MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022521	CCT	3	9	921545	921553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19003	NC_022521	CTC	2	6	921650	921655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19004	NC_022521	CTA	2	6	921666	921671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455611
19005	NC_022521	TAG	2	6	921761	921766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455611
19006	NC_022521	AGG	2	6	921792	921797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455611
19007	NC_022521	CCCTAA	2	12	921811	921822	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549455611
19008	NC_022521	CTCC	2	8	921827	921834	0 %	25 %	0 %	75 %	549455611
19009	NC_022521	TCC	2	6	921837	921842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19010	NC_022521	CCGGC	2	10	921845	921854	0 %	0 %	40 %	60 %	549455611
19011	NC_022521	CAGC	2	8	921871	921878	25 %	0 %	25 %	50 %	549455611
19012	NC_022521	ACC	2	6	921898	921903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455611
19013	NC_022521	TCC	2	6	921915	921920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19014	NC_022521	CCA	2	6	922042	922047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455611
19015	NC_022521	CGGG	2	8	922145	922152	0 %	0 %	75 %	25 %	549455611
19016	NC_022521	CT	3	6	922242	922247	0 %	50 %	0 %	50 %	549455611
19017	NC_022521	GGA	2	6	922252	922257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455611
19018	NC_022521	C	6	6	922285	922290	0 %	0 %	0 %	100 %	549455611
19019	NC_022521	CTC	2	6	922341	922346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19020	NC_022521	CTC	2	6	922397	922402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
19021	NC_022521	CTT	2	6	922448	922453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455611
19022	NC_022521	TCT	2	6	922473	922478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455611
19023	NC_022521	CTC	2	6	922485	922490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455611
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19025	NC_022521	C	6	6	922510	922515	0 %	0 %	0 %	100 %	549455611
19026	NC_022521	AGCCTC	2	12	922620	922631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549455611
19027	NC_022521	CT	3	6	922652	922657	0 %	50 %	0 %	50 %	549455611
19028	NC_022521	GCC	2	6	922716	922721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455611
19029	NC_022521	CTG	2	6	922812	922817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455612
19030	NC_022521	TCC	2	6	922836	922841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455612
19031	NC_022521	CCT	2	6	922879	922884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455612
19032	NC_022521	GAG	2	6	923110	923115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455612
19033	NC_022521	GCG	2	6	923122	923127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455612
19034	NC_022521	CCG	2	6	923155	923160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455612
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19036	NC_022521	TGT	2	6	923293	923298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455612
19037	NC_022521	CGT	2	6	923353	923358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455612
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19041	NC_022521	CTC	2	6	923408	923413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455612
19042	NC_022521	GCCA	2	8	923513	923520	25 %	0 %	25 %	50 %	549455612
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19045	NC_022521	TGG	2	6	923634	923639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549455612
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19050	NC_022521	AG	3	6	923774	923779	50 %	0 %	50 %	0 %	549455612
19051	NC_022521	GGCT	2	8	923792	923799	0 %	25 %	50 %	25 %	549455612
19052	NC_022521	CCAGCT	2	12	923872	923883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549455612
19053	NC_022521	AT	3	6	923886	923891	50 %	50 %	0 %	0 %	549455612
19054	NC_022521	GTC	2	6	923958	923963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455612
19055	NC_022521	CCT	2	6	923996	924001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455612
19056	NC_022521	GCG	2	6	924021	924026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455612
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19058	NC_022521	GAC	2	6	924110	924115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455612
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19060	NC_022521	CAT	2	6	924188	924193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455612
19061	NC_022521	CGA	3	9	924220	924228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455612
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19063	NC_022521	CCT	2	6	924245	924250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455612
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19121	NC_022521	GAA	2	6	927396	927401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549455615
19122	NC_022521	CTA	2	6	927410	927415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455615
19123	NC_022521	CGAAGC	2	12	927440	927451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455615
19124	NC_022521	TCC	2	6	927511	927516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455615
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19126	NC_022521	CTC	2	6	927594	927599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455615
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19128	NC_022521	C	6	6	927647	927652	0 %	0 %	0 %	100 %	549455615
19129	NC_022521	CCCT	2	8	927775	927782	0 %	25 %	0 %	75 %	549455615
19130	NC_022521	AGC	2	6	927796	927801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455615
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19132	NC_022521	GGCGAG	2	12	928218	928229	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549455616
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19134	NC_022521	TG	3	6	928322	928327	0 %	50 %	50 %	0 %	549455616
19135	NC_022521	ATG	2	6	928333	928338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455616
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19137	NC_022521	GGAG	2	8	928354	928361	25 %	0 %	75 %	0 %	549455616
19138	NC_022521	C	6	6	928394	928399	0 %	0 %	0 %	100 %	549455616
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19142	NC_022521	AGG	2	6	928488	928493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455616
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19145	NC_022521	AGG	2	6	928560	928565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455616
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19151	NC_022521	AG	3	6	928805	928810	50 %	0 %	50 %	0 %	549455616
19152	NC_022521	TAGGGT	2	12	928826	928837	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549455616
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19154	NC_022521	TTG	2	6	928963	928968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455616
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19235	NC_022521	GGC	2	6	931703	931708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455618
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19237	NC_022521	C	6	6	931884	931889	0 %	0 %	0 %	100 %	549455618
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19242	NC_022521	GA	3	6	932412	932417	50 %	0 %	50 %	0 %	549455619
19243	NC_022521	GAG	2	6	932431	932436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455619
19244	NC_022521	CCT	2	6	932449	932454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455619
19245	NC_022521	TGTGG	2	10	932508	932517	0 %	40 %	60 %	0 %	549455619
19246	NC_022521	AGGG	2	8	932519	932526	25 %	0 %	75 %	0 %	549455619
19247	NC_022521	CCGTCT	2	12	932591	932602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549455619
19248	NC_022521	G	6	6	932631	932636	0 %	0 %	100 %	0 %	549455619
19249	NC_022521	G	6	6	932673	932678	0 %	0 %	100 %	0 %	549455619
19250	NC_022521	C	6	6	932699	932704	0 %	0 %	0 %	100 %	549455619
19251	NC_022521	CAA	2	6	932739	932744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455619
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19253	NC_022521	ATG	2	6	932776	932781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455619
19254	NC_022521	CGC	2	6	932784	932789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455619
19255	NC_022521	GCG	2	6	932840	932845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455619
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19257	NC_022521	CGT	2	6	933000	933005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455619
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19279	NC_022521	G	6	6	934828	934833	0 %	0 %	100 %	0 %	549455620
19280	NC_022521	AT	3	6	934836	934841	50 %	50 %	0 %	0 %	549455620
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19301	NC_022521	CCT	2	6	935987	935992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455623
19302	NC_022521	GCTG	2	8	936008	936015	0 %	25 %	50 %	25 %	549455623
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19320	NC_022521	CTC	2	6	936789	936794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455624
19321	NC_022521	TCC	2	6	936801	936806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455624
19322	NC_022521	CCT	2	6	936854	936859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455624
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19360	NC_022521	CT	3	6	938677	938682	0 %	50 %	0 %	50 %	549455626
19361	NC_022521	GCT	2	6	938732	938737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455626
19362	NC_022521	CTC	2	6	938931	938936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455627
19363	NC_022521	CCG	2	6	939097	939102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455627
19364	NC_022521	CGC	2	6	939182	939187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549455627
19365	NC_022521	CACC	2	8	939227	939234	25 %	0 %	0 %	75 %	549455627
19366	NC_022521	TCC	2	6	939238	939243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455627
19367	NC_022521	TGTT	2	8	939257	939264	0 %	75 %	25 %	0 %	549455627
19368	NC_022521	AGGT	2	8	939271	939278	25 %	25 %	50 %	0 %	549455627
19369	NC_022521	CTA	2	6	939290	939295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455627
19370	NC_022521	TA	3	6	939321	939326	50 %	50 %	0 %	0 %	549455627
19371	NC_022521	TAACA	2	10	939330	939339	60 %	20 %	0 %	20 %	549455627
19372	NC_022521	GTA	2	6	939554	939559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455628
19373	NC_022521	TGCTCA	2	12	939587	939598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549455628
19374	NC_022521	GTA	3	9	939623	939631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455628
19375	NC_022521	TGCC	2	8	939650	939657	0 %	25 %	25 %	50 %	549455628
19376	NC_022521	GAC	2	6	939708	939713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455628
19377	NC_022521	CG	3	6	939758	939763	0 %	0 %	50 %	50 %	549455628
19378	NC_022521	CGT	2	6	939860	939865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455628
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19381	NC_022521	AGGA	2	8	939939	939946	50 %	0 %	50 %	0 %	549455628
19382	NC_022521	TCG	2	6	939961	939966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455628
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19385	NC_022521	CTC	2	6	940071	940076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455628
19386	NC_022521	AG	3	6	940089	940094	50 %	0 %	50 %	0 %	549455628
19387	NC_022521	AGG	2	6	940126	940131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455628
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19390	NC_022521	GGC	2	6	940371	940376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549455628
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19392	NC_022521	CCA	2	6	940415	940420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455628
19393	NC_022521	AAC	2	6	940470	940475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549455628
19394	NC_022521	CCTAT	2	10	940504	940513	20 %	40 %	0 %	40 %	549455628
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19396	NC_022521	TGGC	2	8	940640	940647	0 %	25 %	50 %	25 %	549455628
19397	NC_022521	CCA	2	6	940940	940945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549455628
19398	NC_022521	TCT	2	6	940964	940969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549455628
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19400	NC_022521	GGGA	2	8	941065	941072	25 %	0 %	75 %	0 %	549455628
19401	NC_022521	GAG	2	6	941136	941141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455628
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19406	NC_022521	TGT	2	6	941226	941231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549455628
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19420	NC_022521	CCAG	2	8	941905	941912	25 %	0 %	25 %	50 %	549455629
19421	NC_022521	TAT	2	6	941930	941935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549455629
19422	NC_022521	TGC	2	6	942020	942025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549455629
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19431	NC_022521	CCT	2	6	942458	942463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455629
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19455	NC_022521	C	6	6	943436	943441	0 %	0 %	0 %	100 %	549455630
19456	NC_022521	GAC	2	6	943443	943448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455630
19457	NC_022521	TAGGG	2	10	943472	943481	20 %	20 %	60 %	0 %	549455630
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19461	NC_022521	C	6	6	943716	943721	0 %	0 %	0 %	100 %	549455630
19462	NC_022521	CTCGC	2	10	943762	943771	0 %	20 %	20 %	60 %	549455630
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19467	NC_022521	CTC	2	6	944110	944115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455630
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19471	NC_022521	GAGG	2	8	944465	944472	25 %	0 %	75 %	0 %	549455631
19472	NC_022521	TGA	2	6	944477	944482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455631
19473	NC_022521	GT	3	6	944506	944511	0 %	50 %	50 %	0 %	549455631
19474	NC_022521	G	6	6	944515	944520	0 %	0 %	100 %	0 %	549455631
19475	NC_022521	CAT	2	6	944574	944579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549455632
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19477	NC_022521	TCC	3	9	944707	944715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455632
19478	NC_022521	GAG	2	6	944813	944818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549455632
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19480	NC_022521	GTA	2	6	944869	944874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549455632
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19482	NC_022521	CCT	2	6	944980	944985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455632
19483	NC_022521	CCT	2	6	945076	945081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455632
19484	NC_022521	CTC	2	6	945087	945092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455632
19485	NC_022521	G	6	6	945097	945102	0 %	0 %	100 %	0 %	549455632
19486	NC_022521	AGCC	2	8	945106	945113	25 %	0 %	25 %	50 %	549455632
19487	NC_022521	AGC	2	6	945144	945149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549455632
19488	NC_022521	CCT	2	6	945154	945159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549455632
19489	NC_022521	AGCC	2	8	945163	945170	25 %	0 %	25 %	50 %	549455632
19490	NC_022521	GA	3	6	945197	945202	50 %	0 %	50 %	0 %	549455632
19491	NC_022521	TACC	2	8	945219	945226	25 %	25 %	0 %	50 %	549455632
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