MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021881	ATG	2	6	657915	657920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464429
10002	NC_021881	TTC	2	6	657953	657958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464429
10003	NC_021881	AGA	2	6	657980	657985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464429
10004	NC_021881	CAA	2	6	658007	658012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464429
10005	NC_021881	TAA	2	6	658013	658018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464429
10006	NC_021881	ATCTC	2	10	658039	658048	20 %	40 %	0 %	40 %	526464429
10007	NC_021881	TA	3	6	658074	658079	50 %	50 %	0 %	0 %	526464429
10008	NC_021881	GCA	2	6	658094	658099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464429
10009	NC_021881	A	7	7	658137	658143	100 %	0 %	0 %	0 %	526464429
10010	NC_021881	AAT	2	6	658227	658232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464429
10011	NC_021881	AAT	2	6	658331	658336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464429
10012	NC_021881	CAT	2	6	658365	658370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464429
10013	NC_021881	CTA	2	6	658538	658543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464968
10014	NC_021881	AT	4	8	658548	658555	50 %	50 %	0 %	0 %	526464968
10015	NC_021881	CAA	2	6	658566	658571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464968
10016	NC_021881	TA	3	6	658607	658612	50 %	50 %	0 %	0 %	526464968
10017	NC_021881	GAA	2	6	658613	658618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464968
10018	NC_021881	GAG	2	6	658685	658690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464968
10019	NC_021881	TGTA	2	8	658720	658727	25 %	50 %	25 %	0 %	526464968
10020	NC_021881	GTAT	2	8	658753	658760	25 %	50 %	25 %	0 %	526464968
10021	NC_021881	TA	3	6	658766	658771	50 %	50 %	0 %	0 %	526464968
10022	NC_021881	TCAA	2	8	658807	658814	50 %	25 %	0 %	25 %	526464968
10023	NC_021881	TAA	2	6	658833	658838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464968
10024	NC_021881	TAG	2	6	658843	658848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464968
10025	NC_021881	GAAT	2	8	658862	658869	50 %	25 %	25 %	0 %	526464968
10026	NC_021881	GATG	3	12	658956	658967	25 %	25 %	50 %	0 %	526464969
10027	NC_021881	AG	3	6	658976	658981	50 %	0 %	50 %	0 %	526464969
10028	NC_021881	TAG	2	6	659020	659025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464969
10029	NC_021881	CGTTCT	2	12	659028	659039	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526464969
10030	NC_021881	TAT	2	6	659075	659080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464969
10031	NC_021881	AACGA	2	10	659103	659112	60 %	0 %	20 %	20 %	526464969
10032	NC_021881	AG	3	6	659177	659182	50 %	0 %	50 %	0 %	526464969
10033	NC_021881	TAC	2	6	659186	659191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464969
10034	NC_021881	T	6	6	659219	659224	0 %	100 %	0 %	0 %	526464969
10035	NC_021881	AGA	2	6	660199	660204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464970
10036	NC_021881	AGG	2	6	660274	660279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464970
10037	NC_021881	TTC	2	6	663260	663265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464971
10038	NC_021881	AGA	2	6	663280	663285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464971
10039	NC_021881	GAC	2	6	663299	663304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464971
10040	NC_021881	T	7	7	663311	663317	0 %	100 %	0 %	0 %	526464971
10041	NC_021881	TAC	2	6	663371	663376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464971
10042	NC_021881	ATA	2	6	663382	663387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464971
10043	NC_021881	AAG	2	6	663393	663398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464971
10044	NC_021881	CAG	2	6	663402	663407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464971
10045	NC_021881	AGA	2	6	663498	663503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464971
10046	NC_021881	TGC	2	6	663592	663597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464971
10047	NC_021881	TAG	2	6	663626	663631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464971
10048	NC_021881	TTG	2	6	663660	663665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464971
10049	NC_021881	T	7	7	663680	663686	0 %	100 %	0 %	0 %	526464971
10050	NC_021881	TTCTT	2	10	663734	663743	0 %	80 %	0 %	20 %	526464971
10051	NC_021881	TGC	2	6	663757	663762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464971
10052	NC_021881	GTA	2	6	663815	663820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464971
10053	NC_021881	AG	3	6	663832	663837	50 %	0 %	50 %	0 %	526464971
10054	NC_021881	GCT	2	6	663843	663848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464971
10055	NC_021881	AGA	3	9	665727	665735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464972
10056	NC_021881	TGA	2	6	665819	665824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464972
10057	NC_021881	AC	3	6	665870	665875	50 %	0 %	0 %	50 %	526464972
10058	NC_021881	TCT	2	6	665882	665887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464972
10059	NC_021881	T	6	6	665898	665903	0 %	100 %	0 %	0 %	526464972
10060	NC_021881	ATA	2	6	665980	665985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464430
10061	NC_021881	TA	3	6	666008	666013	50 %	50 %	0 %	0 %	526464430
10062	NC_021881	CAT	2	6	666040	666045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464430
10063	NC_021881	AGA	2	6	666077	666082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464430
10064	NC_021881	GCT	2	6	666117	666122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464430
10065	NC_021881	GA	3	6	666321	666326	50 %	0 %	50 %	0 %	526464430
10066	NC_021881	TAT	2	6	666352	666357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464430
10067	NC_021881	ATA	2	6	666364	666369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464430
10068	NC_021881	ATG	2	6	666734	666739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464973
10069	NC_021881	TA	3	6	666799	666804	50 %	50 %	0 %	0 %	526464973
10070	NC_021881	T	6	6	666810	666815	0 %	100 %	0 %	0 %	526464973
10071	NC_021881	AGT	2	6	666877	666882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464973
10072	NC_021881	CGAG	2	8	666896	666903	25 %	0 %	50 %	25 %	526464973
10073	NC_021881	TAT	2	6	668189	668194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464974
10074	NC_021881	TGG	2	6	668201	668206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464974
10075	NC_021881	GAG	2	6	668228	668233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464974
10076	NC_021881	AAGA	2	8	668273	668280	75 %	0 %	25 %	0 %	526464974
10077	NC_021881	TGC	3	9	668303	668311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464974
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10079	NC_021881	GAA	2	6	668352	668357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464974
10080	NC_021881	CGT	2	6	668375	668380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464974
10081	NC_021881	ATGTA	2	10	668822	668831	40 %	40 %	20 %	0 %	526464431
10082	NC_021881	CAT	2	6	668854	668859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464431
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10086	NC_021881	CAT	2	6	669204	669209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
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10088	NC_021881	ATC	2	6	669346	669351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
10089	NC_021881	TTC	2	6	669422	669427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464432
10090	NC_021881	A	6	6	669429	669434	100 %	0 %	0 %	0 %	526464432
10091	NC_021881	ACAG	2	8	669464	669471	50 %	0 %	25 %	25 %	526464432
10092	NC_021881	CAT	3	9	669489	669497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
10093	NC_021881	CATT	2	8	669600	669607	25 %	50 %	0 %	25 %	526464432
10094	NC_021881	ATC	2	6	669622	669627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
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10096	NC_021881	T	6	6	669696	669701	0 %	100 %	0 %	0 %	526464432
10097	NC_021881	ATC	2	6	669712	669717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
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10100	NC_021881	TAG	2	6	669794	669799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464432
10101	NC_021881	ATTC	2	8	669895	669902	25 %	50 %	0 %	25 %	526464432
10102	NC_021881	CAT	2	6	669936	669941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464432
10103	NC_021881	CATC	2	8	669984	669991	25 %	25 %	0 %	50 %	526464432
10104	NC_021881	CT	3	6	670000	670005	0 %	50 %	0 %	50 %	526464432
10105	NC_021881	AAC	2	6	670120	670125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464432
10106	NC_021881	GCC	2	6	670159	670164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464432
10107	NC_021881	TAG	2	6	670242	670247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464432
10108	NC_021881	ATTT	2	8	670276	670283	25 %	75 %	0 %	0 %	526464432
10109	NC_021881	GAT	2	6	670291	670296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464432
10110	NC_021881	AAT	2	6	671260	671265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464433
10111	NC_021881	AG	3	6	671275	671280	50 %	0 %	50 %	0 %	526464433
10112	NC_021881	TAT	2	6	671422	671427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464433
10113	NC_021881	CAT	2	6	671430	671435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464433
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10115	NC_021881	CCAT	2	8	671539	671546	25 %	25 %	0 %	50 %	526464433
10116	NC_021881	CTA	2	6	671588	671593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464433
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10118	NC_021881	ATG	2	6	671632	671637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464433
10119	NC_021881	GCAT	2	8	671723	671730	25 %	25 %	25 %	25 %	526464433
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10478	NC_021881	TGTC	2	8	695466	695473	0 %	50 %	25 %	25 %	526464442
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10480	NC_021881	GTC	2	6	695524	695529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464442
10481	NC_021881	TGCG	2	8	695538	695545	0 %	25 %	50 %	25 %	526464442
10482	NC_021881	ATC	2	6	695639	695644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464442
10483	NC_021881	AGTA	2	8	695733	695740	50 %	25 %	25 %	0 %	526464442
10484	NC_021881	CTC	2	6	695787	695792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464443
10485	NC_021881	GAT	2	6	695816	695821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464443
10486	NC_021881	TGG	2	6	695841	695846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464443
10487	NC_021881	TGA	2	6	695868	695873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464443
10488	NC_021881	AGC	2	6	695941	695946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464443
10489	NC_021881	AGC	2	6	695950	695955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464443
10490	NC_021881	GAA	2	6	696013	696018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464443
10491	NC_021881	TCC	2	6	696046	696051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464443
10492	NC_021881	GCT	2	6	696095	696100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464443
10493	NC_021881	AAG	2	6	696123	696128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464443
10494	NC_021881	ATA	2	6	696148	696153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464444
10495	NC_021881	GAT	2	6	696171	696176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464444
10496	NC_021881	TGT	2	6	696194	696199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464444
10497	NC_021881	TGCT	2	8	696238	696245	0 %	50 %	25 %	25 %	526464444
10498	NC_021881	ATG	2	6	696334	696339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464444
10499	NC_021881	TGA	2	6	696374	696379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464444
10500	NC_021881	ATG	2	6	696414	696419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464444

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