MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021881	TGC	2	6	1006701	1006706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464512
15002	NC_021881	TACAAA	2	12	1006725	1006736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526464512
15003	NC_021881	AGA	2	6	1006748	1006753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464512
15004	NC_021881	AGA	2	6	1006885	1006890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464512
15005	NC_021881	ATC	2	6	1006944	1006949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464512
15006	NC_021881	TA	3	6	1006982	1006987	50 %	50 %	0 %	0 %	526464512
15007	NC_021881	GCAT	2	8	1007020	1007027	25 %	25 %	25 %	25 %	526464512
15008	NC_021881	CTGC	2	8	1007033	1007040	0 %	25 %	25 %	50 %	526464512
15009	NC_021881	TGATA	2	10	1007057	1007066	40 %	40 %	20 %	0 %	526464512
15010	NC_021881	CAA	2	6	1007100	1007105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464512
15011	NC_021881	ATT	2	6	1007142	1007147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464512
15012	NC_021881	GCT	2	6	1007170	1007175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464512
15013	NC_021881	CAA	2	6	1007225	1007230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464512
15014	NC_021881	TTCG	2	8	1007486	1007493	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
15015	NC_021881	TAG	2	6	1007518	1007523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464513
15016	NC_021881	TA	3	6	1007534	1007539	50 %	50 %	0 %	0 %	526464513
15017	NC_021881	GC	3	6	1007565	1007570	0 %	0 %	50 %	50 %	526464513
15018	NC_021881	TG	3	6	1007604	1007609	0 %	50 %	50 %	0 %	526464513
15019	NC_021881	T	6	6	1007711	1007716	0 %	100 %	0 %	0 %	526464513
15020	NC_021881	GCGT	2	8	1007818	1007825	0 %	25 %	50 %	25 %	526464513
15021	NC_021881	GAA	2	6	1007832	1007837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464513
15022	NC_021881	TTC	2	6	1007874	1007879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464513
15023	NC_021881	TCCA	2	8	1007920	1007927	25 %	25 %	0 %	50 %	526464513
15024	NC_021881	TAG	2	6	1007976	1007981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464513
15025	NC_021881	GA	3	6	1008031	1008036	50 %	0 %	50 %	0 %	526464513
15026	NC_021881	TG	3	6	1008048	1008053	0 %	50 %	50 %	0 %	526464513
15027	NC_021881	GGA	2	6	1008102	1008107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464513
15028	NC_021881	GGGT	2	8	1008178	1008185	0 %	25 %	75 %	0 %	526464513
15029	NC_021881	A	6	6	1008212	1008217	100 %	0 %	0 %	0 %	526464513
15030	NC_021881	GCAT	2	8	1008240	1008247	25 %	25 %	25 %	25 %	526464513
15031	NC_021881	TGG	2	6	1008259	1008264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464513
15032	NC_021881	CTG	2	6	1008279	1008284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464513
15033	NC_021881	CG	3	6	1008290	1008295	0 %	0 %	50 %	50 %	526464513
15034	NC_021881	TCGT	2	8	1008297	1008304	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
15035	NC_021881	AGC	2	6	1008363	1008368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464513
15036	NC_021881	TAA	2	6	1008396	1008401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464513
15037	NC_021881	AAC	2	6	1008474	1008479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464513
15038	NC_021881	TCC	2	6	1008535	1008540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464513
15039	NC_021881	CAAGA	2	10	1008552	1008561	60 %	0 %	20 %	20 %	526464513
15040	NC_021881	CGTT	2	8	1008599	1008606	0 %	50 %	25 %	25 %	526464513
15041	NC_021881	TAGT	2	8	1008607	1008614	25 %	50 %	25 %	0 %	526464513
15042	NC_021881	TAA	2	6	1009806	1009811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465139
15043	NC_021881	ACC	2	6	1009817	1009822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465139
15044	NC_021881	AGT	2	6	1009845	1009850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465139
15045	NC_021881	TGCC	2	8	1009882	1009889	0 %	25 %	25 %	50 %	526465139
15046	NC_021881	CA	3	6	1009928	1009933	50 %	0 %	0 %	50 %	526465139
15047	NC_021881	A	7	7	1010501	1010507	100 %	0 %	0 %	0 %	526465140
15048	NC_021881	AGA	2	6	1010513	1010518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465140
15049	NC_021881	GTC	2	6	1010558	1010563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465140
15050	NC_021881	AAC	2	6	1010602	1010607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465140
15051	NC_021881	CGT	2	6	1010680	1010685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465140
15052	NC_021881	ATG	2	6	1010691	1010696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465140
15053	NC_021881	T	6	6	1010718	1010723	0 %	100 %	0 %	0 %	526465140
15054	NC_021881	CTT	2	6	1010817	1010822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465140
15055	NC_021881	GT	3	6	1010935	1010940	0 %	50 %	50 %	0 %	526465140
15056	NC_021881	TG	3	6	1010953	1010958	0 %	50 %	50 %	0 %	526465140
15057	NC_021881	TAT	2	6	1010959	1010964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465140
15058	NC_021881	TCA	2	6	1010968	1010973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465140
15059	NC_021881	ATT	2	6	1011006	1011011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526465140
15060	NC_021881	CATC	2	8	1011058	1011065	25 %	25 %	0 %	50 %	526465140
15061	NC_021881	AT	3	6	1011081	1011086	50 %	50 %	0 %	0 %	526465140
15062	NC_021881	AGC	2	6	1011125	1011130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465140
15063	NC_021881	GT	3	6	1011142	1011147	0 %	50 %	50 %	0 %	526465140
15064	NC_021881	TCT	2	6	1011163	1011168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465140
15065	NC_021881	GTT	2	6	1011179	1011184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465140
15066	NC_021881	TCT	2	6	1011224	1011229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465140
15067	NC_021881	ACA	2	6	1011279	1011284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465140
15068	NC_021881	CGTT	2	8	1011304	1011311	0 %	50 %	25 %	25 %	526465140
15069	NC_021881	TCT	2	6	1011313	1011318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465140
15070	NC_021881	ACC	2	6	1011367	1011372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465140
15071	NC_021881	GAG	2	6	1011400	1011405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465140
15072	NC_021881	ATA	2	6	1011430	1011435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465140
15073	NC_021881	GTT	2	6	1011469	1011474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465140
15074	NC_021881	GTG	2	6	1011475	1011480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526465140
15075	NC_021881	AGT	2	6	1011615	1011620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465140
15076	NC_021881	CAA	2	6	1011630	1011635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465140
15077	NC_021881	AGAGC	2	10	1012090	1012099	40 %	0 %	40 %	20 %	526465141
15078	NC_021881	AG	3	6	1012124	1012129	50 %	0 %	50 %	0 %	526465141
15079	NC_021881	GAA	2	6	1012163	1012168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465141
15080	NC_021881	GTT	2	6	1012178	1012183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465141
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15082	NC_021881	TAAC	2	8	1012596	1012603	50 %	25 %	0 %	25 %	526465142
15083	NC_021881	GAA	2	6	1012652	1012657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465142
15084	NC_021881	A	6	6	1012656	1012661	100 %	0 %	0 %	0 %	526465142
15085	NC_021881	TAG	2	6	1012665	1012670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465142
15086	NC_021881	G	8	8	1012697	1012704	0 %	0 %	100 %	0 %	526465142
15087	NC_021881	TTG	2	6	1012707	1012712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465142
15088	NC_021881	TAG	2	6	1013228	1013233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465143
15089	NC_021881	TGA	2	6	1013244	1013249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465143
15090	NC_021881	A	6	6	1013249	1013254	100 %	0 %	0 %	0 %	526465143
15091	NC_021881	ATA	2	6	1013257	1013262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465143
15092	NC_021881	GGT	2	6	1013290	1013295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526465143
15093	NC_021881	TCT	2	6	1013320	1013325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465143
15094	NC_021881	AGA	2	6	1013384	1013389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465143
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15096	NC_021881	ATTC	2	8	1014017	1014024	25 %	50 %	0 %	25 %	526465144
15097	NC_021881	CTG	2	6	1014386	1014391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465145
15098	NC_021881	ACAA	2	8	1014395	1014402	75 %	0 %	0 %	25 %	526465145
15099	NC_021881	CA	3	6	1014412	1014417	50 %	0 %	0 %	50 %	526465145
15100	NC_021881	AGA	2	6	1014424	1014429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465145
15101	NC_021881	CAG	2	6	1014435	1014440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465145
15102	NC_021881	CT	3	6	1014502	1014507	0 %	50 %	0 %	50 %	526465145
15103	NC_021881	CA	4	8	1014522	1014529	50 %	0 %	0 %	50 %	526465145
15104	NC_021881	CTG	2	6	1015007	1015012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465146
15105	NC_021881	ACAA	2	8	1015016	1015023	75 %	0 %	0 %	25 %	526465146
15106	NC_021881	CA	3	6	1015033	1015038	50 %	0 %	0 %	50 %	526465146
15107	NC_021881	AGA	2	6	1015045	1015050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465146
15108	NC_021881	CAG	2	6	1015056	1015061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465146
15109	NC_021881	CT	3	6	1015123	1015128	0 %	50 %	0 %	50 %	526465146
15110	NC_021881	CA	4	8	1015143	1015150	50 %	0 %	0 %	50 %	526465146
15111	NC_021881	TC	3	6	1015390	1015395	0 %	50 %	0 %	50 %	526464514
15112	NC_021881	TTA	2	6	1015420	1015425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464514
15113	NC_021881	TAAC	2	8	1015497	1015504	50 %	25 %	0 %	25 %	526464514
15114	NC_021881	CAT	2	6	1015555	1015560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464514
15115	NC_021881	CTA	2	6	1015797	1015802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464514
15116	NC_021881	TAA	2	6	1015864	1015869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464514
15117	NC_021881	ATA	2	6	1015896	1015901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464514
15118	NC_021881	TGA	2	6	1015946	1015951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464514
15119	NC_021881	ATC	2	6	1015974	1015979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464514
15120	NC_021881	TCG	2	6	1015992	1015997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464514
15121	NC_021881	CAC	2	6	1016107	1016112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464514
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15132	NC_021881	ATC	2	6	1016636	1016641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464514
15133	NC_021881	CTG	2	6	1016674	1016679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464514
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15141	NC_021881	CTT	2	6	1016917	1016922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464514
15142	NC_021881	CTT	2	6	1016932	1016937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464514
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15227	NC_021881	TC	4	8	1021995	1022002	0 %	50 %	0 %	50 %	526465147
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15231	NC_021881	TTC	2	6	1022108	1022113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465147
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15233	NC_021881	CT	3	6	1022186	1022191	0 %	50 %	0 %	50 %	526465147
15234	NC_021881	TGC	2	6	1022234	1022239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526465147
15235	NC_021881	TAT	2	6	1022493	1022498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464517
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15238	NC_021881	TCT	2	6	1022537	1022542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464517
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15242	NC_021881	ACT	2	6	1022792	1022797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464517
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15351	NC_021881	GTT	3	9	1027925	1027933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464520
15352	NC_021881	ATCT	2	8	1027958	1027965	25 %	50 %	0 %	25 %	526464520
15353	NC_021881	CCT	2	6	1028095	1028100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464520
15354	NC_021881	CT	3	6	1028172	1028177	0 %	50 %	0 %	50 %	526464520
15355	NC_021881	ATC	2	6	1028258	1028263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464520
15356	NC_021881	CTC	2	6	1028345	1028350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464520
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15457	NC_021881	TAG	2	6	1035037	1035042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464525
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15461	NC_021881	ACT	2	6	1035227	1035232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464525
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15463	NC_021881	ATA	2	6	1035309	1035314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464525
15464	NC_021881	AT	3	6	1035321	1035326	50 %	50 %	0 %	0 %	526464525
15465	NC_021881	AGC	2	6	1035373	1035378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464525
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15468	NC_021881	ATC	2	6	1035660	1035665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464526
15469	NC_021881	CTC	2	6	1035744	1035749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464526
15470	NC_021881	TAA	2	6	1035750	1035755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464526
15471	NC_021881	AGCT	2	8	1037580	1037587	25 %	25 %	25 %	25 %	526465152
15472	NC_021881	ATC	2	6	1037623	1037628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465152
15473	NC_021881	ACA	2	6	1037672	1037677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465152
15474	NC_021881	ACC	2	6	1037689	1037694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465152
15475	NC_021881	CTT	2	6	1037709	1037714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465152
15476	NC_021881	GCCT	2	8	1037734	1037741	0 %	25 %	25 %	50 %	526465152
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15480	NC_021881	CATT	2	8	1037859	1037866	25 %	50 %	0 %	25 %	526465152
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15483	NC_021881	T	6	6	1037952	1037957	0 %	100 %	0 %	0 %	526465152
15484	NC_021881	TCC	2	6	1038041	1038046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526465152
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15488	NC_021881	CAA	2	6	1038223	1038228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465153
15489	NC_021881	CTA	2	6	1038265	1038270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465153
15490	NC_021881	T	6	6	1038274	1038279	0 %	100 %	0 %	0 %	526465153
15491	NC_021881	CTA	2	6	1038298	1038303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465153
15492	NC_021881	CTT	2	6	1038338	1038343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465153
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15497	NC_021881	ACT	2	6	1038554	1038559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465153
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15499	NC_021881	AAC	2	6	1038698	1038703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465153
15500	NC_021881	TAG	2	6	1038725	1038730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465153

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