MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 14495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022760	G	7	7	290	296	0 %	0 %	100 %	0 %	557237422
2	NC_022760	CAG	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
3	NC_022760	A	7	7	346	352	100 %	0 %	0 %	0 %	557237422
4	NC_022760	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237422
5	NC_022760	CGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
6	NC_022760	CAT	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237422
7	NC_022760	TG	3	6	619	624	0 %	50 %	50 %	0 %	557237422
8	NC_022760	T	6	6	704	709	0 %	100 %	0 %	0 %	557237422
9	NC_022760	TTTG	2	8	799	806	0 %	75 %	25 %	0 %	557237422
10	NC_022760	AGG	2	6	840	845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237422
11	NC_022760	TGA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237422
12	NC_022760	AAC	2	6	973	978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237422
13	NC_022760	GCA	2	6	989	994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
14	NC_022760	TG	3	6	1006	1011	0 %	50 %	50 %	0 %	557237422
15	NC_022760	GAC	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
16	NC_022760	CGG	2	6	1077	1082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237422
17	NC_022760	TTG	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237422
18	NC_022760	A	6	6	1107	1112	100 %	0 %	0 %	0 %	557237422
19	NC_022760	CGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
20	NC_022760	AG	3	6	1163	1168	50 %	0 %	50 %	0 %	557237422
21	NC_022760	GC	3	6	1245	1250	0 %	0 %	50 %	50 %	557237422
22	NC_022760	TTG	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237422
23	NC_022760	GAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
24	NC_022760	TGC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
25	NC_022760	AGA	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
26	NC_022760	AGT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237422
27	NC_022760	TGC	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
28	NC_022760	CTA	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237422
29	NC_022760	AG	3	6	1519	1524	50 %	0 %	50 %	0 %	557237422
30	NC_022760	TTGCAA	2	12	1531	1542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557237422
31	NC_022760	GCT	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237422
32	NC_022760	TAAAA	2	10	1655	1664	80 %	20 %	0 %	0 %	557237422
33	NC_022760	ATA	2	6	1710	1715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237422
34	NC_022760	AGC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
35	NC_022760	GCA	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237422
36	NC_022760	GAA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237422
37	NC_022760	T	6	6	1938	1943	0 %	100 %	0 %	0 %	557237422
38	NC_022760	TGAC	2	8	2011	2018	25 %	25 %	25 %	25 %	557237422
39	NC_022760	TGC	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
40	NC_022760	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237423
41	NC_022760	GCC	2	6	2276	2281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237423
42	NC_022760	GCT	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
43	NC_022760	TAG	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237423
44	NC_022760	ACA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237423
45	NC_022760	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237423
46	NC_022760	TAT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237423
47	NC_022760	TGG	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237423
48	NC_022760	TGC	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237423
49	NC_022760	CAC	2	6	2617	2622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237423
50	NC_022760	CG	3	6	2630	2635	0 %	0 %	50 %	50 %	557237423
51	NC_022760	CCG	2	6	2733	2738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237424
52	NC_022760	AC	3	6	2773	2778	50 %	0 %	0 %	50 %	557237424
53	NC_022760	GCCA	2	8	2783	2790	25 %	0 %	25 %	50 %	557237424
54	NC_022760	ACA	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237424
55	NC_022760	TTG	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237424
56	NC_022760	AAT	2	6	2936	2941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237424
57	NC_022760	TCT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237424
58	NC_022760	CA	3	6	2966	2971	50 %	0 %	0 %	50 %	557237424
59	NC_022760	TGC	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237424
60	NC_022760	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	557237424
61	NC_022760	TTG	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237424
62	NC_022760	AGG	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237424
63	NC_022760	CTG	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
64	NC_022760	TCG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
65	NC_022760	CTC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237425
66	NC_022760	CAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237425
67	NC_022760	GCG	2	6	3550	3555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237425
68	NC_022760	TTG	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237425
69	NC_022760	GGTG	2	8	3678	3685	0 %	25 %	75 %	0 %	557237425
70	NC_022760	GC	3	6	3692	3697	0 %	0 %	50 %	50 %	557237425
71	NC_022760	G	6	6	3796	3801	0 %	0 %	100 %	0 %	557237425
72	NC_022760	CTC	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237425
73	NC_022760	ATG	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237425
74	NC_022760	TGTTGC	2	12	3897	3908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	557237425
75	NC_022760	CTG	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
76	NC_022760	TG	3	6	3944	3949	0 %	50 %	50 %	0 %	557237425
77	NC_022760	TGC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
78	NC_022760	GCT	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237425
79	NC_022760	CTT	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237425
80	NC_022760	TATGGG	2	12	4032	4043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	557237425
81	NC_022760	CCAAA	2	10	4116	4125	60 %	0 %	0 %	40 %	557237425
82	NC_022760	T	6	6	4160	4165	0 %	100 %	0 %	0 %	557237425
83	NC_022760	GAG	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237425
84	NC_022760	TG	3	6	4256	4261	0 %	50 %	50 %	0 %	557237425
85	NC_022760	TCA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237425
86	NC_022760	G	6	6	4393	4398	0 %	0 %	100 %	0 %	557237425
87	NC_022760	CG	3	6	4606	4611	0 %	0 %	50 %	50 %	557237426
88	NC_022760	GTC	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237426
89	NC_022760	AAGA	3	12	4715	4726	75 %	0 %	25 %	0 %	557237426
90	NC_022760	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237426
91	NC_022760	T	6	6	4890	4895	0 %	100 %	0 %	0 %	557238156
92	NC_022760	AGG	2	6	4917	4922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557238156
93	NC_022760	GCG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557238156
94	NC_022760	GAA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557238156
95	NC_022760	A	7	7	5033	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	557238156
96	NC_022760	GCAA	2	8	5100	5107	50 %	0 %	25 %	25 %	557238156
97	NC_022760	A	6	6	5192	5197	100 %	0 %	0 %	0 %	557238156
98	NC_022760	TAAAC	2	10	5470	5479	60 %	20 %	0 %	20 %	557237427
99	NC_022760	ATG	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237427
100	NC_022760	ACT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
101	NC_022760	TTC	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237427
102	NC_022760	TTC	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237427
103	NC_022760	CTTGTG	2	12	5665	5676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	557237427
104	NC_022760	TCA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
105	NC_022760	CTG	2	6	5740	5745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
106	NC_022760	TG	3	6	5778	5783	0 %	50 %	50 %	0 %	557237427
107	NC_022760	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237427
108	NC_022760	GGCT	3	12	5796	5807	0 %	25 %	50 %	25 %	557237427
109	NC_022760	TGT	2	6	5817	5822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237427
110	NC_022760	CAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
111	NC_022760	TCA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
112	NC_022760	TCA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
113	NC_022760	GCT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
114	NC_022760	CCA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237427
115	NC_022760	AAC	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
116	NC_022760	CAA	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
117	NC_022760	CAA	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237427
118	NC_022760	G	6	6	6129	6134	0 %	0 %	100 %	0 %	557237427
119	NC_022760	T	6	6	6157	6162	0 %	100 %	0 %	0 %	557237427
120	NC_022760	TCA	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237427
121	NC_022760	CGT	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237427
122	NC_022760	TCG	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237428
123	NC_022760	TCA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237428
124	NC_022760	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	557237428
125	NC_022760	TA	4	8	6684	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	557237428
126	NC_022760	TAC	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237428
127	NC_022760	CGT	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237428
128	NC_022760	T	7	7	8707	8713	0 %	100 %	0 %	0 %	557237429
129	NC_022760	TAT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237429
130	NC_022760	T	6	6	8812	8817	0 %	100 %	0 %	0 %	557237429
131	NC_022760	AC	3	6	8900	8905	50 %	0 %	0 %	50 %	557237429
132	NC_022760	AG	3	6	8924	8929	50 %	0 %	50 %	0 %	557237429
133	NC_022760	CGC	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237429
134	NC_022760	AT	3	6	8938	8943	50 %	50 %	0 %	0 %	557237429
135	NC_022760	TGT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237429
136	NC_022760	T	6	6	9025	9030	0 %	100 %	0 %	0 %	557237429
137	NC_022760	TCA	5	15	9042	9056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237429
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141	NC_022760	AAT	2	6	9169	9174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237429
142	NC_022760	TGC	2	6	9228	9233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237429
143	NC_022760	TCA	2	6	9240	9245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237429
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145	NC_022760	GCC	2	6	9285	9290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237429
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149	NC_022760	CCCA	2	8	9597	9604	25 %	0 %	0 %	75 %	557237429
150	NC_022760	ACC	2	6	9644	9649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237429
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152	NC_022760	TA	3	6	9739	9744	50 %	50 %	0 %	0 %	557237430
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156	NC_022760	CAG	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237430
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159	NC_022760	CTTC	2	8	10198	10205	0 %	50 %	0 %	50 %	557237430
160	NC_022760	GGGTC	2	10	10214	10223	0 %	20 %	60 %	20 %	557237430
161	NC_022760	CCCGG	2	10	10247	10256	0 %	0 %	40 %	60 %	557237430
162	NC_022760	C	6	6	10268	10273	0 %	0 %	0 %	100 %	557237430
163	NC_022760	TC	3	6	10294	10299	0 %	50 %	0 %	50 %	557237430
164	NC_022760	CGA	3	9	10394	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237431
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166	NC_022760	GT	3	6	10475	10480	0 %	50 %	50 %	0 %	557237431
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262	NC_022760	CTT	2	6	21814	21819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237434
263	NC_022760	GTTC	2	8	21835	21842	0 %	50 %	25 %	25 %	557237434
264	NC_022760	CCT	2	6	21890	21895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237434
265	NC_022760	TGC	2	6	21936	21941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237434
266	NC_022760	TTGG	2	8	21944	21951	0 %	50 %	50 %	0 %	557237434
267	NC_022760	CAT	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237434
268	NC_022760	CTG	2	6	22043	22048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237434
269	NC_022760	TGA	2	6	22153	22158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237434
270	NC_022760	GC	3	6	22162	22167	0 %	0 %	50 %	50 %	557237434
271	NC_022760	GGTG	2	8	22204	22211	0 %	25 %	75 %	0 %	557237434
272	NC_022760	GCC	2	6	22247	22252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237434
273	NC_022760	TG	3	6	22332	22337	0 %	50 %	50 %	0 %	557237434
274	NC_022760	GAT	2	6	22387	22392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237434
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276	NC_022760	GCG	2	6	22583	22588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237434
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278	NC_022760	GCC	2	6	22685	22690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237434
279	NC_022760	CAG	2	6	22783	22788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237434
280	NC_022760	GCC	2	6	22867	22872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237434
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283	NC_022760	TGG	2	6	23022	23027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237434
284	NC_022760	CT	3	6	23073	23078	0 %	50 %	0 %	50 %	557237434
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286	NC_022760	GCG	2	6	23156	23161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557237434
287	NC_022760	TTA	2	6	23165	23170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237434
288	NC_022760	AAC	2	6	23180	23185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237434
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294	NC_022760	AC	3	6	23519	23524	50 %	0 %	0 %	50 %	557237435
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383	NC_022760	A	6	6	29887	29892	100 %	0 %	0 %	0 %	557237441
384	NC_022760	TGGC	2	8	29903	29910	0 %	25 %	50 %	25 %	557237441
385	NC_022760	GGA	2	6	30019	30024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237441
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389	NC_022760	TCGT	2	8	30312	30319	0 %	50 %	25 %	25 %	557237441
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391	NC_022760	CAT	2	6	30387	30392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237441
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393	NC_022760	GGGT	2	8	30441	30448	0 %	25 %	75 %	0 %	557237441
394	NC_022760	CA	3	6	30545	30550	50 %	0 %	0 %	50 %	557237441
395	NC_022760	ATT	2	6	30586	30591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237441
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401	NC_022760	A	6	6	30897	30902	100 %	0 %	0 %	0 %	557237441
402	NC_022760	TAC	2	6	30996	31001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237441
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435	NC_022760	AC	3	6	33907	33912	50 %	0 %	0 %	50 %	557237444
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465	NC_022760	GTA	2	6	40098	40103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237447
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497	NC_022760	ATA	2	6	41995	42000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237449
498	NC_022760	CG	3	6	42041	42046	0 %	0 %	50 %	50 %	557237449
499	NC_022760	TGC	2	6	42226	42231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237450
500	NC_022760	GCA	2	6	42240	42245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237450

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