MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei RB

Total Repeats: 270241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022116	CGG	2	6	614606	614611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457271
16002	NC_022116	GCA	2	6	614633	614638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457271
16003	NC_022116	CGGC	2	8	614662	614669	0 %	0 %	50 %	50 %	532457271
16004	NC_022116	CGAC	2	8	614690	614697	25 %	0 %	25 %	50 %	532457271
16005	NC_022116	GCCA	2	8	614734	614741	25 %	0 %	25 %	50 %	532457271
16006	NC_022116	CGG	2	6	614775	614780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457271
16007	NC_022116	AGC	2	6	614794	614799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457271
16008	NC_022116	CGG	2	6	614802	614807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457271
16009	NC_022116	GCCC	2	8	614940	614947	0 %	0 %	25 %	75 %	532457271
16010	NC_022116	CTC	2	6	614970	614975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532457271
16011	NC_022116	CAGC	2	8	614979	614986	25 %	0 %	25 %	50 %	532457271
16012	NC_022116	AGC	2	6	615052	615057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457271
16013	NC_022116	GC	3	6	615083	615088	0 %	0 %	50 %	50 %	532457271
16014	NC_022116	CCGCGG	2	12	615116	615127	0 %	0 %	50 %	50 %	532457271
16015	NC_022116	CGT	2	6	615135	615140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457271
16016	NC_022116	CGC	2	6	615194	615199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457271
16017	NC_022116	GCG	2	6	615224	615229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457271
16018	NC_022116	CCCA	2	8	615244	615251	25 %	0 %	0 %	75 %	532457271
16019	NC_022116	TCC	2	6	615271	615276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532457271
16020	NC_022116	CGG	3	9	615299	615307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457271
16021	NC_022116	CCG	2	6	615362	615367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457271
16022	NC_022116	G	6	6	615371	615376	0 %	0 %	100 %	0 %	532457271
16023	NC_022116	GTC	2	6	615379	615384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457271
16024	NC_022116	AGCGAC	2	12	615701	615712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457272
16025	NC_022116	GCG	3	9	615717	615725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457272
16026	NC_022116	CCCGT	3	15	615763	615777	0 %	20 %	20 %	60 %	532457272
16027	NC_022116	CGG	2	6	615819	615824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457272
16028	NC_022116	GAC	2	6	615845	615850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457272
16029	NC_022116	CCGG	2	8	615860	615867	0 %	0 %	50 %	50 %	532457272
16030	NC_022116	GAA	2	6	615934	615939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532457272
16031	NC_022116	CG	3	6	615952	615957	0 %	0 %	50 %	50 %	532457272
16032	NC_022116	GTG	2	6	616058	616063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532457272
16033	NC_022116	CAG	2	6	616225	616230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16034	NC_022116	CGA	2	6	616256	616261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16035	NC_022116	GAG	2	6	616287	616292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532457273
16036	NC_022116	CGA	2	6	616334	616339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
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16040	NC_022116	CGA	2	6	616409	616414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16041	NC_022116	CGA	2	6	616424	616429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16042	NC_022116	CGC	2	6	616439	616444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457273
16043	NC_022116	GAC	2	6	616446	616451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
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16047	NC_022116	TGC	2	6	616669	616674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457273
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16049	NC_022116	GTGCG	2	10	616720	616729	0 %	20 %	60 %	20 %	532457273
16050	NC_022116	TCG	2	6	616753	616758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16051	NC_022116	CGC	2	6	616777	616782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457273
16052	NC_022116	ACCGCG	2	12	616863	616874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532457273
16053	NC_022116	CGGTCA	2	12	616924	616935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16054	NC_022116	CGA	2	6	616963	616968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457273
16055	NC_022116	AAG	4	12	617156	617167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532457274
16056	NC_022116	GCG	2	6	617171	617176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457274
16057	NC_022116	ATC	2	6	617177	617182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532457274
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16059	NC_022116	CAT	2	6	617257	617262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532457274
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16061	NC_022116	CGT	2	6	617311	617316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457274
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16066	NC_022116	GTC	2	6	617570	617575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457274
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16069	NC_022116	CCGC	2	8	617988	617995	0 %	0 %	25 %	75 %	532457275
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16072	NC_022116	TGGC	2	8	618091	618098	0 %	25 %	50 %	25 %	532457275
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16086	NC_022116	ACG	2	6	618775	618780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457277
16087	NC_022116	CGA	2	6	618830	618835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457277
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16099	NC_022116	GGC	3	9	619217	619225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457277
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16109	NC_022116	CGT	2	6	619675	619680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457276
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16116	NC_022116	CAGC	2	8	619868	619875	25 %	0 %	25 %	50 %	532457276
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16118	NC_022116	G	6	6	619925	619930	0 %	0 %	100 %	0 %	532457276
16119	NC_022116	GCCC	2	8	619945	619952	0 %	0 %	25 %	75 %	532457276
16120	NC_022116	CTG	2	6	620024	620029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457276
16121	NC_022116	CTG	2	6	620060	620065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457276
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16236	NC_022116	CCGG	2	8	624578	624585	0 %	0 %	50 %	50 %	532457282
16237	NC_022116	CTT	2	6	624646	624651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532457282
16238	NC_022116	GCT	2	6	624720	624725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16239	NC_022116	CTG	2	6	624730	624735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16240	NC_022116	CGG	2	6	624753	624758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457283
16241	NC_022116	GTC	2	6	624802	624807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16242	NC_022116	TCG	2	6	624881	624886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16243	NC_022116	TCG	2	6	624902	624907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16244	NC_022116	TGC	2	6	625142	625147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16245	NC_022116	GCA	2	6	625287	625292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457283
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16247	NC_022116	CGA	2	6	625395	625400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457283
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16250	NC_022116	TCG	2	6	625496	625501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16251	NC_022116	CTG	2	6	625525	625530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
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16253	NC_022116	ATC	2	6	625648	625653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532457283
16254	NC_022116	CG	4	8	625658	625665	0 %	0 %	50 %	50 %	532457283
16255	NC_022116	CGA	2	6	625698	625703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16256	NC_022116	GCT	2	6	625718	625723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
16257	NC_022116	GCC	2	6	625761	625766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457283
16258	NC_022116	CGGC	2	8	625856	625863	0 %	0 %	50 %	50 %	532457283
16259	NC_022116	CGG	2	6	625866	625871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457283
16260	NC_022116	GGT	2	6	625876	625881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532457283
16261	NC_022116	CGG	2	6	625898	625903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457283
16262	NC_022116	GCT	2	6	625977	625982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457283
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16264	NC_022116	GTC	2	6	626067	626072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457284
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16266	NC_022116	ACC	2	6	626121	626126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532457284
16267	NC_022116	CG	3	6	626144	626149	0 %	0 %	50 %	50 %	532457284
16268	NC_022116	CGACG	2	10	626156	626165	20 %	0 %	40 %	40 %	532457284
16269	NC_022116	CTG	3	9	626166	626174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457284
16270	NC_022116	ACG	3	9	626179	626187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457284
16271	NC_022116	TCG	2	6	626233	626238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457284
16272	NC_022116	GCCG	2	8	626274	626281	0 %	0 %	50 %	50 %	532457284
16273	NC_022116	GCCG	2	8	626288	626295	0 %	0 %	50 %	50 %	532457284
16274	NC_022116	CGA	2	6	626360	626365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457284
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16276	NC_022116	CGG	2	6	626390	626395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457284
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16298	NC_022116	GATCAA	2	12	627334	627345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532457285
16299	NC_022116	CG	3	6	627420	627425	0 %	0 %	50 %	50 %	532457285
16300	NC_022116	ACG	2	6	627444	627449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457285
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16305	NC_022116	CG	3	6	627609	627614	0 %	0 %	50 %	50 %	532457285
16306	NC_022116	CAG	2	6	627617	627622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457285
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16329	NC_022116	CACGA	2	10	628567	628576	40 %	0 %	20 %	40 %	532457286
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16336	NC_022116	GCTC	2	8	628886	628893	0 %	25 %	25 %	50 %	532457286
16337	NC_022116	CGGCG	2	10	628950	628959	0 %	0 %	60 %	40 %	532457286
16338	NC_022116	GCC	2	6	629001	629006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457286
16339	NC_022116	TGA	2	6	629012	629017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532457286
16340	NC_022116	GCT	2	6	629025	629030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457286
16341	NC_022116	GCA	2	6	629042	629047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457286
16342	NC_022116	CCGT	2	8	629119	629126	0 %	25 %	25 %	50 %	532457286
16343	NC_022116	GCC	2	6	629163	629168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457286
16344	NC_022116	GCTGCC	2	12	629169	629180	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532457286
16345	NC_022116	GAA	2	6	629213	629218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532457286
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16347	NC_022116	CGA	2	6	629396	629401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457287
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16349	NC_022116	CTG	2	6	629667	629672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457287
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16351	NC_022116	CAA	2	6	629720	629725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532457287
16352	NC_022116	GAA	2	6	629807	629812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532457287
16353	NC_022116	CTC	2	6	629846	629851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532457287
16354	NC_022116	AGC	3	9	629923	629931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457287
16355	NC_022116	TGC	2	6	629950	629955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457287
16356	NC_022116	TCG	2	6	630016	630021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457287
16357	NC_022116	CTG	2	6	630099	630104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457287
16358	NC_022116	ACT	2	6	630148	630153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532457287
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16360	NC_022116	CGT	2	6	630191	630196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457287
16361	NC_022116	GGCC	2	8	630248	630255	0 %	0 %	50 %	50 %	532457287
16362	NC_022116	CGG	2	6	630260	630265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457287
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16366	NC_022116	CCG	2	6	630391	630396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532457288
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16373	NC_022116	CGG	2	6	630690	630695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457288
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16377	NC_022116	CTCG	2	8	630823	630830	0 %	25 %	25 %	50 %	532457288
16378	NC_022116	GTC	2	6	630863	630868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457288
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16381	NC_022116	GCT	2	6	630916	630921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457288
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16384	NC_022116	GCA	2	6	630952	630957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457288
16385	NC_022116	GCT	2	6	630979	630984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532457288
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16423	NC_022116	GACG	2	8	632367	632374	25 %	0 %	50 %	25 %	532457290
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16472	NC_022116	CGG	2	6	633821	633826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532457291
16473	NC_022116	CGA	2	6	633880	633885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532457291
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16499	NC_022116	TTCTCC	2	12	635098	635109	0 %	50 %	0 %	50 %	532457292
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