MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 11953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008782	GCC	2	6	4274221	4274226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_008782	CGC	2	6	4274262	4274267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_008782	CG	3	6	4274348	4274353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_008782	GCT	2	6	4274395	4274400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_008782	GCC	2	6	4274413	4274418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_008782	CCGA	2	8	4274436	4274443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_008782	CAA	3	9	4274445	4274453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_008782	TC	3	6	4274460	4274465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_008782	GCG	2	6	4275120	4275125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_008782	CGA	2	6	4275155	4275160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_008782	GAAGAC	2	12	4275164	4275175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11512	NC_008782	CG	3	6	4275178	4275183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_008782	GGCG	2	8	4283076	4283083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_008782	AGC	2	6	4283185	4283190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_008782	CAAA	2	8	4286056	4286063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_008782	CAA	2	6	4292699	4292704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_008782	CGC	2	6	4292750	4292755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_008782	T	7	7	4293418	4293424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_008782	T	7	7	4293428	4293434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008782	TCC	2	6	4293580	4293585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_008782	CT	3	6	4293590	4293595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11522	NC_008782	T	7	7	4293622	4293628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_008782	GCA	2	6	4293634	4293639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_008782	GC	3	6	4293644	4293649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_008782	GC	3	6	4293665	4293670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_008782	CGG	2	6	4293693	4293698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_008782	G	6	6	4294333	4294338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_008782	GC	3	6	4294375	4294380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11529	NC_008782	CGGC	2	8	4294381	4294388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_008782	TGCC	2	8	4295834	4295841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_008782	GCCA	2	8	4295849	4295856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_008782	A	6	6	4296465	4296470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_008782	CAA	2	6	4296488	4296493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_008782	CAG	2	6	4296498	4296503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_008782	AATA	2	8	4296510	4296517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_008782	GC	4	8	4296845	4296852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11537	NC_008782	CCG	2	6	4296854	4296859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_008782	GC	3	6	4297324	4297329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11539	NC_008782	GAT	2	6	4297331	4297336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_008782	GT	3	6	4297350	4297355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_008782	GGC	2	6	4297367	4297372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_008782	GCC	2	6	4297375	4297380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11543	NC_008782	GACA	2	8	4297410	4297417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11544	NC_008782	TTC	2	6	4297444	4297449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_008782	A	6	6	4297464	4297469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_008782	CGCC	2	8	4297470	4297477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11547	NC_008782	GC	3	6	4297482	4297487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_008782	GTC	2	6	4297588	4297593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_008782	GCCCGG	2	12	4297619	4297630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_008782	CG	3	6	4297709	4297714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_008782	TC	3	6	4297759	4297764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_008782	GCC	2	6	4297772	4297777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_008782	CCT	2	6	4297803	4297808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_008782	CGGCA	2	10	4299089	4299098	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_008782	CAGCC	2	10	4299120	4299129	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11556	NC_008782	CG	3	6	4301134	4301139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_008782	GGCC	2	8	4301144	4301151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_008782	ATG	2	6	4301181	4301186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_008782	GCA	2	6	4301815	4301820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_008782	AGG	2	6	4302658	4302663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_008782	CTG	2	6	4302677	4302682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_008782	GTC	2	6	4302721	4302726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_008782	GCC	2	6	4302757	4302762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_008782	TC	3	6	4302794	4302799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11565	NC_008782	GAA	2	6	4302800	4302805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_008782	CGC	2	6	4302813	4302818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11567	NC_008782	CA	3	6	4302825	4302830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_008782	CTC	2	6	4303185	4303190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11569	NC_008782	CG	3	6	4303195	4303200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_008782	GGCC	2	8	4303205	4303212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_008782	ATG	2	6	4303242	4303247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11573	NC_008782	GCA	2	6	4303934	4303939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_008782	ATG	2	6	4303970	4303975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_008782	CAG	2	6	4304856	4304861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11577	NC_008782	A	6	6	4304923	4304928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_008782	TCC	2	6	4305513	4305518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11579	NC_008782	ATA	2	6	4305529	4305534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_008782	AGC	2	6	4305572	4305577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_008782	GAT	2	6	4305813	4305818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_008782	GGTC	2	8	4305856	4305863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_008782	GC	3	6	4305966	4305971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_008782	AG	3	6	4305989	4305994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_008782	CCG	2	6	4305995	4306000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_008782	CGG	2	6	4306024	4306029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_008782	TCAGG	2	10	4307349	4307358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11588	NC_008782	GAT	2	6	4307437	4307442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_008782	GGTC	2	8	4307480	4307487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_008782	GC	3	6	4307590	4307595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_008782	AG	3	6	4307613	4307618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_008782	CCG	2	6	4307619	4307624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_008782	CGG	2	6	4307648	4307653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_008782	TCAGG	2	10	4308973	4308982	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11595	NC_008782	CGC	2	6	4309048	4309053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11596	NC_008782	AAC	2	6	4309732	4309737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_008782	TAG	2	6	4309743	4309748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_008782	GAG	2	6	4310681	4310686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_008782	CAT	2	6	4310730	4310735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_008782	ATG	2	6	4310766	4310771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_008782	GT	3	6	4310801	4310806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_008782	CTT	2	6	4310830	4310835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_008782	CG	3	6	4310900	4310905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11604	NC_008782	AG	3	6	4311681	4311686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_008782	GAC	2	6	4311688	4311693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_008782	CG	3	6	4311699	4311704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11607	NC_008782	GC	3	6	4311726	4311731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11608	NC_008782	TC	4	8	4313832	4313839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_008782	TGC	2	6	4313925	4313930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_008782	GGCC	2	8	4313979	4313986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11611	NC_008782	A	6	6	4314941	4314946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_008782	CTGC	2	8	4314952	4314959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_008782	TCCA	2	8	4314966	4314973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_008782	AGC	2	6	4315019	4315024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_008782	TA	3	6	4315032	4315037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_008782	CCG	2	6	4315069	4315074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11617	NC_008782	GCA	2	6	4315090	4315095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_008782	CCCCG	2	10	4315099	4315108	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11619	NC_008782	GC	3	6	4315126	4315131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_008782	GCC	2	6	4316332	4316337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11621	NC_008782	GGC	2	6	4316345	4316350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_008782	AGA	2	6	4317684	4317689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_008782	ATT	2	6	4317753	4317758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_008782	CGGCG	2	10	4320991	4321000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11625	NC_008782	GCT	2	6	4322242	4322247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11627	NC_008782	CGGC	2	8	4324132	4324139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11628	NC_008782	ACG	2	6	4324473	4324478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11629	NC_008782	CACC	2	8	4324505	4324512	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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11921	NC_008782	CGGCG	2	10	4439824	4439833	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11922	NC_008782	ACC	2	6	4439870	4439875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11923	NC_008782	ACC	2	6	4439879	4439884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11924	NC_008782	GCG	2	6	4439885	4439890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.