MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022784	A	6	6	1087821	1087826	100 %	0 %	0 %	0 %	557626023
13502	NC_022784	GCA	2	6	1087936	1087941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626023
13503	NC_022784	CATG	2	8	1087966	1087973	25 %	25 %	25 %	25 %	557626023
13504	NC_022784	GCA	2	6	1088039	1088044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626023
13505	NC_022784	A	6	6	1088067	1088072	100 %	0 %	0 %	0 %	557626023
13506	NC_022784	TCC	2	6	1088073	1088078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557626023
13507	NC_022784	TGT	2	6	1088088	1088093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626023
13508	NC_022784	CAG	3	9	1088097	1088105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626023
13509	NC_022784	GAC	2	6	1088150	1088155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626023
13510	NC_022784	GAC	2	6	1088243	1088248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626023
13511	NC_022784	CAA	2	6	1088350	1088355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626023
13512	NC_022784	CAGAAA	2	12	1088397	1088408	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	557626023
13513	NC_022784	ATC	2	6	1088509	1088514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626023
13514	NC_022784	CCA	2	6	1088539	1088544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626023
13515	NC_022784	ATA	2	6	1088562	1088567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557626023
13516	NC_022784	TCA	2	6	1088570	1088575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626023
13517	NC_022784	TCTT	2	8	1088585	1088592	0 %	75 %	0 %	25 %	557626023
13518	NC_022784	TC	3	6	1088613	1088618	0 %	50 %	0 %	50 %	557626023
13519	NC_022784	GCA	2	6	1088699	1088704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626024
13520	NC_022784	GAA	2	6	1088705	1088710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626024
13521	NC_022784	AAAG	2	8	1088721	1088728	75 %	0 %	25 %	0 %	557626024
13522	NC_022784	CAG	2	6	1088730	1088735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626024
13523	NC_022784	GCA	2	6	1088736	1088741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626024
13524	NC_022784	GA	3	6	1088764	1088769	50 %	0 %	50 %	0 %	557626024
13525	NC_022784	ATTGG	2	10	1088789	1088798	20 %	40 %	40 %	0 %	557626024
13526	NC_022784	CG	3	6	1088880	1088885	0 %	0 %	50 %	50 %	557626024
13527	NC_022784	TCC	2	6	1088897	1088902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557626024
13528	NC_022784	CGC	2	6	1088926	1088931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626024
13529	NC_022784	CAA	2	6	1088991	1088996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626024
13530	NC_022784	C	6	6	1089125	1089130	0 %	0 %	0 %	100 %	557626025
13531	NC_022784	CAT	2	6	1089147	1089152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626025
13532	NC_022784	AGT	2	6	1089156	1089161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626025
13533	NC_022784	CCA	2	6	1089209	1089214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626025
13534	NC_022784	CTT	2	6	1089247	1089252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626025
13535	NC_022784	GCG	2	6	1089281	1089286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626025
13536	NC_022784	ATC	2	6	1089296	1089301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626025
13537	NC_022784	TTC	2	6	1089308	1089313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626025
13538	NC_022784	GCA	2	6	1089359	1089364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626025
13539	NC_022784	TCG	2	6	1089375	1089380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626025
13540	NC_022784	AGA	2	6	1089496	1089501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626025
13541	NC_022784	GCG	2	6	1089521	1089526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626025
13542	NC_022784	ATC	2	6	1089532	1089537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626025
13543	NC_022784	CTGTC	2	10	1089547	1089556	0 %	40 %	20 %	40 %	557626025
13544	NC_022784	ATG	2	6	1089632	1089637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626025
13545	NC_022784	CAA	2	6	1089702	1089707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626025
13546	NC_022784	C	7	7	1089798	1089804	0 %	0 %	0 %	100 %	557626025
13547	NC_022784	CCG	2	6	1089840	1089845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626025
13548	NC_022784	ATC	2	6	1089922	1089927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626025
13549	NC_022784	ACC	2	6	1089928	1089933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626025
13550	NC_022784	CAG	2	6	1089948	1089953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626025
13551	NC_022784	ACC	2	6	1090007	1090012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626025
13552	NC_022784	AC	3	6	1090033	1090038	50 %	0 %	0 %	50 %	557626025
13553	NC_022784	AGG	2	6	1090055	1090060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626025
13554	NC_022784	ACA	2	6	1090063	1090068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626025
13555	NC_022784	CG	3	6	1090136	1090141	0 %	0 %	50 %	50 %	557626025
13556	NC_022784	CGC	2	6	1090182	1090187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626025
13557	NC_022784	AC	3	6	1090199	1090204	50 %	0 %	0 %	50 %	557626025
13558	NC_022784	CCA	2	6	1090243	1090248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626025
13559	NC_022784	GA	3	6	1090268	1090273	50 %	0 %	50 %	0 %	557626025
13560	NC_022784	CAA	2	6	1092973	1092978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626026
13561	NC_022784	CAG	2	6	1093000	1093005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13562	NC_022784	CGC	2	6	1093047	1093052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626026
13563	NC_022784	ACA	2	6	1093131	1093136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626026
13564	NC_022784	TGC	2	6	1093156	1093161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13565	NC_022784	TGC	2	6	1093208	1093213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13566	NC_022784	TCCG	2	8	1093222	1093229	0 %	25 %	25 %	50 %	557626026
13567	NC_022784	CGG	2	6	1093254	1093259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626026
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13570	NC_022784	ACC	2	6	1093342	1093347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626026
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13572	NC_022784	CAGAAA	2	12	1093423	1093434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	557626026
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13574	NC_022784	CCA	2	6	1093565	1093570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626026
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13577	NC_022784	TCTT	2	8	1093611	1093618	0 %	75 %	0 %	25 %	557626026
13578	NC_022784	TC	3	6	1093639	1093644	0 %	50 %	0 %	50 %	557626026
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13581	NC_022784	AAAG	2	8	1093747	1093754	75 %	0 %	25 %	0 %	557626026
13582	NC_022784	CAG	2	6	1093756	1093761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13583	NC_022784	GCA	2	6	1093762	1093767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13584	NC_022784	GA	3	6	1093790	1093795	50 %	0 %	50 %	0 %	557626026
13585	NC_022784	GCA	2	6	1093837	1093842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626026
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13587	NC_022784	AGC	2	6	1094024	1094029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626026
13588	NC_022784	TG	3	6	1094056	1094061	0 %	50 %	50 %	0 %	557626026
13589	NC_022784	ACC	2	6	1094108	1094113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626026
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13591	NC_022784	CGAG	2	8	1094328	1094335	25 %	0 %	50 %	25 %	557626157
13592	NC_022784	CTT	2	6	1094355	1094360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626157
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13597	NC_022784	CAAA	2	8	1094766	1094773	75 %	0 %	0 %	25 %	557626027
13598	NC_022784	AAC	2	6	1094774	1094779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626027
13599	NC_022784	CTC	2	6	1094802	1094807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557626027
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13601	NC_022784	GTA	2	6	1094854	1094859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626027
13602	NC_022784	CTA	2	6	1094869	1094874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626027
13603	NC_022784	TTA	2	6	1094882	1094887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626027
13604	NC_022784	TGTT	2	8	1094954	1094961	0 %	75 %	25 %	0 %	557626027
13605	NC_022784	GCC	2	6	1095004	1095009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626027
13606	NC_022784	CTG	2	6	1095018	1095023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626027
13607	NC_022784	CGG	2	6	1095031	1095036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626027
13608	NC_022784	CA	3	6	1095061	1095066	50 %	0 %	0 %	50 %	557626027
13609	NC_022784	TGT	2	6	1095069	1095074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626027
13610	NC_022784	CA	3	6	1095131	1095136	50 %	0 %	0 %	50 %	557626027
13611	NC_022784	TTG	2	6	1095138	1095143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626027
13612	NC_022784	TAT	2	6	1096344	1096349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626158
13613	NC_022784	CTA	2	6	1096375	1096380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626158
13614	NC_022784	G	6	6	1096407	1096412	0 %	0 %	100 %	0 %	557626158
13615	NC_022784	TTA	2	6	1096483	1096488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626158
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13852	NC_022784	GCAC	2	8	1111055	1111062	25 %	0 %	25 %	50 %	557626043
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13882	NC_022784	AC	3	6	1112883	1112888	50 %	0 %	0 %	50 %	557626044
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13957	NC_022784	AGA	2	6	1118913	1118918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626047
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13963	NC_022784	A	6	6	1119145	1119150	100 %	0 %	0 %	0 %	557626047
13964	NC_022784	CT	3	6	1119206	1119211	0 %	50 %	0 %	50 %	557626047
13965	NC_022784	CGC	2	6	1119228	1119233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557626047
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13968	NC_022784	GCA	2	6	1119399	1119404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626047
13969	NC_022784	CT	3	6	1119420	1119425	0 %	50 %	0 %	50 %	557626047
13970	NC_022784	TGG	2	6	1119443	1119448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557626047
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13973	NC_022784	AGT	2	6	1119572	1119577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626047
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13975	NC_022784	G	6	6	1119943	1119948	0 %	0 %	100 %	0 %	557626048
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13993	NC_022784	AGCCT	2	10	1120707	1120716	20 %	20 %	20 %	40 %	557626048
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13995	NC_022784	TGC	2	6	1120747	1120752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626048
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13999	NC_022784	CCA	2	6	1120934	1120939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626048
14000	NC_022784	AGGA	2	8	1120974	1120981	50 %	0 %	50 %	0 %	557626048

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