MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_022521	GTA	2	6	1376877	1376882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456064
28003	NC_022521	GTA	2	6	1376889	1376894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456064
28004	NC_022521	AGG	2	6	1376950	1376955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456064
28005	NC_022521	GC	3	6	1376990	1376995	0 %	0 %	50 %	50 %	549456064
28006	NC_022521	CCTC	2	8	1377145	1377152	0 %	25 %	0 %	75 %	549456065
28007	NC_022521	TAG	2	6	1377244	1377249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456065
28008	NC_022521	TTC	2	6	1377304	1377309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456065
28009	NC_022521	CAG	2	6	1377353	1377358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456065
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28011	NC_022521	GCT	2	6	1377464	1377469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456065
28012	NC_022521	AGG	2	6	1377541	1377546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456065
28013	NC_022521	TC	3	6	1377553	1377558	0 %	50 %	0 %	50 %	549456065
28014	NC_022521	GCC	2	6	1377573	1377578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456065
28015	NC_022521	GCCC	2	8	1377680	1377687	0 %	0 %	25 %	75 %	549456065
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28018	NC_022521	CT	3	6	1377819	1377824	0 %	50 %	0 %	50 %	549456065
28019	NC_022521	CTC	2	6	1377919	1377924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456065
28020	NC_022521	CTC	2	6	1377959	1377964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456065
28021	NC_022521	GAT	2	6	1377965	1377970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456065
28022	NC_022521	GCTC	2	8	1378047	1378054	0 %	25 %	25 %	50 %	549456065
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28024	NC_022521	CT	4	8	1378131	1378138	0 %	50 %	0 %	50 %	549456065
28025	NC_022521	AGCC	2	8	1378151	1378158	25 %	0 %	25 %	50 %	549456065
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28032	NC_022521	CGG	2	6	1378455	1378460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456065
28033	NC_022521	CTG	2	6	1378551	1378556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456065
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28035	NC_022521	ATC	2	6	1378727	1378732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456065
28036	NC_022521	TA	3	6	1378768	1378773	50 %	50 %	0 %	0 %	549456065
28037	NC_022521	CT	3	6	1378793	1378798	0 %	50 %	0 %	50 %	549456065
28038	NC_022521	CA	3	6	1378821	1378826	50 %	0 %	0 %	50 %	549456065
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28040	NC_022521	C	6	6	1378849	1378854	0 %	0 %	0 %	100 %	549456065
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28044	NC_022521	CTG	2	6	1379923	1379928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456066
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28051	NC_022521	AG	3	6	1380256	1380261	50 %	0 %	50 %	0 %	549456066
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28053	NC_022521	ACCT	2	8	1380395	1380402	25 %	25 %	0 %	50 %	549456066
28054	NC_022521	ATT	2	6	1380442	1380447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456066
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28069	NC_022521	TGG	2	6	1381207	1381212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456067
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28071	NC_022521	TGA	2	6	1381265	1381270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
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28090	NC_022521	CTC	2	6	1382160	1382165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456067
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28100	NC_022521	G	6	6	1382639	1382644	0 %	0 %	100 %	0 %	549456067
28101	NC_022521	AC	3	6	1382697	1382702	50 %	0 %	0 %	50 %	549456067
28102	NC_022521	GTA	2	6	1382707	1382712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456067
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28116	NC_022521	AGC	2	6	1383290	1383295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456067
28117	NC_022521	TGTCT	2	10	1383419	1383428	0 %	60 %	20 %	20 %	549456067
28118	NC_022521	AG	3	6	1383488	1383493	50 %	0 %	50 %	0 %	549456067
28119	NC_022521	GATA	2	8	1383623	1383630	50 %	25 %	25 %	0 %	549456067
28120	NC_022521	TA	3	6	1383661	1383666	50 %	50 %	0 %	0 %	549456067
28121	NC_022521	TAC	2	6	1383726	1383731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456067
28122	NC_022521	AC	3	6	1383748	1383753	50 %	0 %	0 %	50 %	549456067
28123	NC_022521	GAG	2	6	1383762	1383767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456067
28124	NC_022521	CTAGCC	2	12	1383771	1383782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549456067
28125	NC_022521	GGC	2	6	1383791	1383796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456067
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28127	NC_022521	GCT	2	6	1383918	1383923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456067
28128	NC_022521	CTT	2	6	1384017	1384022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456067
28129	NC_022521	ATT	2	6	1384213	1384218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456068
28130	NC_022521	GGA	2	6	1384220	1384225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456068
28131	NC_022521	CAG	2	6	1384296	1384301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28132	NC_022521	GAC	2	6	1384319	1384324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28133	NC_022521	GCT	2	6	1384384	1384389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28134	NC_022521	CGC	2	6	1384405	1384410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456068
28135	NC_022521	TAC	2	6	1384465	1384470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456068
28136	NC_022521	GAT	2	6	1384511	1384516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456068
28137	NC_022521	TGC	2	6	1384531	1384536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28138	NC_022521	TGT	2	6	1384555	1384560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456068
28139	NC_022521	AAG	2	6	1384574	1384579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549456068
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28142	NC_022521	TGT	2	6	1384666	1384671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456068
28143	NC_022521	CGT	2	6	1384840	1384845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28144	NC_022521	TAC	2	6	1384865	1384870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456068
28145	NC_022521	TA	3	6	1384874	1384879	50 %	50 %	0 %	0 %	549456068
28146	NC_022521	TTC	2	6	1384895	1384900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456068
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28149	NC_022521	CCTAA	2	10	1384949	1384958	40 %	20 %	0 %	40 %	549456068
28150	NC_022521	GA	3	6	1384997	1385002	50 %	0 %	50 %	0 %	549456068
28151	NC_022521	GCA	2	6	1385046	1385051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28152	NC_022521	CGC	2	6	1385151	1385156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456068
28153	NC_022521	GAC	2	6	1385159	1385164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456068
28154	NC_022521	TAT	2	6	1385257	1385262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456068
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28163	NC_022521	CATCTA	2	12	1385598	1385609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456068
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28182	NC_022521	AGT	2	6	1386415	1386420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456068
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28184	NC_022521	TGT	2	6	1386900	1386905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456069
28185	NC_022521	TG	3	6	1386979	1386984	0 %	50 %	50 %	0 %	549456069
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28193	NC_022521	GA	4	8	1387850	1387857	50 %	0 %	50 %	0 %	549456070
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28196	NC_022521	AGG	2	6	1387999	1388004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456070
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28198	NC_022521	ACTAT	2	10	1388239	1388248	40 %	40 %	0 %	20 %	549456070
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28200	NC_022521	ATA	2	6	1388362	1388367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549456070
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28202	NC_022521	TGG	2	6	1388452	1388457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456070
28203	NC_022521	CTG	2	6	1388460	1388465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456070
28204	NC_022521	GCCA	2	8	1388472	1388479	25 %	0 %	25 %	50 %	549456070
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28206	NC_022521	GGA	2	6	1388493	1388498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456070
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28211	NC_022521	AGC	2	6	1388666	1388671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456071
28212	NC_022521	TAG	2	6	1388689	1388694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456071
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28214	NC_022521	AGT	2	6	1388879	1388884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456071
28215	NC_022521	CAG	2	6	1388899	1388904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456071
28216	NC_022521	TCGA	2	8	1388927	1388934	25 %	25 %	25 %	25 %	549456071
28217	NC_022521	CGC	2	6	1388941	1388946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456071
28218	NC_022521	CCG	2	6	1389015	1389020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456071
28219	NC_022521	GAG	2	6	1389059	1389064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456071
28220	NC_022521	GCG	2	6	1389068	1389073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456071
28221	NC_022521	TGG	2	6	1389117	1389122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456071
28222	NC_022521	TGT	2	6	1389202	1389207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549456071
28223	NC_022521	CTGC	2	8	1389213	1389220	0 %	25 %	25 %	50 %	549456071
28224	NC_022521	AGCT	2	8	1389235	1389242	25 %	25 %	25 %	25 %	549456071
28225	NC_022521	CCCT	2	8	1389271	1389278	0 %	25 %	0 %	75 %	549456071
28226	NC_022521	CCA	2	6	1389411	1389416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456071
28227	NC_022521	GGC	2	6	1389445	1389450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456071
28228	NC_022521	GTA	2	6	1389661	1389666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456071
28229	NC_022521	CGTCC	2	10	1389727	1389736	0 %	20 %	20 %	60 %	549456071
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28231	NC_022521	CTA	2	6	1389921	1389926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456071
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28348	NC_022521	AG	3	6	1397177	1397182	50 %	0 %	50 %	0 %	549456077
28349	NC_022521	CCT	2	6	1397184	1397189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456077
28350	NC_022521	AGGA	2	8	1397248	1397255	50 %	0 %	50 %	0 %	549456077
28351	NC_022521	GAT	2	6	1397282	1397287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456077
28352	NC_022521	CCT	2	6	1397293	1397298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456078
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28464	NC_022521	TAT	2	6	1402596	1402601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456082
28465	NC_022521	CCT	2	6	1402638	1402643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456082
28466	NC_022521	ACT	2	6	1402675	1402680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456082
28467	NC_022521	GTG	2	6	1402703	1402708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456082
28468	NC_022521	CTGC	2	8	1402777	1402784	0 %	25 %	25 %	50 %	549456082
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28470	NC_022521	CTC	2	6	1402858	1402863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456082
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28472	NC_022521	CT	4	8	1402933	1402940	0 %	50 %	0 %	50 %	549456082
28473	NC_022521	TG	3	6	1402981	1402986	0 %	50 %	50 %	0 %	549456082
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28479	NC_022521	CT	3	6	1403412	1403417	0 %	50 %	0 %	50 %	549456083
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28484	NC_022521	CTC	2	6	1403502	1403507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456083
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28491	NC_022521	CGA	2	6	1403666	1403671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456083
28492	NC_022521	AG	3	6	1403672	1403677	50 %	0 %	50 %	0 %	549456083
28493	NC_022521	GTA	2	6	1403717	1403722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456083
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