MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021881	TGC	2	6	1274131	1274136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464634
19002	NC_021881	A	6	6	1274168	1274173	100 %	0 %	0 %	0 %	526464634
19003	NC_021881	GATA	2	8	1274254	1274261	50 %	25 %	25 %	0 %	526464634
19004	NC_021881	CGAAGC	2	12	1274267	1274278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464634
19005	NC_021881	AGTA	2	8	1274319	1274326	50 %	25 %	25 %	0 %	526464634
19006	NC_021881	TTTCA	2	10	1274348	1274357	20 %	60 %	0 %	20 %	526464634
19007	NC_021881	CTGA	2	8	1274381	1274388	25 %	25 %	25 %	25 %	526464634
19008	NC_021881	TGT	2	6	1274450	1274455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464634
19009	NC_021881	GTAGA	2	10	1274567	1274576	40 %	20 %	40 %	0 %	526464634
19010	NC_021881	ACA	2	6	1274592	1274597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464634
19011	NC_021881	A	6	6	1274603	1274608	100 %	0 %	0 %	0 %	526464634
19012	NC_021881	A	7	7	1274624	1274630	100 %	0 %	0 %	0 %	526464634
19013	NC_021881	AGTAC	2	10	1274706	1274715	40 %	20 %	20 %	20 %	526464634
19014	NC_021881	A	6	6	1274744	1274749	100 %	0 %	0 %	0 %	526464634
19015	NC_021881	AGA	2	6	1274786	1274791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464634
19016	NC_021881	CAAT	2	8	1274905	1274912	50 %	25 %	0 %	25 %	526464634
19017	NC_021881	TTG	2	6	1275562	1275567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464635
19018	NC_021881	TA	3	6	1275613	1275618	50 %	50 %	0 %	0 %	526464635
19019	NC_021881	GCT	2	6	1275648	1275653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464635
19020	NC_021881	TTC	2	6	1275682	1275687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464635
19021	NC_021881	TAA	2	6	1275830	1275835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464635
19022	NC_021881	TCA	2	6	1275836	1275841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464635
19023	NC_021881	AGC	2	6	1275885	1275890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464635
19024	NC_021881	GAT	2	6	1275942	1275947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464635
19025	NC_021881	AGC	2	6	1276014	1276019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464635
19026	NC_021881	TA	3	6	1276046	1276051	50 %	50 %	0 %	0 %	526464635
19027	NC_021881	A	6	6	1276078	1276083	100 %	0 %	0 %	0 %	526464635
19028	NC_021881	CT	3	6	1276809	1276814	0 %	50 %	0 %	50 %	526464636
19029	NC_021881	CGC	2	6	1276867	1276872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464636
19030	NC_021881	CAG	2	6	1276929	1276934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464636
19031	NC_021881	A	6	6	1276966	1276971	100 %	0 %	0 %	0 %	526464636
19032	NC_021881	TGCCC	2	10	1277051	1277060	0 %	20 %	20 %	60 %	526464636
19033	NC_021881	CGTA	2	8	1277108	1277115	25 %	25 %	25 %	25 %	526464636
19034	NC_021881	AC	3	6	1277119	1277124	50 %	0 %	0 %	50 %	526464636
19035	NC_021881	CAAA	2	8	1277133	1277140	75 %	0 %	0 %	25 %	526464636
19036	NC_021881	CAA	2	6	1277230	1277235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464636
19037	NC_021881	CCA	2	6	1277237	1277242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464636
19038	NC_021881	TTC	3	9	1277306	1277314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464636
19039	NC_021881	TATC	2	8	1277325	1277332	25 %	50 %	0 %	25 %	526464636
19040	NC_021881	CAT	2	6	1277337	1277342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19041	NC_021881	CTA	2	6	1277355	1277360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19042	NC_021881	TAT	2	6	1277425	1277430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464636
19043	NC_021881	ACT	2	6	1277440	1277445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19044	NC_021881	ATT	2	6	1277596	1277601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464636
19045	NC_021881	CA	3	6	1277659	1277664	50 %	0 %	0 %	50 %	526464636
19046	NC_021881	CTT	2	6	1277716	1277721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464636
19047	NC_021881	CA	3	6	1277766	1277771	50 %	0 %	0 %	50 %	526464636
19048	NC_021881	CAT	2	6	1277793	1277798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19049	NC_021881	AGC	2	6	1277800	1277805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464636
19050	NC_021881	AGC	2	6	1277824	1277829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464636
19051	NC_021881	ATT	2	6	1277866	1277871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464636
19052	NC_021881	TCA	2	6	1277891	1277896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19053	NC_021881	ACA	2	6	1277915	1277920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464636
19054	NC_021881	TTC	2	6	1277936	1277941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464636
19055	NC_021881	CAC	2	6	1277964	1277969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464636
19056	NC_021881	CA	3	6	1278019	1278024	50 %	0 %	0 %	50 %	526464636
19057	NC_021881	CAC	2	6	1278046	1278051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464636
19058	NC_021881	TAT	2	6	1278063	1278068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464636
19059	NC_021881	CT	3	6	1278080	1278085	0 %	50 %	0 %	50 %	526464636
19060	NC_021881	CCT	2	6	1278087	1278092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464636
19061	NC_021881	TCA	2	6	1278170	1278175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464636
19062	NC_021881	T	6	6	1278239	1278244	0 %	100 %	0 %	0 %	526464636
19063	NC_021881	CTC	2	6	1278289	1278294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464636
19064	NC_021881	CTCC	2	8	1278297	1278304	0 %	25 %	0 %	75 %	526464636
19065	NC_021881	TATT	2	8	1278364	1278371	25 %	75 %	0 %	0 %	526464637
19066	NC_021881	CAT	2	6	1278372	1278377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464637
19067	NC_021881	TCT	2	6	1278409	1278414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464637
19068	NC_021881	AC	4	8	1278459	1278466	50 %	0 %	0 %	50 %	526464637
19069	NC_021881	CA	4	8	1278575	1278582	50 %	0 %	0 %	50 %	526464637
19070	NC_021881	AC	3	6	1278583	1278588	50 %	0 %	0 %	50 %	526464637
19071	NC_021881	ATG	2	6	1278634	1278639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464637
19072	NC_021881	A	6	6	1278663	1278668	100 %	0 %	0 %	0 %	526464637
19073	NC_021881	CCA	2	6	1278737	1278742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464637
19074	NC_021881	CG	3	6	1278834	1278839	0 %	0 %	50 %	50 %	526464638
19075	NC_021881	TTA	2	6	1278848	1278853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464638
19076	NC_021881	TGCC	2	8	1278904	1278911	0 %	25 %	25 %	50 %	526464638
19077	NC_021881	TCT	2	6	1278969	1278974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464638
19078	NC_021881	TCCTCT	2	12	1279136	1279147	0 %	50 %	0 %	50 %	526464638
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19081	NC_021881	CCA	2	6	1279230	1279235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464638
19082	NC_021881	ACAA	2	8	1279265	1279272	75 %	0 %	0 %	25 %	526464638
19083	NC_021881	A	7	7	1279325	1279331	100 %	0 %	0 %	0 %	526464638
19084	NC_021881	CTA	2	6	1279332	1279337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464638
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19087	NC_021881	CTT	2	6	1279542	1279547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464639
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19089	NC_021881	ATA	2	6	1279650	1279655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464639
19090	NC_021881	TC	3	6	1279690	1279695	0 %	50 %	0 %	50 %	526464639
19091	NC_021881	GAA	2	6	1279708	1279713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464639
19092	NC_021881	TAC	2	6	1279733	1279738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464639
19093	NC_021881	TC	3	6	1279769	1279774	0 %	50 %	0 %	50 %	526464639
19094	NC_021881	ATC	2	6	1279824	1279829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464639
19095	NC_021881	AT	3	6	1279932	1279937	50 %	50 %	0 %	0 %	526464639
19096	NC_021881	TAC	2	6	1279967	1279972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464639
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19099	NC_021881	CCT	2	6	1280015	1280020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464639
19100	NC_021881	TAA	2	6	1280027	1280032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464639
19101	NC_021881	AGC	2	6	1280040	1280045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464639
19102	NC_021881	TAT	2	6	1280054	1280059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464639
19103	NC_021881	TAA	2	6	1280077	1280082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464639
19104	NC_021881	TCAG	2	8	1280107	1280114	25 %	25 %	25 %	25 %	526464639
19105	NC_021881	GAA	2	6	1280131	1280136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464639
19106	NC_021881	TAC	2	6	1280150	1280155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464639
19107	NC_021881	ACC	2	6	1280205	1280210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464639
19108	NC_021881	TAA	2	6	1280343	1280348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464639
19109	NC_021881	TC	3	6	1280352	1280357	0 %	50 %	0 %	50 %	526464639
19110	NC_021881	AACCA	2	10	1280376	1280385	60 %	0 %	0 %	40 %	526464639
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19112	NC_021881	CAA	2	6	1280517	1280522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464639
19113	NC_021881	TCT	2	6	1280523	1280528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464639
19114	NC_021881	ACA	2	6	1280683	1280688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464639
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19116	NC_021881	TCT	2	6	1280771	1280776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464639
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19118	NC_021881	GTTA	2	8	1280823	1280830	25 %	50 %	25 %	0 %	526464639
19119	NC_021881	CAT	2	6	1280861	1280866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464639
19120	NC_021881	ACC	2	6	1280923	1280928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464639
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19231	NC_021881	CAT	2	6	1286347	1286352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465262
19232	NC_021881	TAC	2	6	1286419	1286424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465262
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19234	NC_021881	ATC	2	6	1286436	1286441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465262
19235	NC_021881	TAC	2	6	1286533	1286538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465262
19236	NC_021881	TGTC	2	8	1286557	1286564	0 %	50 %	25 %	25 %	526465262
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19345	NC_021881	GA	3	6	1292620	1292625	50 %	0 %	50 %	0 %	526465265
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19349	NC_021881	T	6	6	1292875	1292880	0 %	100 %	0 %	0 %	526465265
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