MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 1

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008537	CCG	2	6	2749	2754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008537	GCG	2	6	2813	2818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008537	CGC	3	9	3976	3984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008537	AGC	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008537	CGG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008537	CG	3	6	5576	5581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008537	GCA	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008537	CAG	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008537	GAA	2	6	5622	5627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008537	CCG	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008537	GCC	2	6	5706	5711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008537	GCC	2	6	5752	5757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008537	TGG	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008537	CCGG	2	8	5869	5876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008537	CGAA	2	8	6723	6730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008537	GAC	2	6	6741	6746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008537	CTGT	2	8	6764	6771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008537	CTG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008537	GA	3	6	6908	6913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008537	GTG	3	9	6946	6954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008537	GCG	2	6	6958	6963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008537	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008537	GACCG	2	10	6999	7008	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008537	GGA	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008537	TAA	2	6	7054	7059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008537	CCGGC	2	10	7060	7069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008537	GCG	2	6	7098	7103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008537	CGC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008537	CCG	2	6	7135	7140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008537	GTC	2	6	7160	7165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008537	CAG	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008537	TTCTC	2	10	7901	7910	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008537	GT	3	6	7924	7929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008537	CGG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008537	T	6	6	8036	8041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008537	GCA	2	6	10303	10308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008537	TGC	2	6	10325	10330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008537	GGC	2	6	11135	11140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008537	CG	3	6	11144	11149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008537	A	6	6	12472	12477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008537	CAC	2	6	12502	12507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008537	AGC	2	6	12573	12578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008537	TCT	2	6	12601	12606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008537	A	6	6	12614	12619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008537	GGCC	2	8	13150	13157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008537	GT	3	6	13165	13170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008537	CCA	2	6	13186	13191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008537	CCCG	2	8	13250	13257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_008537	TC	3	6	13333	13338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008537	CCGGGA	2	12	14450	14461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008537	CAG	2	6	15678	15683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008537	GGC	2	6	15722	15727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008537	CCG	2	6	16371	16376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008537	GCC	2	6	16463	16468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008537	G	6	6	16487	16492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008537	TGT	2	6	16493	16498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008537	GA	3	6	16521	16526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008537	TCG	2	6	16555	16560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008537	C	6	6	17854	17859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_008537	CA	3	6	17964	17969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008537	GCT	2	6	17987	17992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008537	TGC	2	6	18041	18046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008537	G	6	6	18099	18104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008537	GAC	2	6	19392	19397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008537	GCC	2	6	19398	19403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008537	ACG	2	6	19550	19555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008537	CT	3	6	22333	22338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008537	GGCCC	2	10	22525	22534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_008537	AAAC	2	8	22638	22645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008537	TTCA	2	8	22658	22665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008537	CG	3	6	24749	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008537	GCC	2	6	24755	24760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008537	GCG	2	6	24846	24851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008537	TG	3	6	24880	24885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008537	TG	3	6	24916	24921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008537	AGC	2	6	24929	24934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008537	CGA	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008537	CGCTG	2	10	25504	25513	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008537	GGAT	2	8	25525	25532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008537	ATC	2	6	27624	27629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008537	CAG	2	6	27635	27640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008537	TGC	2	6	27641	27646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008537	AGCGGT	2	12	27745	27756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008537	GCTC	2	8	27917	27924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008537	TGT	2	6	27965	27970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008537	TCT	2	6	27997	28002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008537	GTG	2	6	28099	28104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008537	CG	3	6	28180	28185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008537	GGA	2	6	28225	28230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008537	GTC	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008537	CGT	2	6	28308	28313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008537	GAT	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008537	CGC	2	6	28437	28442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008537	AAC	2	6	28454	28459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008537	TGG	2	6	28468	28473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008537	GAA	2	6	28525	28530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008537	CG	4	8	28608	28615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008537	CG	3	6	28619	28624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008537	CTGTC	2	10	28671	28680	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008537	ACCG	2	8	28687	28694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008537	CGA	2	6	28784	28789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008537	GGCGC	2	10	28802	28811	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008537	TGT	2	6	28859	28864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008537	CGC	2	6	28865	28870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008537	CAA	2	6	28903	28908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008537	A	6	6	28969	28974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008537	GCAGGC	2	12	29050	29061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008537	TCT	2	6	29447	29452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008537	GCGTG	2	10	29453	29462	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008537	CGT	2	6	30726	30731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008537	GGC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008537	CCA	2	6	32283	32288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008537	CCCGG	2	10	33509	33518	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_008537	GAG	2	6	33521	33526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008537	GCA	2	6	33554	33559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008537	TTG	2	6	33595	33600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008537	AT	3	6	35750	35755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008537	CGAA	2	8	36461	36468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008537	CGGC	2	8	36479	36486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008537	GC	3	6	36506	36511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008537	CGC	2	6	36636	36641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008537	AGG	2	6	36719	36724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008537	GAT	2	6	36745	36750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008537	TGC	2	6	36756	36761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008537	GCGG	2	8	36779	36786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008537	GCT	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008537	GT	3	6	36943	36948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008537	CTC	2	6	36953	36958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008537	CGGTGC	2	12	37028	37039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008537	CT	3	6	37153	37158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008537	CCG	2	6	37856	37861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008537	TGG	3	9	37872	37880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008537	TCC	2	6	37927	37932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008537	GCC	2	6	41065	41070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008537	AAC	2	6	41204	41209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008537	AGA	2	6	41243	41248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008537	CGA	3	9	41277	41285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008537	CCA	2	6	41313	41318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008537	CGTCAG	2	12	41323	41334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008537	GTG	3	9	41421	41429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008537	CTG	2	6	41432	41437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008537	CG	3	6	43329	43334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008537	GCA	2	6	43393	43398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008537	GCG	2	6	43412	43417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008537	CTG	2	6	43450	43455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008537	TCT	2	6	43458	43463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008537	CGC	2	6	43488	43493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_008537	CGA	2	6	43917	43922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008537	CCCT	2	8	43970	43977	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_008537	GGACC	2	10	45112	45121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_008537	GTG	2	6	45151	45156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_008537	GGA	2	6	45221	45226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_008537	CGTC	2	8	45451	45458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_008537	TTG	3	9	46927	46935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008537	GCCG	2	8	47268	47275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_008537	GC	3	6	47307	47312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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291	NC_008537	CCG	2	6	82916	82921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_008537	GCAG	2	8	150566	150573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
429	NC_008537	TAG	2	6	150586	150591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_008537	ATG	2	6	150600	150605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_008537	CCT	2	6	150609	150614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_008537	TAC	2	6	150630	150635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_008537	TGGC	2	8	150641	150648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
434	NC_008537	GAC	2	6	153910	153915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_008537	CGCT	2	8	153963	153970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
436	NC_008537	AGG	2	6	155365	155370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NC_008537	CGG	2	6	155409	155414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_008537	G	6	6	155423	155428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_008537	CCG	2	6	155837	155842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_008537	G	6	6	155857	155862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_008537	CCGG	2	8	157452	157459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_008537	CGG	2	6	157493	157498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_008537	CCTTT	2	10	158644	158653	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
448	NC_008537	TGT	2	6	158678	158683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_008537	TTC	2	6	158718	158723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_008537	TGG	2	6	158744	158749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.