215	1545222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4151	NC_008782	TCGA	2	8	1545230	1545237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4152	NC_008782	GAC	2	6	1545283	1545288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_008782	GGC	2	6	1545325	1545330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_008782	A	6	6	1545352	1545357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_008782	GTCT	2	8	1545405	1545412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_008782	AGC	2	6	1545445	1545450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_008782	TAAT	2	8	1545764	1545771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_008782	TGCA	2	8	1547214	1547221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4159	NC_008782	GCT	3	9	1547354	1547362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4160	NC_008782	CGG	2	6	1547363	1547368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4161	NC_008782	AAG	2	6	1547469	1547474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_008782	CAG	2	6	1547565	1547570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4163	NC_008782	GCT	3	9	1547618	1547626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4164	NC_008782	TCA	2	6	1547651	1547656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4166	NC_008782	GCG	2	6	1549028	1549033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4167	NC_008782	GTG	2	6	1549057	1549062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_008782	CTG	2	6	1549070	1549075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4169	NC_008782	ATT	2	6	1549158	1549163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4171	NC_008782	ACG	2	6	1551139	1551144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4172	NC_008782	ACG	2	6	1551186	1551191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4192	NC_008782	CGC	2	6	1554356	1554361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4243	NC_008782	GTC	2	6	1571056	1571061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_008782	GC	5	10	1571200	1571209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4246	NC_008782	AATG	2	8	1571236	1571243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_008782	CAG	2	6	1571306	1571311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_008782	AGC	2	6	1571316	1571321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4253	NC_008782	ATTA	2	8	1571539	1571546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_008782	TCG	2	6	1571598	1571603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_008782	GGC	2	6	1571607	1571612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_008782	TCA	2	6	1571664	1571669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_008782	GAT	2	6	1571702	1571707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_008782	TGAG	2	8	1571742	1571749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_008782	GC	3	6	1571780	1571785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_008782	TCG	2	6	1571827	1571832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_008782	GCTT	2	8	1571849	1571856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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